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一种ABC转运蛋白ArtI-Art(QN)2复合物的结构与功能研究

摘要第3-4页
Abstract第4页
第1章 引言第10-32页
    1.1 本章引论第10-11页
    1.2 ABC转运蛋白的功能第11-14页
        1.2.1 ABC转运蛋白在原核生物中的功能第11-12页
        1.2.2 ABC转运蛋白在真核生物中的功能第12-14页
    1.3 ABC转运蛋白的结构组成第14-22页
        1.3.1 底物结合蛋白(SBPs)第15-18页
        1.3.2 核酸结合结构域(NBDs)第18-21页
        1.3.3 跨膜区结构域(TMDs)第21-22页
    1.4 ABC转运蛋白的机制第22-23页
    1.5 向外转运蛋白(exporter)第23-24页
    1.6 向内转运蛋白第24-29页
        1.6.1 Ⅰ型向内转运蛋白(Ⅰ型importer)第24-26页
        1.6.2 Ⅱ型向内转运蛋白(Ⅱ型importer)第26-28页
        1.6.3 ECF类向内转运蛋白第28-29页
    1.7 氨基酸ABC转运蛋白的研究现状第29-30页
    1.8 本文研究工作的目的和意义第30-32页
第2章 实验材料与方法第32-56页
    2.1 本章引论第32-33页
    2.2 表达载体的构建第33-36页
        2.2.1 载体及菌种第33页
        2.2.2 试剂及仪器第33-34页
        2.2.3 实验所用培养基和试剂的配制第34-35页
        2.2.4 大肠杆菌表达载体的构建与筛选第35-36页
    2.3 蛋白的表达与纯化第36-41页
        2.3.1 试剂及仪器第36-37页
        2.3.2 实验中常用缓冲液的配制第37-38页
        2.3.3 目的蛋白的表达第38-39页
        2.3.4 目的蛋白的提取第39-41页
            2.3.4.1 Art I的纯化第40页
            2.3.4.2 Art Q-Art N复合物的纯化第40-41页
    2.4 目的蛋白的结晶与结构解析第41-49页
        2.4.1 试剂及仪器第41页
        2.4.2 晶体初步筛选方法第41-45页
        2.4.3 晶体的优化方法第45-47页
        2.4.4 配置晶体防冻液第47页
        2.4.5 获取晶体相位的方法第47-48页
        2.4.6 晶体结构解析第48-49页
    2.5 Art I和底物的结合第49-51页
        2.5.1 Art I的变性和复性第49-50页
            2.5.1.1 仪器和试剂第49-50页
            2.5.1.2 变性和复性方法第50页
        2.5.2 等温滴定量热技术(ITC)测定Art I的底物第50-51页
    2.6 Art I和Art Q-Art N的结合第51-52页
        2.6.1 仪器和试剂第51页
        2.6.2 实验方法第51-52页
    2.7 蛋白的酶活测定第52-56页
        2.7.1 仪器和试剂第52页
        2.7.2 去垢剂环境下测量酶活第52-53页
        2.7.3 脂质体环境下测量酶活第53-56页
            2.7.3.1 脂质体的制备第53-55页
            2.7.3.2 脂质体中酶活的测定第55-56页
第3章 蛋白的纯化与结晶第56-70页
    3.1 Art I的表达纯化及结晶第56-60页
        3.1.1 Art I的表达纯化第56-58页
        3.1.2 Art I的结晶第58-60页
    3.2 Art Q-Art N复合物的表达纯化及结晶第60-69页
        3.2.1 Art Q的表达纯化第60-61页
        3.2.2 Art Q的结晶第61-62页
        3.2.3 Art N的表达纯化第62-64页
        3.2.4 Art Q-Art N复合物的表达纯化第64-65页
        3.2.5 Art Q-Art N复合物的结晶第65-66页
        3.2.6 Art Q-Art N复合物的晶体优化第66-68页
        3.2.7 Art Q-Art N-底物/ATP复合物的晶体生长第68-69页
    3.3 本章小结第69-70页
第4章 晶体结构解析第70-82页
    4.1 晶体数据收集与结构解析第70-71页
    4.2 Art I的结构及生化特性分析第71-75页
        4.2.1 Art I的结构特性第71-74页
        4.2.2 Art I的生化特性第74-75页
    4.3 Art Q-Art N复合物的结构及生化特性分析第75-80页
        4.3.1 Art Q-Art N复合物的整体结构第75-76页
        4.3.2 Art Q的结构特性第76-78页
        4.3.3 Art N的结构特性第78-80页
    4.4 本章小结和讨论第80-82页
第5章 Art(QN)_2选择底物的机制分析第82-97页
    5.1 本章引论第82页
    5.2 Art(QN)_2 与Art I的结合第82-83页
    5.3 Art(QN)_2 酶活的测定第83-86页
        5.3.1 去垢剂环境下测定的酶活第83-84页
        5.3.2 脂质体环境下测定的酶活第84-86页
    5.4 Art(QN)_2 选择底物的机制的分析第86-96页
        5.4.1 Art(QN)_2-底物复合物的晶体结构第86-88页
        5.4.2 底物选择的机制第88-92页
        5.4.3 选择底物的共同特征第92-95页
        5.4.4 Art Q的正确折叠对酶活的影响第95-96页
    5.5 本章小结第96-97页
第6章讨论与展望第97-103页
    6.1 本论文的主要结论第97-98页
    6.2 本论文结论的讨论及要解决的问题第98-101页
        6.2.1 Art(QN)_2 的转运状态第98-99页
        6.2.2 Art(QN)_2 有两个底物结合位点第99-100页
        6.2.3 Art(QN)_2 转运底物的能力第100页
        6.2.4 底物的特异性第100-101页
    6.3 展望第101-103页
参考文献第103-113页
致谢第113-115页
附录A 数据收集和结构修正结果总结图第115-117页
个人简历、在学期间发表的学术论文与研究成果第117页

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