| 摘要 | 第5-6页 |
| abstract | 第6-7页 |
| 第一章 引言 | 第12-18页 |
| 1.1 羊草概况 | 第12页 |
| 1.2 转录组研究概况 | 第12页 |
| 1.3 羊草刈割胁迫研究进展 | 第12-13页 |
| 1.4 羊草干旱胁迫研究进展 | 第13-14页 |
| 1.5 羊草低温胁迫研究进展 | 第14-15页 |
| 1.6 羊草盐碱胁迫研究进展 | 第15-16页 |
| 1.7 研究目的与意义 | 第16页 |
| 1.8 研究的主要内容 | 第16-18页 |
| 第二章 刈割胁迫下羊草转录组研究 | 第18-30页 |
| 2.1 材料与方法 | 第18-19页 |
| 2.1.1 试验材料 | 第18页 |
| 2.1.2 试验设计 | 第18页 |
| 2.1.3 RNA提取及转录组测序 | 第18页 |
| 2.1.4 数据组装与蛋白编码框预测 | 第18页 |
| 2.1.5 组装结果注释与功能通路富集 | 第18-19页 |
| 2.1.6 差异基因与梯度基因的筛选 | 第19页 |
| 2.1.7 SSR位点查找分析 | 第19页 |
| 2.2 结果与分析 | 第19-28页 |
| 2.2.1 羊草刈割转录组原始数据 | 第19页 |
| 2.2.2 羊草刈割转录组数据组装 | 第19-20页 |
| 2.2.3 羊草刈割Unigene注释结果 | 第20-22页 |
| 2.2.4 羊草刈割差异基因数目分析 | 第22-26页 |
| 2.2.5 羊草刈割差异基因功能与代谢通路富集分析 | 第26-27页 |
| 2.2.6 羊草刈割转录组SSR分析 | 第27-28页 |
| 2.3 讨论 | 第28-29页 |
| 2.4 小结 | 第29-30页 |
| 第三章 干旱胁迫下羊草转录组研究 | 第30-41页 |
| 3.1 材料与方法 | 第30-31页 |
| 3.1.1 试验材料 | 第30页 |
| 3.1.2 试验设计 | 第30页 |
| 3.1.3 RNA提取及转录组测序 | 第30页 |
| 3.1.4 数据组装与蛋白编码框预测 | 第30页 |
| 3.1.5 组装结果注释与功能通路富集 | 第30页 |
| 3.1.6 差异基因与梯度基因的筛选 | 第30-31页 |
| 3.2 结果与分析 | 第31-39页 |
| 3.2.1 羊草干旱转录组原始数据 | 第31页 |
| 3.2.2 羊草干旱转录组数据组装结果 | 第31页 |
| 3.2.3 羊草干旱转录组Unigene注释结果 | 第31页 |
| 3.2.4 羊草干旱差异基因数目分析 | 第31-33页 |
| 3.2.5 羊草干旱差异基因功能与代谢通路富集分析 | 第33-39页 |
| 3.3 讨论 | 第39-40页 |
| 3.4 小结 | 第40-41页 |
| 第四章 低温胁迫下羊草转录组研究 | 第41-55页 |
| 4.1 材料与方法 | 第41-42页 |
| 4.1.1 试验材料 | 第41页 |
| 4.1.2 试验设计 | 第41页 |
| 4.1.3 RNA提取及转录组测序 | 第41页 |
| 4.1.4 数据组装与蛋白编码框预测 | 第41页 |
| 4.1.5 组装结果注释与功能通路富集 | 第41页 |
| 4.1.6 差异基因与梯度基因的筛选 | 第41-42页 |
| 4.2 结果与分析 | 第42-53页 |
| 4.2.1 羊草低温转录组原始数据 | 第42页 |
| 4.2.2 羊草低温转录组数据组装结果 | 第42页 |
| 4.2.3 羊草低温转录组Unigene注释结果 | 第42页 |
| 4.2.4 羊草低温差异基因数目分析 | 第42-44页 |
| 4.2.5 羊草低温差异基因功能与代谢通路富集分析 | 第44-53页 |
| 4.3 讨论 | 第53-54页 |
| 4.4 小结 | 第54-55页 |
| 第五章 盐碱胁迫下羊草转录组研究 | 第55-65页 |
| 5.1 材料与方法 | 第55-56页 |
| 5.1.1 试验材料 | 第55页 |
| 5.1.2 试验设计 | 第55页 |
| 5.1.3 RNA提取及转录组测序 | 第55页 |
| 5.1.4 数据组装与蛋白编码框预测 | 第55页 |
| 5.1.5 组装结果注释与功能通路富集 | 第55页 |
| 5.1.6 差异基因与梯度基因的筛选 | 第55-56页 |
| 5.2 结果与分析 | 第56-63页 |
| 5.2.1 羊草盐碱转录组原始数据 | 第56页 |
| 5.2.2 羊草盐碱转录组数据组装结果 | 第56页 |
| 5.2.3 羊草盐碱转录组Unigene注释结果 | 第56页 |
| 5.2.4 羊草盐碱差异基因数目分析 | 第56-59页 |
| 5.2.5 羊草盐碱差异基因功能与代谢通路富集分析 | 第59-63页 |
| 5.3 讨论 | 第63页 |
| 5.4 小结 | 第63-65页 |
| 第六章 不同胁迫下羊草转录组关联分析 | 第65-71页 |
| 6.1 分析材料与方法 | 第65页 |
| 6.1.1 分析材料 | 第65页 |
| 6.1.2 数据组装与蛋白编码框预测 | 第65页 |
| 6.1.3 组装结果注释与功能通路富集 | 第65页 |
| 6.1.4 差异基因与梯度基因的筛选 | 第65页 |
| 6.2 结果与分析 | 第65-69页 |
| 6.2.1 所有胁迫转录组数据组装结果 | 第65-67页 |
| 6.2.2 所有胁迫转录组Unigene注释结果 | 第67页 |
| 6.2.3 所有胁迫共同差异基因数目与功能关联分析 | 第67-68页 |
| 6.2.4 所有胁迫差异基因功能与代谢通路富集关联分析 | 第68-69页 |
| 6.3 讨论 | 第69-70页 |
| 6.4 小结 | 第70-71页 |
| 第七章 全文结论与展望 | 第71-73页 |
| 7.1 全文结论 | 第71-72页 |
| 7.2 创新点 | 第72页 |
| 7.3 研究展望 | 第72-73页 |
| 参考文献 | 第73-78页 |
| 致谢 | 第78-79页 |
| 作者简历 | 第79页 |
