摘要 | 第4-6页 |
ABSTRACT | 第6页 |
第一章 绪论 | 第10-16页 |
1.1 纤维素酶的特点及分类及研究意义 | 第10-12页 |
1.2 纤维素酶家族和族系 | 第12页 |
1.3 过程性内切纤维素酶的特点和功能简介 | 第12-13页 |
1.4 纤维素酶的两种水解机制 | 第13-14页 |
1.5 主要的研究内容 | 第14-16页 |
第二章 理论基础和计算方法简介 | 第16-19页 |
2.1 分子动力学 | 第16-17页 |
2.2 结合自由能 | 第17-19页 |
第三章 间隔性供水机制在ReCel7A水解中的研究 | 第19-44页 |
3.1 简介:过程性内切纤维素酶Cel7A的结构特点﹑水解模式和关键残基 | 第19-22页 |
3.2 模拟结构的获得与实验操作 | 第22-24页 |
3.2.1 初始结构的获得与处理 | 第22-24页 |
3.2.2 常规分子动力学参数设置 | 第24页 |
3.3 结果与讨论 | 第24-42页 |
3.3.1 分子动力学模拟结果取样及两个构象的对比 | 第24-27页 |
3.3.2 底物与周围残基形成的氢键及残基的作用 | 第27-31页 |
3.3.3 运用域互关联映射(Domain Cross-correlation Map)与均方根波动(Root Mean Square Fluctuations)分析整体蛋白和相关位点 | 第31-34页 |
3.3.4 推测“间隔性供水机制”和关键残基的作用机理 | 第34-39页 |
3.3.5 间隔性供水机制 | 第39-40页 |
3.3.6 进水通道 | 第40-42页 |
3.4 总结 | 第42-44页 |
参考文献 | 第44-50页 |
个人简介及科研成果 | 第50-51页 |
致谢 | 第51页 |