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纤维素酶Cel7A中“间隔供水机制”的分子动力学研究

摘要第4-6页
ABSTRACT第6页
第一章 绪论第10-16页
    1.1 纤维素酶的特点及分类及研究意义第10-12页
    1.2 纤维素酶家族和族系第12页
    1.3 过程性内切纤维素酶的特点和功能简介第12-13页
    1.4 纤维素酶的两种水解机制第13-14页
    1.5 主要的研究内容第14-16页
第二章 理论基础和计算方法简介第16-19页
    2.1 分子动力学第16-17页
    2.2 结合自由能第17-19页
第三章 间隔性供水机制在ReCel7A水解中的研究第19-44页
    3.1 简介:过程性内切纤维素酶Cel7A的结构特点﹑水解模式和关键残基第19-22页
    3.2 模拟结构的获得与实验操作第22-24页
        3.2.1 初始结构的获得与处理第22-24页
        3.2.2 常规分子动力学参数设置第24页
    3.3 结果与讨论第24-42页
        3.3.1 分子动力学模拟结果取样及两个构象的对比第24-27页
        3.3.2 底物与周围残基形成的氢键及残基的作用第27-31页
        3.3.3 运用域互关联映射(Domain Cross-correlation Map)与均方根波动(Root Mean Square Fluctuations)分析整体蛋白和相关位点第31-34页
        3.3.4 推测“间隔性供水机制”和关键残基的作用机理第34-39页
        3.3.5 间隔性供水机制第39-40页
        3.3.6 进水通道第40-42页
    3.4 总结第42-44页
参考文献第44-50页
个人简介及科研成果第50-51页
致谢第51页

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