| 摘要 | 第1-6页 |
| abstract | 第6-9页 |
| 第一章 文献综述 | 第9-17页 |
| ·研究背景 | 第9-10页 |
| ·密码子使用偏好性 | 第10-12页 |
| ·密码子的使用偏好性模式 | 第11-12页 |
| ·密码子偏好性产生的原因 | 第12页 |
| ·密码子使用偏好性与翻译调控 | 第12-14页 |
| ·翻译调控 | 第12-13页 |
| ·编码区 5’端密码子使用偏好性与翻译调控 | 第13-14页 |
| ·分泌蛋白基因编码区 5’端的密码子偏好性 | 第14-15页 |
| ·信号肽的结构和功能 | 第14-15页 |
| ·信号肽的密码子偏好性研究 | 第15页 |
| ·研究目的 | 第15-17页 |
| 第二章 材料与方法 | 第17-22页 |
| ·数据采集 | 第17-18页 |
| ·蛋白质序列和编码区序列 | 第17页 |
| ·转录组m RNA表达量 | 第17-18页 |
| ·Ribo-seq 数据 | 第18页 |
| ·tAI（tRNA Adaptation Index） | 第18页 |
| ·密码子使用频率 | 第18-19页 |
| ·稀有密码子使用频率 | 第19页 |
| ·Z-score | 第19页 |
| ·随机序列的产生 | 第19页 |
| ·MPR（Most Preferred Region） | 第19-20页 |
| ·氨基酸序列的疏水性 | 第20页 |
| ·稀有密码子的聚集模式 | 第20-21页 |
| ·核糖体密度分析 | 第21页 |
| ·统计学分析 | 第21-22页 |
| 第三章 实验结果 | 第22-34页 |
| ·基因组的稀有密码子分布 | 第22-25页 |
| ·分泌蛋白基因和非分泌蛋白基因的密码子偏好性 | 第25-28页 |
| ·疏水区域的密码子偏好性 | 第28-30页 |
| ·编码区 5’端稀有密码子聚集模式 | 第30-31页 |
| ·分泌蛋白基因和非分泌蛋白基因的翻译效率 | 第31-34页 |
| 第四章 讨论 | 第34-36页 |
| ·结果总结 | 第34-35页 |
| ·不足与展望 | 第35-36页 |
| 参考文献 | 第36-42页 |
| 附录一 | 第42-54页 |
| 附录二 | 第54-57页 |
| 致谢 | 第57-59页 |
| 作者简介 | 第59页 |