| 中文摘要 | 第5-7页 |
| Abstract | 第7-8页 |
| 1 前言 | 第9-17页 |
| 1 研究背景 | 第9-10页 |
| 2 从江香猪 | 第10-11页 |
| 3 转录组学研究 | 第11-14页 |
| 4 卵巢类固醇激素在畜禽繁殖中的作用 | 第14-15页 |
| 5 差异表达形成机制 | 第15-16页 |
| 6 研究目的及意义 | 第16-17页 |
| 2 材料与方法 | 第17-37页 |
| 1 实验材料与仪器试剂 | 第17-21页 |
| 1.1 实验样本 | 第17页 |
| 1.2 实验仪器 | 第17-18页 |
| 1.3 实验试剂 | 第18-20页 |
| 1.4 主要溶液的配制 | 第20-21页 |
| 2 实验方法 | 第21-37页 |
| 2.1 卵巢DNA和RNA的提取与检测 | 第21-24页 |
| 2.2 Illumina Hiseq 2000转录组测序和生物信息学分析 | 第24-25页 |
| 2.3 差异表达基因定量引物设计与合成 | 第25-26页 |
| 2.4 cDNA的合成 | 第26-27页 |
| 2.5 PCR扩增体系与程序 | 第27-28页 |
| 2.6 目的片段的克隆与测序 | 第28-32页 |
| 2.6.1 目的片段的回收纯化 | 第28-29页 |
| 2.6.2 大肠杆菌感受态细胞的制备 | 第29-30页 |
| 2.6.3 目的DNA片段连接T载体 | 第30页 |
| 2.6.4 感受态细胞的制备 | 第30-31页 |
| 2.6.5 重组质粒转化感受态细胞 | 第31页 |
| 2.6.6 质粒DNA的提取 | 第31-32页 |
| 2.7 差异表达基因qRT-PCR群体验证与发育性变化 | 第32-33页 |
| 2.8 启动子区域克隆测序与生物信息学分析 | 第33-34页 |
| 2.9 HSD3B1基因启动子区域甲基化检测 | 第34-37页 |
| 3 结果 | 第37-80页 |
| 1 卵巢基因组DNA与RNA的提取与检测 | 第37-38页 |
| 1.1 卵巢基因组DNA的提取 | 第37页 |
| 1.2 卵巢总RNA的提取 | 第37-38页 |
| 2 GAPDH内参基因目的片段测序与标准曲线的制作 | 第38-40页 |
| 2.1 GAPDH内参基因目的片段克隆测序与分析 | 第38-39页 |
| 2.2 GAPDH内参基因荧光定量标准曲线的制作 | 第39-40页 |
| 3 SCARB1基因相对定量与启动子区域多态性分析 | 第40-44页 |
| 3.1 SCARB1基因目的片段克隆测序与分析 | 第40-41页 |
| 3.2 SCARB1基因荧光定量标准曲线的制作 | 第41-42页 |
| 3.3 SCARB1基因差异表达与发育性变化 | 第42-43页 |
| 3.4 SCARB1基因启动子区域多态性与生物信息学分析 | 第43-44页 |
| 4 LDLR基因相对定量与启动子区域多态性分析 | 第44-49页 |
| 4.1 LDLR基因目的片段克隆测序与分析 | 第44-45页 |
| 4.2 LDLR基因荧光定量标准曲线的制作 | 第45-46页 |
| 4.3 LDLR基因差异表达与发育性变化 | 第46-47页 |
| 4.4 LDLR基因启动子区域多态性与生物信息学分析 | 第47-49页 |
| 5 CYP11A1基因相对定量与启动子区域多态性分析 | 第49-54页 |
| 5.1 CYP11A1基因目的片段克隆测序与分析 | 第49-50页 |
| 5.2 CYP11A1基因荧光定量标准曲线的制作 | 第50-51页 |
| 5.3 CYP11A1基因差异表达与发育性变化 | 第51-52页 |
| 5.4 CYP11A1基因启动子区域多态性与生物信息学分析 | 第52-54页 |
| 6 CYP17A1基因相对定量与启动子区域多态性分析 | 第54-58页 |
| 6.1 CYP17A1基因目的片段克隆测序与分析 | 第54-55页 |
| 6.2 CYP17A1基因荧光定量标准曲线的制作 | 第55-56页 |
| 6.3 CYP17A1基因差异表达与发育性变化 | 第56-57页 |
| 6.4 CYP17A1基因启动子区域多态性与生物信息学分析 | 第57-58页 |
| 7 CYP19A2基因相对定量与启动子区域多态性分析 | 第58-62页 |
| 7.1 CYP19A2基因目的片段克隆测序与分析 | 第58-59页 |
| 7.2 CYP19A2基因荧光定量标准曲线的制作 | 第59-60页 |
| 7.3 CYP19A2基因差异表达与发育性变化 | 第60-61页 |
| 7.4 CYP19A2基因启动子区域多态性与生物信息学分析 | 第61-62页 |
| 8 STAR基因相对定量与启动子区域多态性分析 | 第62-67页 |
| 8.1 StAR基因目的片段克隆测序与分析 | 第62-63页 |
| 8.2 StAR基因荧光定量标准曲线的制作 | 第63-64页 |
| 8.3 StAR基因差异表达与发育性变化 | 第64-65页 |
| 8.4 StAR基因启动子区域多态性与生物信息学分析 | 第65-67页 |
| 9 AKR1C1基因相对定量与启动子区域多态性分析 | 第67-72页 |
| 9.1 AKR1C1基因目的片段克隆测序与分析 | 第67-68页 |
| 9.2 AKR1C1基因荧光定量标准曲线的制作 | 第68-69页 |
| 9.3 AKR1C1基因差异表达与发育性变化 | 第69-70页 |
| 9.4 AKR1C1基因启动子区域多态性与生物信息学分析 | 第70-72页 |
| 10 HSD3B1基因相对定量与启动子区域多态性和甲基化分析 | 第72-80页 |
| 10.1 HSD3B1基因目的片段克隆测序与分析 | 第72-73页 |
| 10.2 HSD3B1基因荧光定量标准曲线的制作 | 第73-74页 |
| 10.3 HSD3B1基因差异表达与发育性变化 | 第74-75页 |
| 10.4 HSD3B1基因启动子区域多态性与生物信息学分析 | 第75-76页 |
| 10.5 HSD3B1基因启动子区域甲基化检测 | 第76-80页 |
| 10.5.1 HSD3B1基因启动子区亚硫酸氢盐修饰BSP-PCR扩增 | 第76-77页 |
| 10.5.2 HSD3B1基因BSP-PCR扩增产物克隆测序与分析 | 第77-78页 |
| 10.5.3 HSD3B1基因BSP法得到的目的片段甲基化状态 | 第78-80页 |
| 4 讨论 | 第80-85页 |
| 1 SCARB1基因表达差异分析 | 第80-81页 |
| 2 LDLR基因表达差异分析 | 第81页 |
| 3 CYP11A1基因表达差异分析 | 第81-82页 |
| 4 CYP17A1基因表达差异分析 | 第82页 |
| 6 STAR基因表达差异分析 | 第82-83页 |
| 7 AKR1C1基因表达差异分析 | 第83-84页 |
| 8 HSD3B1基因表达差异分析 | 第84-85页 |
| 5 总结 | 第85-86页 |
| 参考文献 | 第86-91页 |
| 致谢 | 第91-92页 |
| 附录 | 第92-93页 |
| 图版 | 第93-99页 |
| 缩略词表 | 第99-100页 |
