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基于转录组测序的光皮桦应拉木形成分子机制研究

致谢第5-6页
摘要第6-9页
Abstract第9-12页
目录第13-17页
图目录第17-19页
表目录第19-20页
第1章 文献综述第20-40页
    1.1 木材的解剖构造第20-21页
        1.1.1 木材的组成第20页
        1.1.2 木材的次生细胞壁第20-21页
    1.2 木材的形成第21-25页
        1.2.1 维管形成层细胞的分裂第21-23页
        1.2.2 木质部细胞的生长过程第23-24页
        1.2.3 木材形成的调控第24-25页
    1.3 木材形成的分子机制研究进展第25-34页
        1.3.1 木质素生物合成途径的酶基因第25-29页
        1.3.2 纤维素生物合成的相关酶基因第29-31页
        1.3.3 参与木材形成的主要转录因子第31-34页
    1.4 高通量测序技术特点与应用第34-36页
        1.4.1 高通量测序技术特点第34-35页
        1.4.2 高通量测序技术在转录组分析上的应用第35-36页
    1.5 光皮桦遗传改良研究现状第36-38页
        1.5.1 常规育种进展第37页
        1.5.2 分子生物学基础相关研究第37-38页
    1.6 本研究意义与技术路线第38-40页
第2章 光皮桦应拉木的特征及其内源激素分布规律第40-49页
    2.1 材料与方法第40-44页
        2.1.1 植物材料第40-41页
        2.1.2 显微结构观测第41页
        2.1.3 微纤丝角测定第41-42页
        2.1.4 纤维素和木质素含量测定第42页
        2.1.5 蔗糖和果糖含量的测定第42-43页
        2.1.6 内源激素含量的酶联免疫分析第43-44页
        2.1.7 数据分析第44页
    2.2 结果与分析第44-47页
        2.2.1 应拉木和对应木的显微特征第44页
        2.2.2 应拉木的主要理化特性第44-45页
        2.2.3 应拉木形成中蔗糖和果糖含量的变化第45-46页
        2.2.4 应拉木和对应木主要内源激素的分布第46-47页
    2.3 讨论第47-49页
第3章 光皮桦转录组特征及纤维素和木质素合成候选基因分析第49-80页
    3.1 材料和方法第49-61页
        3.1.1 植物材料第49页
        3.1.2 总RNA的提取与检测第49-51页
        3.1.3 cDNA的合成与测序第51页
        3.1.4 序列拼接与评价第51-52页
        3.1.5 功能注释和分类第52-53页
        3.1.6 纤维素和木质素合成候选基因分析第53页
        3.1.7 基因验证与表达分析第53-61页
    3.2 结果与分析第61-78页
        3.2.1 RNA提取与质量检测第61-62页
        3.2.2 转录组测序产量及拼接第62-65页
        3.2.3 转录组序列的功能注释第65-71页
        3.2.4 纤维素和木质素合成候选基因分析第71-75页
        3.2.5 基因验证和表达分析第75-78页
    3.3 讨论第78-80页
第4章 光皮桦纤维素合成酶基因的克隆及表达分析第80-97页
    4.1 材料和方法第80-84页
        4.1.1 植物材料第80-81页
        4.1.2 激素、蔗糖处理第81页
        4.1.3 应拉木诱导处理第81页
        4.1.4 总RNA的提取与检测第81页
        4.1.5 BlCesA全长cDNA序列的分离第81页
        4.1.6 BlCesA的生物信息学分析第81-84页
        4.1.7 BlCesA的表达分析第84页
        4.1.8 数据分析第84页
    4.2 结果分析第84-93页
        4.2.1 8个BlCesA全长cDNA序列的分离第84页
        4.2.2 BlCesA全长cDNA的序列分析第84-86页
        4.2.3 BlCesA基因家族的进化树分析第86-89页
        4.2.4 不同器官和组织中BlCesA的表达差异第89-91页
        4.2.5 激素处理对BlCesA表达的影响第91页
        4.2.6 蔗糖渗透胁迫下BlCesA的表达差异第91-93页
        4.2.7 应拉木形成中BlCesA的表达差异第93页
    4.3 讨论第93-97页
第5章 光皮桦应拉木形成中差异表达基因的分析第97-124页
    5.1 材料与方法第97-101页
        5.1.1 植物材料第97-98页
        5.1.2 总RNA的提取与检测第98页
        5.1.3 cDNA的合成与测序第98页
        5.1.4 表达注释与聚类第98-99页
        5.1.5 代谢途径分析第99页
        5.1.6 基因序列比对与进化分析第99页
        5.1.7 基因共表达分析第99-101页
        5.1.8 基因表达的定量PCR分析第101页
    5.2 结果与分析第101-118页
        5.2.1 数字表达谱测序质量评价第101-102页
        5.2.2 测序读段与参考基因的比对分析第102-104页
        5.2.3 同样品间差异表达基因的数目统计第104页
        5.2.4 应拉木形成相关基因的表达谱分析第104-107页
        5.2.5 应拉木形成中的相关代谢通路分析第107-109页
        5.2.6 纤维素合成候选基因的表达模式第109-112页
        5.2.7 木质素合成相关酶编码基因的表达模式第112-115页
        5.2.8 生长素响应与极性运输相关基因的表达特征第115-117页
        5.2.9 基因表达的验证第117-118页
    5.3 讨论第118-124页
第6章 总结与展望第124-127页
    6.1 主要研究结论第124-125页
    6.2 主要创新点第125页
    6.3 展望第125-127页
参考文献第127-144页
附表1第144-145页
附表2第145-155页
附表3第155-160页
附录 主要试剂的配制第160-162页
在学期间发表论文及投稿第162页

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