| 摘要 | 第1-5页 |
| ABSTRACT | 第5-11页 |
| 注释表 | 第11-12页 |
| 第一章 绪论 | 第12-21页 |
| ·引言 | 第12-15页 |
| ·研究背景 | 第12-14页 |
| ·研究意义 | 第14-15页 |
| ·国内外研究进展 | 第15页 |
| ·本文的研究创新点 | 第15-16页 |
| ·本文的研究方案及关键问题 | 第16-19页 |
| ·研究方案 | 第16-18页 |
| ·拟解决的关键问题 | 第18-19页 |
| ·内容安排 | 第19-21页 |
| 第二章 第二代测序序列比对方法研究现状 | 第21-28页 |
| ·引言 | 第21页 |
| ·新一代高通量测序技术简介 | 第21-23页 |
| ·高通量测序平台 | 第21页 |
| ·Illumina测序结果格式说明 | 第21-23页 |
| ·第二代测序数据比对工具 | 第23-24页 |
| ·Bowtie2 比对工具介绍 | 第24-27页 |
| ·Bowtie2 安装与使用 | 第24-25页 |
| ·Bowtie2 比对原理 | 第25-26页 |
| ·Bowtie2 与Bowtie1 的对比 | 第26-27页 |
| ·本章小结 | 第27-28页 |
| 第三章 基于人类RNA-SEQ高通量测序数据筛选环形RNA | 第28-43页 |
| ·引言 | 第28页 |
| ·错序外显子的形成 | 第28-29页 |
| ·错序外显子形成的两种机制 | 第28-29页 |
| ·环形模型筛选特征 | 第29页 |
| ·环形RNA鉴别——两次比对算法 | 第29-34页 |
| ·数据来源 | 第30页 |
| ·第一轮比对 | 第30-32页 |
| ·构建自建外显子-外显子数据库 | 第32-33页 |
| ·第二轮比对 | 第33-34页 |
| ·控制FDR与数据筛选 | 第34-42页 |
| ·假设检验 | 第34-35页 |
| ·FDR控制定义 | 第35页 |
| ·空分布和p-value | 第35-37页 |
| ·多重检验校验 | 第37-41页 |
| ·环形RNA筛选和去冗余 | 第41-42页 |
| ·本章小结 | 第42-43页 |
| 第四章 基于人类RNA-SEQ数据筛选环形RNA结果的统计分析 | 第43-72页 |
| ·引言 | 第43页 |
| ·环形RNA关于染色体的相关统计 | 第43-60页 |
| ·各细胞系环形RNA个数关于染色体分布 | 第43-46页 |
| ·染色体关于环形RNA分类 | 第46-53页 |
| ·药物对染色体——环形RNA个数分布的影响分析 | 第53-60页 |
| ·环形RNA关于基因的相关统计 | 第60-69页 |
| ·各细胞系环形RNA个数关于基因分布 | 第60-62页 |
| ·基因关于环形RNA的分类 | 第62-63页 |
| ·药物对基因——环形RNA个数分布的影响分析 | 第63-65页 |
| ·基因上环形RNA亚型剪切点选择的的研究 | 第65-67页 |
| ·转录环形RNA的基因的GO分析 | 第67-69页 |
| ·环形RNA外显子组成个数的统计 | 第69-70页 |
| ·本章小结 | 第70-72页 |
| 第五章 总结与展望 | 第72-74页 |
| ·本文工作总结 | 第72页 |
| ·后续工作展望 | 第72-74页 |
| 参考文献 | 第74-81页 |
| 致谢 | 第81-82页 |
| 在学期间的研究成果及学术论文情况 | 第82页 |