| 致谢 | 第1-8页 |
| 摘要 | 第8-10页 |
| Abstract | 第10-17页 |
| 1 文献综述 | 第17-29页 |
| ·Solanum section Petota的系统发育研究进展 | 第17-22页 |
| ·Solanum sect.Petota的组成和分类 | 第17-18页 |
| ·Solanum sect.Petota的起源 | 第18页 |
| ·Solanum sect.Petota的系统发育研究 | 第18-20页 |
| ·Solanum sect.Petota中野生多倍体的系统发育研究 | 第20-22页 |
| ·Solanum sect.Petota中野生多倍体的基因组组成 | 第22页 |
| ·COSⅡ标记的研究进展 | 第22-25页 |
| ·直系同源基因和旁系同源基因 | 第23-24页 |
| ·COSⅡ标记的开发 | 第24页 |
| ·COSⅡ标记的应用 | 第24-25页 |
| ·非对称PCR-SSCP技术 | 第25-27页 |
| ·SSCP技术 | 第25-26页 |
| ·等位基因的协同移动以及单链DNA的稳定构象 | 第26页 |
| ·SSCP等位基因数目 | 第26页 |
| ·非对称PCR | 第26-27页 |
| ·PCR过程中引起的序列重组 | 第27页 |
| ·异源双链核酸分子 | 第27页 |
| ·研究目的和意义 | 第27-29页 |
| 2 非对称PCR-SSCP技术体系的建立及应用 | 第29-46页 |
| ·前言 | 第29页 |
| ·材料和方法 | 第29-35页 |
| ·植物材料和DNA的提取 | 第29-30页 |
| ·PCR扩增,SSCP操作步骤,再次扩增,克隆和测序 | 第30-32页 |
| ·用于和SSCP比较的直接克隆测序 | 第32-33页 |
| ·SSCP条带的克隆 | 第33页 |
| ·优化体系时采用的其它操作方法 | 第33页 |
| ·SSCP最佳条件的检测 | 第33-34页 |
| ·优化的SSCP方法在多倍体物种中的检测 | 第34-35页 |
| ·结果 | 第35-37页 |
| ·SSCP最佳方法条件的确立 | 第35-36页 |
| ·优化的SSCP方法在多倍体物种中的检测结果 | 第36-37页 |
| ·讨论 | 第37-46页 |
| ·纯化的和非纯化的PCR产物比较 | 第38页 |
| ·不同上样缓冲液和稀释比例的比较 | 第38页 |
| ·对称PCR和非对称PCR的比较 | 第38页 |
| ·MDE胶上的SSCP电泳条件 | 第38页 |
| ·PAGE胶上的SSCP电泳条件 | 第38-39页 |
| ·SSCP方法中缓冲液的确定 | 第39页 |
| ·16个马铃薯多倍体物种中SSCP体系的建立 | 第39页 |
| ·成本比较 | 第39-46页 |
| 3 基于COSⅡ标记的野生多倍体马铃薯的系统发育关系 | 第46-78页 |
| ·材料和方法 | 第46-54页 |
| ·植物材料的准备 | 第46-53页 |
| ·DNA的提取、扩增、SSCP测序和克隆 | 第53页 |
| ·序列编辑和联配以及模型的选择 | 第53页 |
| ·最大简约法、最大似然法和贝叶斯法的系统发育分析 | 第53-54页 |
| ·等位基因的选择 | 第54页 |
| ·联合数据分析 | 第54页 |
| ·结果 | 第54-64页 |
| ·序列比对以及多样性 | 第54-55页 |
| ·模型选择 | 第55页 |
| ·系统发育分析方法的选择 | 第55页 |
| ·单个基因的系统发育分析 | 第55-58页 |
| ·二倍体物种的系统发育分析 | 第58-59页 |
| ·所有物种(二倍体和多倍体)的系统发育结果 | 第59-64页 |
| ·讨论 | 第64-76页 |
| ·多起源 | 第64页 |
| ·等位基因丢失 | 第64-65页 |
| ·多倍体等位基因在起源不明的新分枝中 | 第65页 |
| ·二倍体和多倍体的亲缘关系研究 | 第65-66页 |
| ·Solanum sect.Petota在分类学上的应用 | 第66-76页 |
| 4 小结与展望 | 第76-78页 |
| 参考文献 | 第78-88页 |
| 5 附录 | 第88-90页 |
| 作者在学期间所取得的科研成果 | 第90-91页 |
