| 摘要 | 第1-9页 |
| Abstract | 第9-12页 |
| 英文缩写 | 第12-13页 |
| 前言 | 第13-29页 |
| 一、 基于 DNA 水平的相关研究 | 第14-15页 |
| 二、 基于 RNA 水平的相关研究 | 第15-29页 |
| （一） 概述 | 第15-17页 |
| （二） 转录组研究技术简介 | 第17-21页 |
| （三） RA 的转录组研究 | 第21-29页 |
| 第一部分 基于 RNA SEQ 技术类风湿关节炎外周血基因表达谱 | 第29-85页 |
| 一、 引言 | 第29-36页 |
| （一） Hi seq 2000 工作流程 | 第29-31页 |
| （二） 基于 HiSeq 2000 的 RNA Seq 技术流程如下 | 第31-36页 |
| （三） 差异基因的生物信息学分析 | 第36页 |
| 二、 实验材料与方法 | 第36-42页 |
| （一） 材料 | 第36-37页 |
| （二） 实验方法 | 第37-42页 |
| 三、 结果 | 第42-83页 |
| （一） RNA 样品制备 | 第42-44页 |
| （二） RNA Seq 文库制备及测序结果 | 第44-65页 |
| （三） 差异基因的生物信息学分析 | 第65-78页 |
| （四） 确定验证实验的候选基因 | 第78-83页 |
| 四、 讨论 | 第83-84页 |
| 五、 结论 | 第84-85页 |
| 第二部分 大样本验证类风湿关节炎相关基因 | 第85-113页 |
| 一、 材料 | 第85-87页 |
| （一） 研究对象 | 第85-86页 |
| （二） 主要试剂 | 第86-87页 |
| （三） 主要仪器 | 第87页 |
| （四） 主要溶液的配制 | 第87页 |
| 二、 方法 | 第87-93页 |
| （一） 外周血总 RNA 提取和鉴定 | 第87-88页 |
| （二） cDNA 的合成 | 第88-89页 |
| （三） 引物设计、合成。 | 第89-93页 |
| （五） 统计学分析 | 第93页 |
| 三、 结果 | 第93-108页 |
| （一） 外周血总 RNA 的质量鉴定 | 第93-94页 |
| （二） 实时荧光定量 PCR | 第94-108页 |
| 四、 讨论 | 第108-112页 |
| （一） TSC1 | 第108-109页 |
| （二） CD14 | 第109-110页 |
| （三） AFF3 | 第110-111页 |
| （四） BIRC3 | 第111页 |
| （五） FCGBP | 第111页 |
| （六） RCAN1 和 GPRIN3 | 第111-112页 |
| 五、 结论 | 第112-113页 |
| 参考文献 | 第113-119页 |
| 综述 类风湿关节炎遗传学研究进展 | 第119-131页 |
| 参考文献 | 第125-131页 |
| 在读期间发表论文和参加科研工作情况说明 | 第131-132页 |
| 一、 已发表论文 | 第131页 |
| 二、 参加科研工作情况 | 第131-132页 |
| 致谢 | 第132-133页 |