| 致谢 | 第1-4页 |
| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5-9页 |
| 前言 | 第9-10页 |
| 第一章 文献综述 | 第10-26页 |
| 1 黄杨属及珍珠黄杨研究进展 | 第10-12页 |
| ·黄杨科及黄杨属概况 | 第10-11页 |
| ·珍珠黄杨的生物学特性及生态学研究 | 第11页 |
| ·黄杨属及珍珠黄杨的研究概况 | 第11-12页 |
| 2 植物分子系统学研究 | 第12-21页 |
| ·分子系统学定义及其发展 | 第12-13页 |
| ·分子系统学的研究方法及分子标记技术 | 第13-14页 |
| ·分子系统学的研究方法 | 第13-14页 |
| ·分子标记技术 | 第14页 |
| ·分子系统学研究中常用的基因片段 | 第14-17页 |
| ·分子系统学研究中基因片段选择依据 | 第14-15页 |
| ·用于分子系统学研究的主要基因种类 | 第15-17页 |
| ·分子系统学研究中存在的问题 | 第17-18页 |
| ·分子系统学数据分析以及系统进化树重建 | 第18-21页 |
| ·分子进化的基本概念 | 第18-19页 |
| ·同源性与同源性状 | 第18-19页 |
| ·类群 | 第19页 |
| ·原始数据处理 | 第19-20页 |
| ·系统发育树重建 | 第20-21页 |
| ·距离法 | 第20页 |
| ·最大简约法 | 第20-21页 |
| ·最大似然法 | 第21页 |
| ·基因树精确性的统计检验 | 第21页 |
| 3 内转录间隔区（ITS）研究概况 | 第21-25页 |
| ·ITS 区的结构特点 | 第21-22页 |
| ·ITS 区的重要性 | 第22页 |
| ·ITS 序列在科、亚科、族内系统进化研究中的应用 | 第22-25页 |
| ·ITS 序列在属及属下系统学研究中的应用 | 第23页 |
| ·ITS 序列在种及种内系统进化研究中的应用 | 第23-24页 |
| ·ITS 序列在杂交和多倍化研究中的应用 | 第24-25页 |
| 4 研究目的及意义 | 第25-26页 |
| 第二章 珍珠黄杨基因组DNA 提取 | 第26-30页 |
| 1 材料与方法 | 第26-28页 |
| ·供试材料与试剂、溶液及仪器 | 第26页 |
| ·样品采集及处理 | 第26页 |
| ·DNA 提取、纯化系列试剂及溶液 | 第26页 |
| ·DNA 提取、纯化及检测 | 第26-28页 |
| ·DNA 提取 | 第26-27页 |
| ·DNA 纯化 | 第27页 |
| ·基因组DNA 的检测 | 第27-28页 |
| 2 结果与分析 | 第28-29页 |
| 3 讨论 | 第29-30页 |
| 第三章 珍珠黄杨ITS-PCR 体系的建立与优化 | 第30-37页 |
| 1 材料与方法 | 第30-32页 |
| ·供试材料与试剂、溶液及仪器 | 第30页 |
| ·PCR 反应系列试剂 | 第30页 |
| ·电泳系列试剂 | 第30页 |
| ·ITS-PCR 引物 | 第30页 |
| ·PCR 反应因素水平的确定与正交表的设计 | 第30-31页 |
| ·琼脂糖凝胶电泳检测PCR 产物 | 第31-32页 |
| 2 结果与分析 | 第32-35页 |
| ·电泳结果评分 | 第32页 |
| ·因素内各水平对PCR 结果的影响 | 第32-34页 |
| ·Mg~(2+)浓度对 PCR 结果的影响 | 第32-33页 |
| ·引物浓度对PCR 结果的影响 | 第33页 |
| ·dNTPs 浓度对PCR 结果的影响 | 第33-34页 |
| ·模板DNA 浓度对PCR 结果的影响 | 第34页 |
| ·PCR 退火温度选择 | 第34-35页 |
| ·优化条件组合的的珍珠黄杨 ITS-PCR | 第35页 |
| 3 结论与讨论 | 第35-37页 |
| ·结论 | 第35-36页 |
| ·讨论 | 第36-37页 |
| 第四章 大花黄杨和珍珠黄杨ITS 序列PCR 产物直接测序与克隆测序比较分析 | 第37-53页 |
| 1 材料与方法 | 第37-38页 |
| ·供试材料与克隆用系列试剂、溶液 | 第37-38页 |
| ·样品采集及处理 | 第37页 |
| ·克隆用系列试剂及溶液 | 第37页 |
| ·感受态细胞的制备 | 第37-38页 |
| ·试验方法 | 第38页 |
| ·目的片段的直接测序 | 第38页 |
| ·目的片段的克隆、鉴定及测序 | 第38页 |
| 2 结果与分析 | 第38-50页 |
| ·克隆及测序结果 | 第38-42页 |
| ·大花黄杨ITS-PCR 扩增结果 | 第38-39页 |
| ·大花黄杨ITS-PCR 产物纯化结果 | 第39页 |
| ·大花黄杨ITS 片段克隆鉴定 | 第39-40页 |
| ·大花黄杨测序结果 | 第40-42页 |
| ·大花黄杨直接测序结果 | 第40-42页 |
| ·大花黄杨克隆测序结果 | 第42页 |
| ·直接测序与克隆测序结果分析比较 | 第42-50页 |
| ·序列拼接 | 第42-43页 |
| ·序列比对及分析 | 第43-50页 |
| ·大花黄杨ITS 完整序列比对及分析 | 第43-45页 |
| ·大花黄杨 ITS1 序列比对及分析 | 第45-46页 |
| ·大花黄杨 ITS2 序列比对及分析 | 第46-48页 |
| ·珍珠黄杨直接测序与克隆测序结果比对及分析 | 第48-50页 |
| 3 结论 | 第50-51页 |
| 4 讨论 | 第51-53页 |
| 第五章 用ITS 序列探讨黄杨属几种植物的系统发育关系 | 第53-65页 |
| 1 材料与方法 | 第53-54页 |
| 2 结果与分析 | 第54-59页 |
| ·ITS-PCR 结果 | 第54-56页 |
| ·ITS 序列分析结果 | 第56-59页 |
| ·ITS 序列分析 | 第56-57页 |
| ·ITS 序列的系统发育树的构建 | 第57-59页 |
| 3 结论 | 第59-64页 |
| ·关于外类群的选择 | 第59页 |
| ·ITS 序列的种内多态性 | 第59页 |
| ·黄杨属几种植物亲缘关系的探讨 | 第59-64页 |
| ·珍珠黄杨（Buxus sinica var. parvifolia）与瓜子黄杨（Buxus sinica）、锦熟黄杨（Buxus sempervirens）的关系 | 第59-64页 |
| ·珍珠黄杨和瓜子黄杨、锦熟黄杨的ITS 序列长度信息 | 第59-61页 |
| ·珍珠黄杨和瓜子黄杨、锦熟黄杨的序列变异信息 | 第61-63页 |
| ·珍珠黄杨和瓜子黄杨的关系 | 第63-64页 |
| ·日本黄杨（B. microphylla var. japonica）与 B. riparia | 第64页 |
| ·雀舌黄杨（B. bodinieri）与西班牙黄杨（B. balearica） | 第64页 |
| 4 讨论 | 第64-65页 |
| 第六章 结论与展望 | 第65-67页 |
| 1 结论 | 第65页 |
| 2 展望 | 第65-67页 |
| 参考文献 | 第67-73页 |
| 详细摘要 | 第73-75页 |
