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里氏木霉差异磷酸化蛋白组学研究及其功能分析

摘要第3-5页
Abstract第5-6页
第1章 文献综述第10-19页
    1.1 T. reesei RUT C30及其纤维素酶系第10-11页
    1.2 T. reesei表达系统的研究第11-13页
    1.3 T. reesei纤维素酶的表达调控的研究第13页
    1.4 磷酸化蛋白组学第13-14页
    1.5 磷酸化蛋白质组学分析和定量技术的研究第14-18页
        1.5.1 磷酸化肽的富集第14-15页
        1.5.2 磷酸化肽的鉴定第15-16页
        1.5.3 磷酸化肽的定量第16-18页
    1.6 生物信息学技术第18-19页
第2章 质谱非标记定量分析调控里氏木霉分泌纤维素酶相关蛋白第19-30页
    引言第19页
    2.1 材料与方法第19-23页
        2.1.1 菌株第19页
        2.1.2 培养基第19-20页
        2.1.3 使用仪器第20页
        2.1.4 菌株的培养第20-21页
        2.1.5 不同组别的总蛋白提取第21页
        2.1.6 蛋白质的定量—Brodford法第21页
        2.1.7 蛋白质的酶切第21-22页
        2.1.8 磷酸化肽段的富集第22页
        2.1.9 LC-MS/MS上样第22-23页
        2.1.10 质谱信号处理和肽段鉴定第23页
        2.1.11 蛋白质的定量第23页
    2.2 结果与分析第23-28页
        2.2.1 数据的重复性分析第23-24页
        2.2.2 差异蛋白的定量结果第24页
        2.2.3 差异蛋白的功能分析第24-28页
            2.2.3.1 GO分析第24-25页
            2.2.3.2 KEGG分析第25-28页
    2.3 讨论第28-30页
第3章二甲基标记定量分析调控里氏木霉分泌纤维素酶相关蛋白第30-46页
    引言第30页
    3.1 材料与方法第30-39页
        3.1.1 菌株第30-31页
        3.1.2 培养基第31页
        3.1.3 仪器第31页
        3.1.4 T. reesei的培养第31页
        3.1.5 差异磷酸化蛋白的筛选第31-32页
            3.1.5.1 蛋白质的提取第31页
            3.1.5.2 蛋白质的定量—Brodford法第31页
            3.1.5.3 蛋白质的酶切第31-32页
            3.1.5.4 磷酸化肽段的富集第32页
            3.1.5.5 磷酸化肽段的二甲基标记第32页
            3.1.5.6 LC-MS/MS上样第32页
            3.1.5.7 差异磷酸化蛋白的定量第32页
        3.1.6 GTP表达载体的构建第32-39页
            3.1.6.1 RNA的提取第32-33页
            3.1.6.2 cDNA文库的构建第33-35页
            3.1.6.4 里氏木霉的转化第35-37页
            3.1.6.5 滤纸酶活的测定第37页
            3.1.6.6 CMC酶活的测定第37-38页
            3.1.6.7 荧光定量PCR第38-39页
    3.2 结果与分析第39-44页
        3.2.1 磷酸化蛋白的定量结果第39-41页
        3.2.2 过表达载体的构建和鉴定第41页
        3.2.3 过表达菌株的构建和鉴定第41-42页
        3.2.4 qPCR分析重组菌株中GTP基因的相对表达量第42-43页
        3.2.5 重组菌株中的滤纸酶活和CMC酶活的测定第43-44页
    3.3 讨论第44-46页
结论第46-47页
参考文献第47-53页
附录第53-59页
致谢第59-60页
攻读硕士学位期间的研究成果第60页

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