南海鸢乌贼的种群遗传结构
| 上海海洋大学 硕士学位论文答辩委员会成员名单 | 第1-5页 |
| 摘要 | 第5-7页 |
| ABSTRACT | 第7-12页 |
| 第一章 绪论 | 第12-24页 |
| ·海洋渔业资源开发概述 | 第12-13页 |
| ·海洋生物种群遗传结构概述 | 第13-14页 |
| ·分子标记概述 | 第14-18页 |
| ·分子标记简介 | 第14-16页 |
| ·微卫星分子标记的选择 | 第16-17页 |
| ·微卫星标记在海洋动物研究中的应用 | 第17-18页 |
| ·南海鸢乌贼研究概述 | 第18-22页 |
| ·南海鸢乌贼简介 | 第18-20页 |
| ·南海鸢乌贼研究 | 第20-22页 |
| ·本研究的目的和意义 | 第22-23页 |
| ·技术路线 | 第23-24页 |
| 第二章 鸢乌贼微卫星标记的开发 | 第24-54页 |
| ·微卫星标记开发方法概述 | 第24-26页 |
| ·数据库检索法 | 第24-25页 |
| ·基因组文库筛选法 | 第25页 |
| ·近缘物种筛选法 | 第25页 |
| ·富集文库法 | 第25-26页 |
| ·鸢乌贼微卫星标记的开发 | 第26-43页 |
| ·南海鸢乌贼样品的采集 | 第26页 |
| ·主要仪器 | 第26页 |
| ·主要试剂 | 第26-30页 |
| ·南海鸢乌贼基因组 DNA 提取 | 第30-31页 |
| ·限制性内切酶切酶切基因组 DNA | 第31页 |
| ·连接 | 第31-32页 |
| ·连接产物 PCR 扩增 | 第32-33页 |
| ·回收纯化 PCR 扩增产物 | 第33页 |
| ·连接的 PCR 扩增产物与探针杂交 | 第33-34页 |
| ·磁珠富集微卫星片段 | 第34页 |
| ·洗涤富集后的磁珠 | 第34页 |
| ·洗脱富集片段 | 第34-35页 |
| ·洗脱片段 PCR 扩增 | 第35-36页 |
| ·洗脱片段 PCR 扩增产物的回收 | 第36页 |
| ·构建富集片断克隆文库 | 第36-39页 |
| ·阳性克隆子测序及序列整理 | 第39页 |
| ·微卫星引物的设计 | 第39页 |
| ·筛选引物 | 第39-41页 |
| ·聚丙烯酰胺凝胶电泳 | 第41-43页 |
| ·数据处理和分析 | 第43页 |
| ·结果 | 第43-53页 |
| ·基因组 DNA 提取 | 第43-44页 |
| ·限制性内切酶酶切 | 第44-45页 |
| ·连接产物 PCR 扩增 | 第45页 |
| ·两次洗脱片段的 PCR 扩增 | 第45-46页 |
| ·筛选阳性克隆的结果 | 第46-48页 |
| ·克隆子序列测序 | 第48-49页 |
| ·微卫星标记引物设计 | 第49页 |
| ·微卫星标记的遗传学属性 | 第49-53页 |
| ·讨论 | 第53-54页 |
| 第三章 南海鸢乌贼的种群遗传结构分析 | 第54-69页 |
| ·材料 | 第54-55页 |
| ·样品材料 | 第54-55页 |
| ·主要仪器 | 第55页 |
| ·主要试剂 | 第55页 |
| ·方法 | 第55-59页 |
| ·基因组 DNA 提取 | 第55页 |
| ·微卫星等位基因的 PCR 扩增 | 第55-57页 |
| ·聚丙烯酰胺凝胶电泳 | 第57页 |
| ·实验数据处理和分析 | 第57-59页 |
| ·实验结果 | 第59-66页 |
| ·南海鸢乌贼地理群体的遗传多样性 | 第59-63页 |
| ·鸢乌贼不同地理群体间的遗传差异 | 第63页 |
| ·多维尺度分析（MDS） | 第63-64页 |
| ·地理距离隔离检测 | 第64页 |
| ·个体分配分析 | 第64-66页 |
| ·讨论 | 第66-69页 |
| ·关于微卫星条带的精确读取 | 第66-67页 |
| ·种群遗传结构分析 | 第67-69页 |
| 第四章 总结 | 第69-71页 |
| 参考文献 | 第71-76页 |
| 致谢 | 第76-77页 |
| 附录 | 第77页 |
