| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 第一章 文献综述 | 第8-19页 |
| 1. 土壤真菌 | 第8页 |
| 2. 真菌传统分类研究 | 第8-9页 |
| 3. 腐质霉属研究概述 | 第9-12页 |
| 4. 嗜热丝孢菌属研究概述 | 第12页 |
| 5. 两属分类研究存在问题 | 第12-13页 |
| 6. 分子系统学 | 第13-14页 |
| 7. 分子系统学在真菌分类中的应用 | 第14-19页 |
| 7.1 rDNA序列 | 第14-16页 |
| 7.2 β-tubulin(β-微管蛋白基因) | 第16页 |
| 7.3 RNA polymerase II (RNA聚合酶II基因) | 第16-17页 |
| 7.4 多基因序列分析 | 第17-19页 |
| 第二章 研究内容 | 第19-64页 |
| 1. 实验材料 | 第19-21页 |
| 1.1 标本及菌种来源 | 第19-20页 |
| 1.2 仪器与试剂 | 第20-21页 |
| 2 实验方法 | 第21-24页 |
| 2.1 土壤真菌的分离 | 第21页 |
| 2.2 培养基 | 第21页 |
| 2.3 诱导产孢的方法 | 第21页 |
| 2.4 DNA的提取 | 第21-22页 |
| 2.5 PCR扩增与测序 | 第22页 |
| 2.6 菌株的形态学鉴定和图版的制作 | 第22-23页 |
| 2.7 系统发育树的构建方法 | 第23页 |
| 2.7.1 最大简约法 (Maximum Parsimony) | 第23页 |
| 2.7.2 最大似然法 (Maximum Likelihood) | 第23页 |
| 2.7.3 贝叶斯推理法 (Bayesian Inference) | 第23页 |
| 2.8 系统发育分析 | 第23-24页 |
| 3. 结果与分析 | 第24-64页 |
| 3.1 腐质霉系统学研究 | 第24-46页 |
| 3.1.1 基于LSU序列的属间系统分析 | 第24-30页 |
| 3.1.2 基于ITS序列的属间系统发育分析 | 第30-33页 |
| 3.1.3 基于加合基因的属间系统发育分析 | 第33-36页 |
| 3.1.4 基于ITS序列属内系统发育分析 | 第36-37页 |
| 3.1.5 基于LSU序列的属内系统发育分析 | 第37-39页 |
| 3.1.6 基于β-tubulin序列属内系统发育分析 | 第39-40页 |
| 3.1.7 基于RPB2序列的属内系统发育分析 | 第40-42页 |
| 3.1.8 RPB2和β-tubulin加合基因的属内系统发育分析 | 第42-44页 |
| 3.1.9 ITS、LSU、β-tubulin、RPB2四基因加合的属内系统发育分析 | 第44-46页 |
| 3.2 腐质霉属形态学研究 | 第46-59页 |
| 3.2.1 Neohumicola grisea var. grisea comb. nov | 第46-48页 |
| 3.2.2 Neohumicola jilongensis.comb.nov | 第48-49页 |
| 3.2.3 Humicola verruculosa (HSAUP 1332) | 第49-50页 |
| 3.2.4 Humicola irregularis (HSAUP 5194) | 第50-51页 |
| 3.2.5 Humicola pedunclensis (HSAUP 1004) | 第51-52页 |
| 3.2.6 Humicola brachypodi (HSAUP 2241) | 第52-53页 |
| 3.2.7 Humicola sp. (HSAUP 1915) | 第53-55页 |
| 3.2.8 Humicola sp. (HSAUP 0905) | 第55-56页 |
| 3.2.9 Humicola sp. (HSAUP 1001) | 第56-57页 |
| 3.2.10 腐质霉属及其近似属的旧检索表 | 第57-58页 |
| 3.2.11 腐质霉属及其近似属的新检索表 | 第58页 |
| 3.2.12 腐质霉属(Humicola)部分种检索表 | 第58-59页 |
| 3.2.13 新属(Neohumicola)部分种检索表 | 第59页 |
| 3.3 嗜热丝孢菌属系统学研究 | 第59-62页 |
| 3.4 嗜热丝孢菌属形态学研究 | 第62-64页 |
| 第三章 结论与讨论 | 第64-67页 |
| 1. 结论 | 第64-65页 |
| 1.1 腐质霉属及嗜热丝孢菌属的分离鉴定 | 第64页 |
| 1.2 腐质霉属研究总结 | 第64页 |
| 1.3 嗜热丝孢菌属研究总结 | 第64-65页 |
| 2. 讨论 | 第65-67页 |
| 2.1 菌株标本 | 第65页 |
| 2.2 两属研究讨论 | 第65-66页 |
| 2.3 无性属与有性属的讨论 | 第66页 |
| 2.4 未来研究趋势 | 第66-67页 |
| 致谢 | 第67-68页 |
| 参考文献 | 第68-72页 |
| 附录 | 第72-73页 |
