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嗜铁钩端螺旋菌在砷胁迫条件下的蛋白质组学研究

中文摘要第1-9页
英文摘要(ABSTRACT)第9-12页
缩略词对照表(LIST OF ABBREVIATION)第12-13页
第一章 绪论第13-53页
     ·生物冶金第13页
     ·生物浸出和生物氧化过程中微生物的作用第13-19页
     ·酸性不溶金属硫化物的溶出途径:硫代硫酸盐途径第14页
     ·酸性可溶金属硫化物的溶出途径:多硫化合物途径第14-16页
     ·接触作用机制及非接触作用机制第16-18页
     ·生物冶金中的硫化学及其对反应动力学的影响第18-19页
     ·生物冶金在矿产开发中的应用现状第19-28页
     ·生物冶金的工艺类型第19-21页
     ·生物冶金的应用历史和发展现状第21-25页
     ·微生物氧化法预处理含砷难处理金矿第25-28页
       ·难处理金矿的定义及其重要性第25-26页
       ·生物氧化法预处理含砷难处理金矿的主要特点第26-27页
       ·生物氧化冶金工艺的常用微生物及嗜铁钩端螺旋菌的重要性第27-28页
     ·嗜铁钩端螺旋菌的生物学特征第28-30页
     ·形态特征第28-29页
     ·生长条件第29页
     ·分类地位第29-30页
     ·砷毒环境对生物浸矿的影响第30-36页
     ·砷毒离子耐受性对生物冶金工业的重要意义第30页
     ·砷的分布和毒性机理第30-31页
     ·砷的毒性机理及微生物的耐砷、解毒机制第31-36页
     ·蛋白质组学第36-49页
       ·蛋白质组学研究技术第36-45页
         ·蛋白质组学简介第36-37页
         ·蛋白质组学研究的主要研究策略第37-38页
         ·蛋白质组学研究常用的研究技术第38-45页
         ·双向电泳技术(2-DE)第38-40页
         ·双向电泳胶上蛋白点的检测第40-41页
         ·双向电泳胶板图像分析技术第41-42页
         ·差异蛋白点的检测技术第42-45页
       ·蛋白质组学研究手段在浸矿自养微生物领域的研究应用第45-49页
     ·本研究的主要内容及研究意义第49-50页
       ·本研究的主要目的第49-50页
     ·本研究的总体技术路线第50-53页
第二章 嗜铁钩端螺旋菌蛋白质组学研究手段的构建第53-86页
   ·实验材料与主要仪器第54-55页
     ·实验菌株第54-55页
     ·化学试剂第55页
     ·主要仪器设备第55页
   ·实验方法第55-74页
     ·嗜铁钩端螺旋菌菌体的培养第55页
     ·嗜铁钩端螺旋菌菌体蛋白样品的制备第55-57页
       ·细胞收集与洗涤第55-56页
       ·细胞裂解液的制备第56-57页
     ·蛋白质样品的纯化第57页
     ·蛋白质样品的定量第57-58页
     ·嗜铁钩端螺旋菌ML04菌株的双向电泳第58-72页
       ·第一向等电聚焦电泳IEF第58-63页
       ·IPG胶条的平衡第63-66页
       ·灌胶第66-68页
       ·第二向SDS-PAGE电泳第68-69页
       ·染色、显色第69-72页
     ·2-DE胶板图像的扫描、识别、分析第72-74页
   ·结果与讨论第74-83页
     ·使用不同细胞裂解方法的双向电泳及结果比较第74-75页
     ·使用不同纯化方法纯化细胞裂解液的双向电泳及结果比较第75-77页
     ·第一向等电聚焦应用不同上样参数的双向电泳及结果比较第77-79页
     ·等电聚焦中应用不同水化上样方法的双向电泳及结果比较第79-81页
     ·不同染色方法的比较第81-82页
     ·综合应用优化参数的双向电泳及结果比较第82-83页
   ·小结第83-86页
第三章 砷胁迫条件下嗜铁钩端螺旋菌蛋白质组学研究第86-111页
   ·实验材料与方法第86-92页
     ·菌种及耐砷菌株的驯化第86-87页
     ·材料与主要仪器第87-88页
     ·主要实验方法第88-92页
       ·砷胁迫条件下嗜铁钩端螺旋菌双向凝胶电泳第88页
       ·砷胁迫条件下双向电泳差异蛋白的分析比对和检出第88-89页
       ·切胶、差异点的胶内酶解,多肽溶液的提取第89-91页
       ·质谱分析及数据检索、分析第91-92页
   ·实验结果及分析第92-101页
     ·嗜铁钩端螺旋菌ML-04耐砷驯化实验结果第92页
     ·耐砷菌株与出发菌株的差异蛋白组比较结果第92-97页
       ·2-DE电泳差异点比较结果第93页
       ·差异蛋白点的质谱检测、识别、和分类结果第93-97页
     ·嗜铁钩端螺旋菌ML-04基因组中ARS砷抗性系统基因簇的分析第97-101页
   ·嗜铁钩端螺旋菌ML-04的耐砷机制讨论第101-111页
     ·L.FERRIPHILUMML-04菌株的ARS砷抗性系统第101-104页
     ·嗜铁钩端螺旋菌ML-04其它差异蛋白及可能的耐受机制第104-111页
       ·砷胁迫下表达量显著改变的信息存贮及处理蛋白及其与砷耐受能力的关系第105-106页
       ·砷胁迫下表达量显著改变的细胞生理过程及信号蛋白及其与砷耐受能力的关系第106-107页
       ·砷胁迫下表达量显著改变的新陈代谢相关蛋白及其与砷耐受能力的关系第107-111页
结论第111-114页
参考文献第114-124页
致谢第124-125页
已发表英文论文第125-151页
学位论文评阅及答辩情况表第151页

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