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实时荧光定量PCR技术用于土壤中小麦纹枯病菌的定量检测及动态分析

英文缩略表第4-8页
中文摘要第8-10页
Abstract第10-12页
1 引言第13-28页
    1.1 小麦纹枯病的发生概况第13-18页
        1.1.1 小麦纹枯病的病原第13-14页
        1.1.2 小麦纹枯病的侵染循环第14-15页
        1.1.3 小麦纹枯病的危害第15页
        1.1.4 小麦纹枯病的流行因素第15-16页
        1.1.5 小麦纹枯病菌的接种方法第16-17页
        1.1.6 小麦纹枯病的防治第17-18页
    1.2 丝核菌的分类概况第18-20页
        1.2.1 丝核菌的分类特征第18页
        1.2.2 菌丝融合群分类法在丝核菌上的应用第18-20页
            1.2.2.1 多核丝核菌及融合群划分第18-20页
            1.2.2.2 双核丝核菌及融合群划分第20页
    1.3 土壤群落定量方法研究进展第20-23页
        1.3.1 微生物平板培养法第21页
        1.3.2 分子生物学的检测方法第21-23页
    1.4 实时荧光定量 PCR 技术的应用第23-27页
        1.4.1 荧光定量PCR的原理第23-24页
        1.4.2 实时荧光定量PCR技术的几个重要参数第24-25页
        1.4.3 实时荧光定量PCR技术的优缺点第25页
        1.4.4 实时荧光定量PCR技术的应用第25-27页
    1.5 本研究的目的意义第27-28页
2 材料方法第28-36页
    2.1 菌株的分离鉴定第28-29页
        2.1.1 PDA培养基的制备第28页
        2.1.2 菌株的分离鉴定第28-29页
    2.2 菌株DNA的提取第29-30页
        2.2.1 菌株DNA提取试剂第29-30页
        2.2.2 使用仪器第30页
        2.2.3 菌株DNA提取步骤第30页
    2.3 标准品的制备第30-31页
    2.4 引物设计和特异性检测第31-33页
    2.5 Real-time PCR反应体系的建立及条件优化第33页
    2.6 引物灵敏度检测和标准曲线的绘制第33页
        2.6.1 引物灵敏度检测第33页
        2.6.2 菌丝DNA标准曲线的绘制第33页
    2.7 土壤样品的采集处理第33-35页
        2.7.1 土壤样品的采集第33页
        2.7.2 土壤总DNA的提取第33-35页
    2.8 田间病情指数的调查第35页
    2.9 土壤样品的检测第35-36页
3 结果与分析第36-49页
    3.1 引物特异性检测第36-39页
        3.1.1 常规PCR技术检测引物特异性第36-37页
        3.1.2 实时荧光定量PCR技术检测引物特异性第37-39页
    3.2 优化的real-time PCR反应条件第39页
    3.3 引物灵敏度检测第39-41页
        3.3.1 常规PCR技术检测引物灵敏度第39-40页
        3.3.2 实时荧光定量PCR技术检测引物灵敏度第40-41页
    3.4 标准曲线的绘制第41页
    3.5 土壤中小麦纹枯病菌的动态分析第41-49页
        3.5.1 小麦纹枯病病情指数调查结果第41-43页
        3.5.2 10日有效积温的计算第43-44页
        3.5.3 土壤中菌丝量的检测结果第44-45页
        3.5.4 土壤中小麦纹枯病菌(R.cerealis)的消长动态分析第45-49页
4 讨论第49-52页
    4.1 定量PCR方法的选择第49页
    4.2 DNA的提取第49-50页
    4.3 引物的设计和评估第50页
    4.4 标准曲线的绘制和方法评价第50-51页
    4.5 土壤中小麦纹枯病菌的检测和动态分析第51-52页
参考文献第52-58页
致谢第58-59页
攻读学位期间发表论文情况第59页

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