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两个罕见的α基因簇大片段缺失突变导致地中海贫血的遗传家系鉴定

摘要第3-6页
ABSTRACT第6-8页
第1章 引言第12-19页
    1.1 α-地中海贫血第12-16页
    1.2 α-珠蛋白基因簇调控元件第16-17页
    1.3 HbH病与Hb Bart's胎儿水肿综合征发病机制第17-19页
第2章 实验材料第19-27页
    2.1 主要实验仪器第19-20页
    2.2 分析软件和数据库第20页
    2.3 试剂耗材第20-25页
        2.3.1 外周血基因组DNA提取试剂第20-22页
        2.3.2 地贫检测试剂盒第22-23页
        2.3.3 MLPA试剂第23页
        2.3.4 PCR试剂第23-24页
        2.3.5 电泳试剂第24页
        2.3.6 TA克隆试剂第24-25页
        2.3.7 耗材第25页
    2.4 家系来源第25-27页
第3章 实验方法第27-52页
    3.1 基本技术路线图第27-28页
    3.2 样本采集及运输第28-29页
    3.3 血液学表型分析第29-30页
        3.3.1 血液学常规分析第29页
        3.3.2 血红蛋白成分分析第29-30页
    3.4 外周血基因组DNA提取第30-31页
        3.4.1 酚/氯仿方法抽提外周血基因组DNA第30-31页
    3.5 HBA和HBB突变分析第31-42页
        3.5.1 α-地贫缺失型突变分析(-α~(3.7)/,-α~(4.2)/和--~(SEA)/缺失型)第31-33页
        3.5.2 RDB分析α和β地贫点突变第33-35页
        3.5.3 α珠蛋白基因测序分析第35-36页
        3.5.4 β珠蛋白基因测序分析第36-37页
        3.5.5 MLPA检测α-珠蛋白基因簇内基因大片段缺失与重复第37-41页
        3.5.6 NGS检测α-珠蛋白基因簇上的拷贝数变异第41-42页
    3.6 Gap-PCR及Sanger测序鉴定大片段缺失的断裂点第42-52页
        3.6.1 家系A断裂点引物、PCR反应、电泳鉴定及测序第43-44页
        3.6.2 家系B断裂点引物、PCR反应、电泳鉴定及测序第44-48页
        3.6.3 TA克隆鉴定大片段缺失断裂点位置第48-52页
第4章 实验结果第52-62页
    4.1 血液学表型分析结果第52-55页
        4.1.1 家系A表型分析第52-54页
        4.1.2 家系B表型分析第54-55页
    4.2 DNA分析结果第55-58页
        4.2.1 三种α-地中海贫血缺失突变的Gap-PCR结果第55-56页
        4.2.2 α-和β-珠蛋白基因测序分析结果第56页
        4.2.3 MLPA检测α-珠蛋白基因簇CNVs结果第56-57页
        4.2.4 NGS检测α珠蛋白基因簇CNVs结果第57-58页
    4.3 普通PCR鉴定两个家系的大片段缺失的断裂点第58-62页
        4.3.1 Gap-PCR鉴定家系A的大片段缺失断裂点第58-59页
        4.3.2 Gap-PCR鉴定家系B的大片段缺失断裂点第59-62页
第5章 分析与讨论第62-65页
结论第65-66页
参考文献第66-72页
附录 英文缩略词表总结第72-74页
硕博攻读期间发表论文第74-75页
致谢第75-77页

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