摘要 | 第4-6页 |
ABSTRACT | 第6-7页 |
第一章 绪论 | 第10-16页 |
1.1 先天性下甲状腺功能减低症概述 | 第10页 |
1.2 DUOX2与CH | 第10-15页 |
1.2.1 DUOX2结构和功能研究 | 第10-12页 |
1.2.2 DUOX2的调节和表达研究 | 第12-13页 |
1.2.3 DUOX2基因突变对CH的影响 | 第13-15页 |
1.3 立题背景和意义 | 第15-16页 |
第二章 样本处理和实验方法的建立 | 第16-33页 |
2.1 实验设计思路 | 第16页 |
2.2 研究对象 | 第16-19页 |
2.3 样本基因组DNA提取 | 第19-21页 |
2.3.1 材料与设备 | 第19-20页 |
2.3.2 血液样本DNA提取 | 第20-21页 |
2.4 高通量测序引物设计 | 第21-23页 |
2.5 高通量测序实验操作步骤 | 第23-27页 |
2.5.1 Ion torrent测序基本原理 | 第23页 |
2.5.2 材料与设备 | 第23-24页 |
2.5.3 实验过程及操作 | 第24-27页 |
2.6 Sanger测序验证 | 第27-30页 |
2.6.1 材料与设备 | 第27页 |
2.6.2 Sanger测序引物设计 | 第27-29页 |
2.6.3 实验过程及操作 | 第29-30页 |
2.7 生物信息学分析 | 第30-33页 |
2.7.1 疑似致病位点的筛选 | 第30页 |
2.7.2 利用计算机软件对基因突变和蛋白质功能进行预测 | 第30-31页 |
2.7.3 致病等级划分 | 第31-32页 |
2.7.4 DUOX2基因型与临床表型分析 | 第32-33页 |
第三章 实验结果与分析 | 第33-62页 |
3.1 二代测序结果与分析 | 第33-37页 |
3.1.1 Ion Torrent PGM总体测序结果 | 第33页 |
3.1.2 PGM测序参数分析 | 第33-37页 |
3.2 突变数目整体性分析 | 第37-40页 |
3.3 Sanger测序结果验证 | 第40-41页 |
3.4 潜在致病位点分析 | 第41-44页 |
3.5 计算机生物学分析 | 第44-52页 |
3.5.1 计算机软件预测突变对蛋白功能的影响 | 第44页 |
3.5.2 序列保守分析 | 第44-51页 |
3.5.3 DUOX2突变与蛋白质结构的关系 | 第51-52页 |
3.6 致病等级划分 | 第52-53页 |
3.7 基因型和表型之间的关系分析 | 第53-62页 |
第四章 讨论 | 第62-65页 |
全文小结 | 第65-66页 |
参考文献 | 第66-70页 |
攻读硕士期间取得的科研成果 | 第70-71页 |
致谢 | 第71页 |