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土壤青枯菌群体的动态消涨规律与分子检测方法研究

目录第1-8页
Contents第8-11页
摘要第11-13页
Abstract第13-15页
第一章 引言第15-35页
   ·青枯菌概述第15-19页
     ·青枯菌第15-16页
     ·青枯病第16-19页
       ·青枯菌分类与症状第17-19页
     ·青枯菌 Po82 菌株第19页
   ·青枯菌的非可培养活细胞状(ViableButNotCulturable,VBNC)第19-22页
   ·青枯菌检测第22-28页
     ·指示植物检测第22页
     ·平板划线分离法第22-23页
     ·血清学第23-24页
       ·酶联免疫吸附法第23页
       ·间接免疫荧光染色第23页
       ·单克隆抗体第23页
       ·免疫试纸条(Immuno-strip)第23-24页
     ·分子检测第24-28页
       ·分子杂交检测法第24页
       ·PCR 扩增技术第24-28页
     ·脂肪酸甲酯分析(FAME)第28页
   ·叠氮溴化丙锭(PMA)第28-29页
   ·荧光实时定量 PCR第29-33页
     ·荧光实时定量 PCR 的原理第29-30页
     ·探针技术的发展第30-31页
     ·探针设计原则第31页
     ·荧光实时定量 PCR 技术在植物病原菌检测的应用第31-33页
   ·研究的目的和技术路线第33-35页
     ·研究的目的和意义第33-34页
     ·技术路线第34-35页
第二章 土壤中青枯菌群体的动态消涨规律研究第35-52页
   ·材料第35-36页
     ·供试菌株第35页
     ·培养基第35-36页
     ·试剂和耗材第36页
   ·方法第36-41页
     ·供试青枯菌接种体的准备第36页
     ·青枯病带菌土样的制备第36-38页
     ·带菌土样的检测方法第38-41页
       ·平板划线分离第38页
       ·免疫试纸条检测方法第38-39页
       ·土壤 DNA 的分子检测第39-40页
       ·DNA 样品的分子检测方法第40页
       ·BIO-PCR 检测第40-41页
   ·结果与分析第41-49页
     ·平板划线分离结果第41-43页
     ·试纸条检测结果第43页
     ·土壤 DNA 样品的分子检测第43-44页
     ·BIO-PCR 检测结果第44-48页
     ·青枯菌在土壤中种群动态消涨规律第48-49页
   ·讨论第49-52页
第三章 VBNC 状态青枯菌的检测第52-62页
   ·材料第52-53页
     ·供试菌株第52-53页
     ·主要仪器设备第53页
     ·主要试剂第53页
   ·方法第53-56页
     ·青枯菌死菌悬液的制备第53-54页
     ·青枯菌 hrcS 基因序列的获取第54-55页
       ·靶标青枯菌基因组 DNA 提取第54-55页
     ·PCR 引物设计第55页
     ·PCR 扩增条件第55页
     ·PCR 特异性试验第55页
     ·引物扩增灵敏度第55页
     ·样品的 PMA 处理方法第55页
     ·青枯菌 VBNC 状态的诱导第55-56页
   ·结果与分析第56-60页
     ·特异性引物设计第56页
     ·PCR 条件的确立第56-57页
     ·PCR 特异性与灵敏度验证第57-58页
       ·特异性试验第57页
       ·灵敏度试验第57-58页
     ·高温胁迫诱导青枯菌进入 VBNC 状态第58页
     ·处于 VBNC 状态的青枯菌的 PMA-PCR 方法检测第58-59页
     ·PMA-PCR 检测方法的假阳性验证第59-60页
   ·讨论第60-62页
第四章 荧光实时 PCR 探针的设计第62-74页
   ·材料第62-63页
     ·供试菌株第62-63页
     ·培养基第63页
     ·试剂和耗材第63页
   ·方法第63-66页
     ·pGM-T 克隆测序第63-65页
     ·荧光实时定量 PCR第65-66页
       ·引物和 TapMan 探针的设计与合成第65页
       ·荧光定量 PCR 反应体系的组成第65页
       ·荧光定量 PCR 反应体系的优化第65-66页
     ·荧光定量 PCR 反应标准曲线的制作第66页
   ·结果与分析第66-73页
     ·测序结果第66-72页
     ·探针的实际应用第72-73页
   ·讨论第73-74页
第五章 全文结论第74-77页
参考文献第77-83页
致谢第83-84页
攻读学位期间发表的论文及著作第84页

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