| 摘要 | 第6-8页 |
| ABSTRACT | 第8-9页 |
| 缩略语表 | 第10-11页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-23页 |
| 1.1 CLBV的研究进展 | 第12-16页 |
| 1.1.1 CLBV的分布、危害特点及生物学特性 | 第12-13页 |
| 1.1.2 分类地位 | 第13-14页 |
| 1.1.3 CLBV的基因组序列特点 | 第14-16页 |
| 1.2 长线型病毒科病毒的分子特性和生物学特性 | 第16-20页 |
| 1.2.1 基因组结构和表达策略 | 第16-18页 |
| 1.2.2 生物学特性 | 第18-20页 |
| 1.3 第二代测序技术在植物病毒鉴定中的应用 | 第20-21页 |
| 1.3.1 Small RNA测序技术 | 第20-21页 |
| 1.3.2 RNA测序技术 | 第21页 |
| 1.4 研究目的与意义 | 第21-23页 |
| 第二章 来源于猕猴桃的CLBV的RT-PCR检测及外壳蛋白的序列分析 | 第23-32页 |
| 2.1 材料与方法 | 第23页 |
| 2.1.1 样品来源 | 第23页 |
| 2.1.2 所用试剂 | 第23页 |
| 2.2 试验方法 | 第23-27页 |
| 2.2.1 引物设计与合成 | 第23-24页 |
| 2.2.2 总RNA的提取 | 第24页 |
| 2.2.3 RT-PCR | 第24-25页 |
| 2.2.4 琼脂糖凝胶电泳 | 第25页 |
| 2.2.5 PCR扩增产物的回收 | 第25页 |
| 2.2.6 DNA片段的连接 | 第25-26页 |
| 2.2.7 大肠杆菌热击感受态细胞的制备 | 第26页 |
| 2.2.8 热击转化 | 第26页 |
| 2.2.9 重组质粒的鉴定及序列测定 | 第26-27页 |
| 2.3 结果与分析 | 第27-32页 |
| 2.3.1 RT-PCR检测 | 第27页 |
| 2.3.2 CLBV分离物的cp基因序列分析 | 第27-30页 |
| 2.3.3 小结与讨论 | 第30-32页 |
| 第三章 来源于猕猴桃的CLBV全基因组序列测定 | 第32-45页 |
| 3.1 试验材料 | 第32页 |
| 3.2 研究方法 | 第32-38页 |
| 3.2.1 sRNA测序 | 第32-33页 |
| 3.2.2 CLBV全基因组扩增 | 第33-37页 |
| 3.2.3 序列分析 | 第37-38页 |
| 3.3 结果与分析 | 第38-44页 |
| 3.3.1 sRNA分析 | 第38-39页 |
| 3.3.2 全基因组扩增及基因组结构 | 第39-42页 |
| 3.3.3 系统进化分析 | 第42页 |
| 3.3.4 来源于CLBV的sRNA分析 | 第42-44页 |
| 3.4 小结与讨论 | 第44-45页 |
| 第四章 侵染猕猴桃的长线型病毒的基因组序列分析 | 第45-63页 |
| 4.1 材料与方法 | 第45-49页 |
| 4.1.1 样品来源 | 第45-46页 |
| 4.1.2 小RNA测序和RNA测序 | 第46页 |
| 4.1.3 小RNA测序和RNA-seq数据分析 | 第46页 |
| 4.1.4 病毒的基因组扩增 | 第46-48页 |
| 4.1.5 病毒粒子观察 | 第48页 |
| 4.1.6 序列分析 | 第48页 |
| 4.1.7 特异性 RT-PCR | 第48-49页 |
| 4.2 结果与分析 | 第49-61页 |
| 4.2.1 sRNA和RNA-seq分析 | 第49-50页 |
| 4.2.2 长线型病毒基因组的测定及结构分析 | 第50-53页 |
| 4.2.3 系统进化分析 | 第53-55页 |
| 4.2.4 病毒粒子观察 | 第55页 |
| 4.2.5 vsiRNA结果分析 | 第55-57页 |
| 4.2.6 RNA测序结果分析 | 第57页 |
| 4.2.7 该病毒的RT-PCR的检测结果 | 第57-61页 |
| 4.3 小结与讨论 | 第61-63页 |
| 第五章 全文总结与展望 | 第63-65页 |
| 附录A 常用溶液配方 | 第65-66页 |
| 参考文献 | 第66-72页 |
| 附录B RT-PCR检测猕猴桃样品2种病毒结果统计 | 第72-76页 |
| 附录C 硕士期间发表的论文 | 第76-77页 |
| 致谢 | 第77页 |