摘要 | 第5-7页 |
Abstract | 第7-8页 |
1. 文献综述 | 第11-16页 |
1.1 微孢子虫整体简介 | 第11-12页 |
1.2 微孢子虫侵染及相关研究 | 第12-14页 |
1.2.1 发芽机制假说 | 第12页 |
1.2.2 侵染机制假说 | 第12-13页 |
1.2.3 孢壁蛋白研究概况 | 第13-14页 |
1.3 微孢子虫基因组研究概况 | 第14-16页 |
2. 引言 | 第16-18页 |
2.1 研究背景及意义 | 第16页 |
2.2 本研究的内容 | 第16-17页 |
2.3 本研究的技术路线 | 第17-18页 |
3. 柞蚕微孢子虫基因组测序结果及分析 | 第18-28页 |
3.1 材料 | 第18页 |
3.2 主要试剂与仪器 | 第18-19页 |
3.3 方法 | 第19-20页 |
3.3.1 孢子的分离与纯化 | 第19页 |
3.3.2 柞蚕微孢子虫基因组DNA 的提取 | 第19页 |
3.3.3 Shotgun 文库构建 | 第19-20页 |
3.3.4 原始的测序数据处理 | 第20页 |
3.3.5 数据组装分析 | 第20页 |
3.3.6 基因预测与注释 | 第20页 |
3.3.7 基因归类及比较分析 | 第20页 |
3.4 结果 | 第20-28页 |
3.4.1 基因组DNA 的质量检测 | 第20-21页 |
3.4.2 基因组测序与组装及基因预测与注释结果 | 第21-23页 |
3.4.3 柞蚕微孢子虫直系同源基因的功能分类 | 第23-26页 |
3.4.4 柞蚕微孢子虫、家蚕微孢子虫及蜜蜂微孢子虫的同源基因比较 | 第26-27页 |
3.4.5 柞蚕微孢子虫、家蚕微孢子虫和蜜蜂微孢子虫基因的GO 分类结果比较 | 第27-28页 |
4. 柞蚕微孢子虫孢壳蛋白的提取与质谱鉴定 | 第28-39页 |
4.1 材料 | 第28页 |
4.2 主要试剂与仪器 | 第28-29页 |
4.3 方法 | 第29-30页 |
4.3.1 柞蚕微孢子虫发芽处理和空孢壳的收集 | 第29页 |
4.3.2 柞蚕微孢子虫30kDa 蛋白的提取 | 第29-30页 |
4.3.3 质谱分析 | 第30页 |
4.4 结果 | 第30-39页 |
4.4.1 柞蚕微孢子虫空壳层孢子的分离 | 第30页 |
4.4.2 不同方法提取柞蚕微孢子虫蛋白的SDS-PAGE 检测 | 第30-31页 |
4.4.3 孢壳蛋白的LC-MS 鉴定结果 | 第31-33页 |
4.4.4 柞蚕微孢子虫几种孢壁蛋白序列同其他种微孢子虫相应序列的比对分析 | 第33-39页 |
5. 小结 | 第39-41页 |
5.1 柞蚕微孢子虫基因组测序结果 | 第39页 |
5.2 柞蚕微孢子虫孢壳蛋白的鉴定 | 第39-41页 |
参考文献 | 第41-44页 |
附录A 英文缩写全称 | 第44-45页 |
附录B 作者攻读硕士学位期间发表论文及科研情况 | 第45-46页 |
附录C 柞蚕微孢子虫的孢壳蛋白的质谱鉴定后的Mascot 检索结果 | 第46-48页 |
致谢 | 第48页 |