| 摘要 | 第5-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 第1章 绪论 | 第10-16页 |
| 1.1 研究背景 | 第10-12页 |
| 1.2 本文的研究内容及面临的挑战 | 第12-13页 |
| 1.3 本文的贡献 | 第13页 |
| 1.4 本文的组织结构 | 第13-16页 |
| 第2章 背景知识与问题定义 | 第16-22页 |
| 2.1 最长公共子序列 | 第16-17页 |
| 2.2 最长公共子串 | 第17-18页 |
| 2.3 编辑距离 | 第18-19页 |
| 2.4 近似最长公共子序列查询的问题定义 | 第19-20页 |
| 2.5 本章小结 | 第20-22页 |
| 第3章 相关算法 | 第22-32页 |
| 3.1 基本动态规划算法 | 第22-23页 |
| 3.2 LCS的线性空间复杂度算法 | 第23-24页 |
| 3.3 Hunt-Szymanski算法 | 第24-26页 |
| 3.4 LCS的支配点模式算法 | 第26-29页 |
| 3.4.1 支配点方法的相关定义 | 第26-27页 |
| 3.4.2 Apostolico算法 | 第27-29页 |
| 3.5 本章小结 | 第29-32页 |
| 第4章 长序列上的最长公共子序列过滤算法 | 第32-48页 |
| 4.1 得分矩阵的设计 | 第32-34页 |
| 4.2 基本过滤算法 | 第34-36页 |
| 4.3 基本过滤算法的优化 | 第36-40页 |
| 4.3.1 扭转过滤策略 | 第36-38页 |
| 4.3.2 计数过滤策略 | 第38-40页 |
| 4.4 过滤算法的位并行实现 | 第40-44页 |
| 4.4.1 得分矩阵的变换 | 第41-42页 |
| 4.4.2 BTC_Filter算法的位并行化 | 第42-44页 |
| 4.5 验证候选集 | 第44-45页 |
| 4.6 本章小结 | 第45-48页 |
| 第5章 短序列集合上最长公共子序列过滤算法 | 第48-58页 |
| 5.1 索引结构LCSIndex | 第48-50页 |
| 5.2 基本过滤算法 | 第50-53页 |
| 5.3 过滤算法的优化 | 第53-56页 |
| 5.3.1 向右偏移控制策略 | 第53-54页 |
| 5.3.2 双向同时过滤策略 | 第54-56页 |
| 5.4 验证候选集 | 第56-57页 |
| 5.5 本章小结 | 第57-58页 |
| 第6章 实验与分析 | 第58-66页 |
| 6.1 实验设置 | 第58-59页 |
| 6.2 长序列上最长公共子序列过滤算法的实验与分析 | 第59-63页 |
| 6.2.1 过滤算法的过滤效果 | 第59-60页 |
| 6.2.2 过滤算法的运行效率 | 第60-61页 |
| 6.2.3 过滤算法的位并行化运算效率 | 第61-62页 |
| 6.2.4 长序列上的近似查询性能对比实验 | 第62-63页 |
| 6.3 短序列集合上最长公共子序列过滤算法的实验与分析 | 第63-65页 |
| 6.3.1 过滤算法的过滤效果 | 第63-64页 |
| 6.3.2 短序列集合上的近似查询性能对比实验 | 第64-65页 |
| 6.4 本章小结 | 第65-66页 |
| 第7章 总结与展望 | 第66-68页 |
| 7.1 本文总结 | 第66页 |
| 7.2 工作展望 | 第66-68页 |
| 参考文献 | 第68-72页 |
| 致谢 | 第72-74页 |
| 攻硕期间参加的项目及获奖情况 | 第74页 |