基于ELM的蛋白质相互作用界面热点残基预测方法的研究
摘要 | 第4-5页 |
ABSTRACT | 第5页 |
第1章 绪论 | 第8-12页 |
1.1 研究背景与意义 | 第8-9页 |
1.2 国内外研究现状 | 第9-10页 |
1.3 本文的研究内容 | 第10-11页 |
1.4 本文的结构安排 | 第11-12页 |
第2章 蛋白质相互作用机制 | 第12-16页 |
2.1 蛋白质的组成与结构特征 | 第12-13页 |
2.2 蛋白质相互作用机理 | 第13页 |
2.3 蛋白质相互作用界面热点残基介绍 | 第13-14页 |
2.4 蛋白质相互作用数据库 | 第14-15页 |
2.5 本章小结 | 第15-16页 |
第3章 特征选择和分类算法 | 第16-25页 |
3.1 特征选择 | 第16-17页 |
3.1.1 特征选择相关介绍 | 第16-17页 |
3.1.2 特征选取策略简要介绍 | 第17页 |
3.2 特征筛选策略 | 第17-20页 |
3.2.1 Relief特征选择算法相关介绍 | 第17-18页 |
3.2.2 ReliefF特征选择算法 | 第18-19页 |
3.2.3 去除冗余和选择重要特征 | 第19-20页 |
3.3 分类算法与特征子集选取 | 第20-24页 |
3.3.1 极限学习机(ELM) | 第20-23页 |
3.3.2 特征子集选取 | 第23-24页 |
3.4 本章小结 | 第24-25页 |
第4章 蛋白质相互作用界面的热点残基预测 | 第25-32页 |
4.1 蛋白质数据集准备 | 第25-26页 |
4.2 蛋白质特征集选择 | 第26-30页 |
4.3 预测模型的构建 | 第30-31页 |
4.4 本章小结 | 第31-32页 |
第5章 实验结果和分析 | 第32-43页 |
5.1 模型评价标准 | 第32页 |
5.2 实验结果与分析 | 第32-38页 |
5.3 与其他方法比较 | 第38-39页 |
5.4 案例研究与比较分析 | 第39-41页 |
5.5 本章小结 | 第41-43页 |
第6章 总结与展望 | 第43-45页 |
6.1 工作总结 | 第43页 |
6.2 工作展望 | 第43-45页 |
参考文献 | 第45-48页 |
致谢 | 第48-49页 |
附录A 攻读学位期间所发表的学术论文 | 第49-50页 |
附录B 攻读学位期间所参加的科研项目 | 第50页 |