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不同倍性鱼线粒体全基因组及肝脏转录组中线粒体相关基因分析

摘要第1-7页
ABSTRACT第7-11页
目录第11-14页
第一章 文献综述第14-36页
   ·鱼类多倍体的研究进展第14-20页
     ·鱼类多倍化现象第15-16页
     ·人工多倍体鱼的研究第16-20页
   ·线粒体及线粒体DNA研究进展第20-32页
     ·线粒体DNA第21-25页
     ·核质互作与线粒体功能第25-28页
     ·鱼类线粒体DNA研究进展第28-32页
   ·转录组研究进展第32-34页
   ·本研究的目的和内容第34-36页
第二章 不同倍性鲫鲂线粒体全基因组研究第36-64页
   ·材料与方法第38-41页
     ·实验鱼第38页
     ·实验材料和总DNA的提取第38-39页
     ·引物设计和PCR扩增第39-40页
     ·全序列的拼接和分析第40-41页
   ·结果与分析第41-58页
     ·不同倍性鲫鲂和天然雌核发育红鲫的染色体数目第41-42页
     ·不同倍性鲫鲂和天然雌核发育红鲫线粒体全基因组测序第42页
     ·不同倍性鲫鲂和天然雌核发育红鲫线粒体基因组结构第42-47页
     ·不同倍性鲫鲂和天然雌核发育红鲫mtDNA的碱基含量分析第47-50页
     ·鲫鲂杂交子代鱼与其父母本线粒体全基因组的比较分析第50-56页
     ·系统进化树分析第56-58页
   ·讨论第58-64页
第三章 四倍体鲫鲂回交子代及其亲本线粒体ND2基因分析第64-81页
   ·材料与方法第65-68页
     ·实验材料第65页
     ·实验方法第65-68页
     ·序列比对和分析第68页
   ·结果与分析第68-78页
     ·四倍体鲫鲂回交子代倍性检测第68-71页
     ·PCR扩增结果第71页
     ·四倍体鲫鲂回交子代及其母本线粒体ND2基因序列分析第71-72页
     ·四倍体鲫鲂回交子代与亲本线粒体ND2基因的相似率比较第72-73页
     ·四倍体鲫鲂回交子代变异研究第73-76页
     ·三倍体鲫鲂和五倍体鲫鲂变异位点在其他鱼类中的情况第76-78页
   ·讨论第78-81页
第四章 四倍体鲫鲤及其亲本肝脏转录组线粒体相关核基因的数据分析第81-114页
   ·数据与方法第83-85页
     ·实验数据第83页
     ·目的基因的筛选第83页
     ·数据分析第83-85页
     ·序列分析第85页
   ·结果与分析第85-108页
     ·线粒体呼吸链相关基因的筛选第85-87页
     ·亲本红鲫和鲤鱼转录组中呼吸链相关基因在四倍体鲫鲤中的表达分析第87-92页
     ·四倍体鲫鲤及其亲本转录组中8个线粒体相关基因的氨基酸和基因树分析第92-98页
     ·线粒体编码蛋白基因及呼吸链相关核基因的同源性和分歧率比较分析第98-104页
     ·四倍体鲫鲤及其亲本转录组中其他线粒体相关核基因的分析第104-108页
   ·讨论第108-114页
第五章 翘嘴鲌和黄尾鲴线粒体全基因组研究第114-148页
   ·材料与方法第116-120页
     ·实验材料第116页
     ·总DNA的提取第116页
     ·引物设计、PCR扩增和序列测定第116-118页
     ·全序列拼接和分析第118-120页
   ·结果与分析第120-145页
     ·翘嘴鲌和黄尾鲴线粒体全基因组序列的测定第120-121页
     ·翘嘴鲌和黄尾鲴线粒体全基因组结构分析第121-124页
     ·翘嘴鲌和黄尾鲴线粒体基因组非编码区分析第124-134页
     ·翘嘴鲌和黄尾鲴线粒体基因组中蛋白质编码基因的分析第134-138页
     ·翘嘴鲌和黄尾鲴线粒体基因组中RNA基因及二级结构分析第138-143页
     ·翘嘴鲌和黄尾鲴在鲤科鱼类中的系统进化分析第143-145页
   ·讨论第145-148页
第六章 总结第148-154页
   ·天然雌核发育红鲫、三倍体鲫鲂和四倍体鲫鲂与亲本MTDNA的比较研究第149-150页
   ·四倍体鲫鲂回交子代与亲本线粒体ND2基因的比较研究第150-151页
   ·四倍体鲫鲤及其亲本肝脏转录组中线粒体相关核基因的研究第151-152页
   ·翘嘴鲌和黄尾鲴线粒体全进组研究第152页
   ·有待进一步深入研究的问题第152-154页
参考文献第154-176页
附录第176-180页
 缩略词表第176-177页
 实验主要试剂及配制方法第177-178页
 主要仪器第178-179页
 主要生物信息学软件第179-180页
博士学习期间发表的主要论文及获奖情况第180-181页
致谢第181-182页

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