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粟酒裂殖酵母中PPR蛋白Ppr10与Mpa1相互作用的研究

摘要第3-4页
Abstract第4页
第一章 绪论第8-14页
    1.1 线粒体的机能与人类健康第8-9页
    1.2 PPR蛋白与人类疾病第9-10页
    1.3 PPR蛋白的结构特点及功能第10-12页
    1.4 线粒体的翻译机器第12-13页
    1.5 粟酒裂殖酵母做为模式生物的优点第13-14页
第二章 粟酒裂殖酵母ppr10基因功能的研究第14-28页
    2.1 实验材料第14-16页
        2.1.1 菌种第14页
        2.1.2 培养基及相关试剂第14-15页
        2.1.3 引物设计第15-16页
    2.2 实验方法第16-22页
        2.2.1 野生型菌株yHL6381和yHH1点菌实验第16-17页
        2.2.2 ppr10缺失菌株存活率测定第17页
        2.2.3 S.pombe总RNA的提取第17-18页
        2.2.4 RNA的质量检测第18页
        2.2.5 cDNA模板的获得第18-19页
        2.2.6 实时荧光定量PCR第19页
        2.2.7 S.pombe线粒体提取方法第19-20页
        2.2.8 线粒体RNA的提取第20-21页
        2.2.9 RNA免疫共沉淀(RIP)方法第21-22页
    2.3 结果与分析第22-26页
        2.3.1 ppr10缺失菌在稳定期后期大量死亡第22-23页
        2.3.2 ppr10缺失菌存活率下降第23页
        2.3.3 Ppr10不影响线粒体编码的mRNAs的稳定第23-25页
        2.3.4 Ppr10与线粒体编码的mRNAs存在相互作用第25-26页
    2.4 本章小结第26-28页
第三章 Ppr10与Mpa1相互作用的研究第28-65页
    3.1 实验材料第28-35页
        3.1.1 菌种和质粒第28-31页
        3.1.2 培养基与相关试剂第31-34页
        3.1.3 引物设计第34-35页
    3.2 实验方法第35-46页
        3.2.1 串联亲和纯化(TAP)Ppr10蛋白复合体第35-36页
        3.2.2 银染检测蛋白复合体的组分第36页
        3.2.3 质谱鉴定蛋白复合体组分第36-37页
        3.2.4 ppr10-myc-KanMX重组质粒的构建第37-39页
        3.2.5 E.coli TOP10化转感受态细胞的制取第39-40页
        3.2.6 将重组质粒重组质粒转入E.coli TOP10感受态细胞第40页
        3.2.7 碱变性法抽提重组质粒第40页
        3.2.8 上游重组质粒的酶切验证第40-41页
        3.2.9 下游重组质粒的构建第41页
        3.2.10 yYJ1,yYJ2,yYJ3菌株的筛选以及表达检测第41-42页
        3.2.11 粟酒裂殖酵母基因组的提取第42页
        3.2.12 运用anti-c-Myc琼脂糖珠检测Ppr10与Mpa1的相互作用第42-43页
        3.2.13 运用anti-HA琼脂糖珠检测Ppr10与Mpa1的相互作用第43-44页
        3.2.14 蛋白液中RNA消化后检测Ppr10与Mpa1的相互作用第44页
        3.2.15 Western Blot法检测蛋白的相互作用第44-45页
        3.2.16 ppr10-myc-ura4质粒的构建第45-46页
        3.2.17 碱裂解法制备酵母总蛋白第46页
    3.3 结果与分析第46-63页
        3.3.1 串联亲和纯化Ppr10蛋白复合体及组分鉴定第46-50页
        3.3.2 重组质粒及相关菌株构建第50-56页
        3.3.3 免疫共沉淀检测Ppr10与Mpa1的相互作用第56-57页
        3.3.4 反向免疫共沉淀检测Ppr10与Mpa1的相互作用第57页
        3.3.5 将蛋白复合体中RNA消化后Ppr10与Mpa1的相互作用第57-58页
        3.3.6 Mpa1不影响线粒体RNA的稳定性第58-60页
        3.3.7 Mpa1缺失导致Ppr10蛋白水平的减少第60-61页
        3.3.8 回补Mpa1使Ppr10蛋白水平恢复正常第61页
        3.3.9 Mpa1缺失不影响ppr10 mRNA的水平第61-62页
        3.3.10 Ppr10的缺失不影响Mpa1的稳定第62-63页
        3.3.11 Ppr10在Mpa1缺失菌体内被Lon1降解第63页
    3.4 本章小结第63-65页
第四章 Ppr10与线粒体翻译起始因子相互作用的研究第65-77页
    4.1. 实验材料第65-67页
        4.1.1 菌种和质粒第65页
        4.1.2 培养基与相关试剂第65-67页
        4.1.3 引物设计第67页
    4.2 重组质粒的构建第67-70页
        4.2.1 mti2-FLAG-ura4重组质粒的构建第67-69页
        4.2.2 运用anti-c-Myc琼脂糖珠检测Ppr10与Mti2的相互作用第69-70页
        4.2.3 Western-Blot方法分析蛋白相互作用第70页
    4.3 结果与讨论第70-75页
        4.3.1 mti2-FLAG-ura4重组质粒的构建第70-71页
        4.3.2 yYJ11与yYJ12菌株构建第71-72页
        4.3.3 免疫共沉淀证明Ppr10与Mti2存在相互作用第72-73页
        4.3.4 蛋白液中RNA消化后检测Ppr10与Mti2存在相互作用第73-74页
        4.3.5 免疫共沉淀证明Ppr10与Mti3不存在相互作用第74页
        4.3.6 粟酒裂殖酵母原位加标签不影响蛋白功能第74-75页
    4.4 本章小结第75-77页
第五章 全文总结第77-80页
参考文献第80-86页
附录一 主要仪器第86-87页
附录二 本实验所用的质粒第87-88页
附录三 本实验所用的菌种第88-91页
在读期间发表的学术论文及研究成果第91-92页
致谢第92页

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