| 摘要 | 第4-5页 |
| Abstract | 第5页 |
| Chapter 1: Model Introduction | 第8-18页 |
| 1.1 Introduction | 第8页 |
| 1.2 Background of Research | 第8-11页 |
| 1.3 Problem Definition | 第11-13页 |
| 1.4 Aim and Objectives of the research | 第13-14页 |
| 1.4.1 Aim | 第13页 |
| 1.4.2 Objectives | 第13-14页 |
| 1.5 Scope of the Research | 第14-16页 |
| 1.5.1 Glycolysis and Fatty Acid Oxidation | 第14-15页 |
| 1.5.2 TCA Cycle and Ion Dynamics | 第15-16页 |
| 1.6 Significance of the study | 第16-17页 |
| 1.7 Funding for the Research | 第17页 |
| 1.8 Brief Summary | 第17-18页 |
| Chapter 2: Computational Models of Cardiac Metabolism | 第18-37页 |
| 2.1 Introduction | 第18页 |
| 2.2 Cardiac Metabolism: Computational Perspective | 第18-19页 |
| 2.3 Compartmentalization in Computational Models | 第19-20页 |
| 2.4 Linking Compartments in Computational Models | 第20-23页 |
| 2.4.1 The Glucose Transporter | 第20页 |
| 2.4.2 The Malate-Aspartate Shuttle | 第20-22页 |
| 2.4.3 The Phosphocreatine Shuttle | 第22-23页 |
| 2.4.4 The Pyruvate Transporter | 第23页 |
| 2.5 Survey of Computational Models of Cardiac Metabolism | 第23-33页 |
| 2.5.1 Models of glycolysis | 第23-27页 |
| 2.5.2 Models of Mitochondrial Energetics | 第27-29页 |
| 2.5.3 Models Integrating Glycolysis and Mitochondrial Energetics | 第29-33页 |
| 2.6 Cardiac Metabolism and Electrophysiology | 第33-35页 |
| 2.7 Cardiac Electrophysiology and Atrial Fibrillation | 第35-36页 |
| 2.8 Brief Summary | 第36-37页 |
| Chapter 3: Model Formulation and Description | 第37-47页 |
| 3.1 Introduction | 第37页 |
| 3.2 Description of Cytosolic Energetics | 第37-42页 |
| 3.2.1 Hexokinase | 第37-38页 |
| 3.2.2 Phosphoglucose Isomerase | 第38页 |
| 3.2.3 Phosphofructokinase | 第38-39页 |
| 3.2.4 Aldolase | 第39-40页 |
| 3.2.5 Triose Phosphate Isomerase | 第40页 |
| 3.2.6 Glyceraldehyde 3-Phosphate Dehydrogenase | 第40页 |
| 3.2.7 Phosphoglycerate Kinase | 第40-41页 |
| 3.2.8 Phosphoglycerate Mutase | 第41页 |
| 3.2.9 Enolase | 第41页 |
| 3.2.10 Pyruvate Kinase | 第41-42页 |
| 3.3 Description of Mitochondrial Energetics | 第42页 |
| 3.4 Integrating Model Energetics | 第42-45页 |
| 3.4.1 Integrating the Glucose Transporter | 第43页 |
| 3.4.2 Integrating the Malate-Aspartate Shuttle | 第43-44页 |
| 3.4.3 Integrating the Phosphocreatine Shuttle | 第44-45页 |
| 3.4.4 Integrating the Pyruvate Transporter | 第45页 |
| 3.5 Time Dependent Concentration Change of Substrates | 第45页 |
| 3.6 Brief Summary | 第45-47页 |
| Chapter 4: Modeling of Atrial Electrophysiology | 第47-55页 |
| 4.1 Introduction | 第47页 |
| 4.2 Ion Currents Modeling | 第47-51页 |
| 4.2.1 Modeling the Sodium Current (I_(Na)) | 第48-49页 |
| 4.2.2 Modeling the Calcium Current (I_(Ca)) | 第49页 |
| 4.2.3 Modeling the Potassium Current | 第49-51页 |
| 4.3 Ion Pump and Current Integration | 第51-52页 |
| 4.4 Integrating Ion Kinetics and Cardiac Energetics | 第52-53页 |
| 4.4.1 Total Membrane Potential | 第52-53页 |
| 4.4.2 Description of Cardiac Bioenergetics | 第53页 |
| 4.5 Brief Summary | 第53-55页 |
| Chapter 5: Model Simulation and Results | 第55-72页 |
| 5.1 Introduction | 第55页 |
| 5.2 Implementation Decisions | 第55-57页 |
| 5.3 System flowchart | 第57-58页 |
| 5.4 Simulation Results and Discussion | 第58-69页 |
| 5.4.1 Steady State of Glycolytic and TCA Cycle Substrates | 第58-60页 |
| 5.4.2 Steady State Cardiac Energy Dynamics | 第60-63页 |
| 5.4.3 Modulated Cardiac Workload and Substrates Response | 第63-67页 |
| 5.4.4 Atrial MCU Calcium Uptake | 第67-69页 |
| 5.5 Model Validity and Difference from other In-Silico Cardiac Metabolic Models | 第69-70页 |
| 5.6 Challenges Encountered and Steps to Resolution | 第70-72页 |
| Conclusion | 第72-74页 |
| Reference | 第74-81页 |
| Published Papers | 第81-83页 |
| Acknowledgement | 第83-84页 |
| Appendix Ⅰ: Ordinary Differential Equations | 第84-85页 |
