基于转录组信息的油松胚珠育性相关微卫星标记开发及基因差异表达分析
摘要 | 第1-5页 |
ABSTRACT | 第5-9页 |
引言 | 第9-10页 |
1 文献综述 | 第10-23页 |
·油松雌性不育研究进展 | 第10-12页 |
·油松胚珠发育的细胞学研究 | 第10-11页 |
·油松胚珠发育的生理生化研究 | 第11页 |
·油松胚珠发育的蛋白质组学研究 | 第11页 |
·油松胚珠发育的分子生物学研究 | 第11-12页 |
·高通量测序技术 | 第12-16页 |
·新一代测序技术简介 | 第13-14页 |
·新一代测序技术的应用 | 第14-15页 |
·第三代测序技术 | 第15-16页 |
·转录组与转录组测序技术(RNA-seq) | 第16-18页 |
·转录组 | 第16-17页 |
·转录组测序技术的发展 | 第17页 |
·转录组测序(RNA-seq) | 第17-18页 |
·微卫星分子标记技术 | 第18-21页 |
·分子标记技术 | 第18-19页 |
·微卫星标记简介 | 第19-20页 |
·微卫星序列分布特点 | 第20页 |
·微卫星标记的优势及应用 | 第20-21页 |
·高通量测序技术在微卫星标记中的应用 | 第21页 |
·研究背景、目的及内容 | 第21-23页 |
2 油松胚珠转录组微卫星特征分析 | 第23-33页 |
·材料与方法 | 第23页 |
·数据来源及材料 | 第23页 |
·数据处理 | 第23页 |
·结果与分析 | 第23-28页 |
·微卫星重复分布概况及重复基元的分布 | 第23-24页 |
·微卫星在编码区中的分布 | 第24-26页 |
·微卫星的长度分布 | 第26-27页 |
·微卫星序列表达水平(RPKM)分析 | 第27-28页 |
·讨论 | 第28-31页 |
·小结 | 第31-33页 |
3 油松胚珠育性相关微卫星标记开发 | 第33-41页 |
·材料采集 | 第33页 |
·材料 | 第33页 |
·试剂 | 第33页 |
·方法 | 第33-38页 |
·油松DNA提取 | 第33-34页 |
·特异序列筛选 | 第34页 |
·SSR引物设计 | 第34-35页 |
·PCR扩增 | 第35-38页 |
·结果与讨论 | 第38-40页 |
·从不同组织提取的DNA质量比较 | 第38页 |
·DNA质量检测 | 第38-39页 |
·PCR扩增结果分析 | 第39-40页 |
·小结 | 第40-41页 |
4 不育系特异表达基因的相对定量分析 | 第41-51页 |
·实时定量PCR相对定量及2-△△CT法 | 第41-42页 |
·材料与试剂 | 第42-43页 |
·材料 | 第42页 |
·试剂 | 第42-43页 |
·方法 | 第43-45页 |
·RNA提取 | 第43页 |
·反转录合成cDNA | 第43-44页 |
·引物设计 | 第44页 |
·实时定量PCR反应 | 第44-45页 |
·结果与分析 | 第45-50页 |
·RNA提取结果 | 第45-46页 |
·定量PCR产物特异性 | 第46-48页 |
·目标基因表达量 | 第48-50页 |
·小结 | 第50-51页 |
5 结论 | 第51-53页 |
参考文献 | 第53-61页 |
个人简介 | 第61-63页 |
导师简介 | 第63-65页 |
致谢 | 第65页 |