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基于化学反应的RNA去甲基化研究和5-醛基胞嘧啶的检测

摘要第5-7页
Abstract第7-8页
第一章 绪论第12-49页
    1.1 核酸第12-14页
        1.1.1 核酸的组成第12页
        1.1.2 核酸的结构第12-13页
        1.1.3 表观遗传学第13-14页
    1.2 核酸的损伤第14-21页
        1.2.1 核酸的损伤来源第14-16页
        1.2.2 羟基自由基引起的核酸氧化性损伤第16-21页
    1.3 RNA甲基化与去甲基化研究第21-29页
        1.3.1 N~6-甲基腺苷的发现及其生理学功能第21-27页
        1.3.2 N~6-甲基腺苷的去甲基化研究第27-29页
    1.4 DNA甲基化与去甲基化研究第29-48页
        1.4.1 DNA甲基化的研究进展第29-32页
        1.4.2 DNA去甲基化的研究进展第32-33页
        1.4.3 胞嘧啶衍生物的分布及功能研究第33-37页
        1.4.4 5-醛基胞嘧啶的检测第37-48页
    1.5 本章小结第48-49页
第二章 课题设计第49-55页
    2.1 N~6-甲基腺苷化学去甲基化及其机理研究第49-51页
        2.1.1 引言第49页
        2.1.2 化学试剂的设计及去甲基化机理研究思路第49-51页
    2.2 5-醛基胞嘧啶的化学检测方法第51-55页
        2.2.1 引言第51页
        2.2.2 5-醛基胞嘧啶检测的设计思路第51-55页
第三章 N~6-甲基腺苷的化学去甲基化研究第55-79页
    3.1 引言第55-56页
    3.2 仪器与试剂第56-58页
        3.2.1 仪器第56页
        3.2.2 试剂第56页
        3.2.3 相关实验条件第56-58页
    3.3 相关化合物的合成与表征第58-59页
        3.3.1 N~6-甲基腺苷的去甲基化反应产物表征第58页
        3.3.2 N~6-醛基腺苷的合成第58-59页
    3.4 N~6-甲基腺苷去甲基化的机理研究第59-72页
        3.4.1 高效液相色谱分析N~6-甲基腺苷与化合物的反应第59-61页
        3.4.2 质谱分析氧化中间体第61-62页
        3.4.3 荧光光谱分析氧化中间体第62-63页
        3.4.4 核磁表征分析氧化中间体第63-66页
        3.4.5 化合物与N~6-甲基腺苷反应的机理研究第66-72页
    3.5 RNA的去甲基化反应研究第72-78页
        3.5.1 化合物与RNA链的反应第72-76页
        3.5.2 化合物与提取RNA样品的反应第76-78页
    3.6 本章小结第78-79页
第四章 DNA中5-醛基胞嘧啶的检测第79-111页
    4.1 引言第79-80页
    4.2 仪器与试剂第80-83页
        4.2.1 仪器第80-81页
        4.2.2 试剂第81-82页
        4.2.3 相关试剂的配置及实验方法第82-83页
    4.3 相关化合物的合成与表征第83-91页
        4.3.1 5-醛基胞苷的合成第83-84页
        4.3.2 标记探针的合成及表征第84-90页
            4.3.2.1 化合物1的合成及表征第84-88页
            4.3.2.2 化合物2的合成第88-89页
            4.3.2.3 化合物3的合成第89-90页
        4.3.3 标记探针与5-醛基胞苷的反应第90-91页
        4.3.4 亚硫酸氢钠与标记碱基反应第91页
    4.4 化合物与反应条件的优化第91-102页
        4.4.1 HPLC分析5-醛基胞苷与化合物的反应第91-93页
        4.4.2 HPLC分析DNA与化合物的反应第93-94页
        4.4.3 DNA质谱结果分析第94-96页
        4.4.4 凝胶电泳分析双链DNA的反应进行第96-98页
        4.4.5 单核苷酸延伸实验检测DNA中的5-醛基胞嘧啶第98-102页
    4.5 DNA中多位点5-醛基胞嘧啶的标记第102-104页
        4.5.1 合成多位点5-醛基胞嘧啶修饰的DNA双链第102-103页
        4.5.2 点杂交法验证反应第103-104页
    4.6 DNA富集实验第104-107页
        4.6.1 磁珠调取第104-105页
        4.6.2 实时荧光定量PCR实验检测富集效率第105-107页
    4.7 亚硫酸氢钠测序第107-110页
        4.7.1 亚硫酸氢钠处理DNA链第107-109页
        4.7.2 将序列连接于质粒中进行测序第109-110页
    4.8 本章小结第110-111页
全文总结第111-112页
参考文献第112-126页
攻读博士期间发表论文第126-127页
致谢第127-128页
附录第128-140页

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