| 摘要 | 第6-8页 |
| Abstract | 第8-9页 |
| 缩略语表 | 第10-11页 |
| 1 综述 | 第11-19页 |
| 1.1 油菜概述 | 第11页 |
| 1.2 杂种致死概述 | 第11-12页 |
| 1.3 植物根概述 | 第12-15页 |
| 1.3.1 根的分类 | 第12-13页 |
| 1.3.2 植物根的功能及其形态建成 | 第13页 |
| 1.3.3 根尖的主要组成部分 | 第13-14页 |
| 1.3.4 植物激素概述 | 第14-15页 |
| 1.4 根的研究方法 | 第15-16页 |
| 1.4.1 传统研究方法 | 第15页 |
| 1.4.2 遗传学方法研究根的生长发育过程 | 第15-16页 |
| 1.5 测序技术简述 | 第16-18页 |
| 1.5.1 测序技术发展 | 第16-17页 |
| 1.5.2 转录组在植物中的研究进展及二代测序技术在其的应用 | 第17-18页 |
| 1.5.3 转录组在植物中的研究方式 | 第18页 |
| 1.6 本研究的目的和意义 | 第18-19页 |
| 2 材料和方法 | 第19-27页 |
| 2.1 材料 | 第19页 |
| 2.2 方法 | 第19-27页 |
| 2.2.1 RNA提取 | 第19-20页 |
| 2.2.2 RNA质量检测 | 第20-21页 |
| 2.2.3 测序cDNA文库制备流程 | 第21页 |
| 2.2.4 Illumina HiSeq 2000上机测序 | 第21页 |
| 2.2.5 测序数据处理 | 第21-24页 |
| 2.2.6 RNA反转 | 第24-25页 |
| 2.2.7 实时荧光定量PCR | 第25-26页 |
| 2.2.8 实时荧光定量PCR实验引物 | 第26-27页 |
| 3 结果与分析 | 第27-39页 |
| 3.1 突变体根尖的形态学观察 | 第27-28页 |
| 3.2 测序数据结果 | 第28-29页 |
| 3.3 Reads比对结果 | 第29-30页 |
| 3.4 基因的表达模式分层聚类 | 第30-31页 |
| 3.5 差异表达基因分析 | 第31-32页 |
| 3.6 两个阶段共同差异基因的GO功能分类 | 第32-34页 |
| 3.7 两个阶段共同差异基因GO功能显著性富集 | 第34-36页 |
| 3.8 两个阶段共同差异基因KEGG显著性富集通路 | 第36-38页 |
| 3.9 定量验证测序结果 | 第38-39页 |
| 4 讨论 | 第39-42页 |
| 4.1 植物杂种致死的遗传模式 | 第39页 |
| 4.2 突变体根尖的形态学观察 | 第39-40页 |
| 4.3 差异基因分析 | 第40页 |
| 4.4 差异基因GO富集分析 | 第40-41页 |
| 4.5 后续计划展望 | 第41-42页 |
| 参考文献 | 第42-47页 |
| 附录1 部分实验具体操作流程与差异基因代谢途径 | 第47-64页 |
| 致谢 | 第64页 |
