| 摘要 | 第1-7页 |
| ABSTRACT | 第7-11页 |
| 目录 | 第11-14页 |
| 第一章 文献综述 | 第14-36页 |
| ·鱼类多倍体的研究进展 | 第14-20页 |
| ·鱼类多倍化现象 | 第15-16页 |
| ·人工多倍体鱼的研究 | 第16-20页 |
| ·线粒体及线粒体DNA研究进展 | 第20-32页 |
| ·线粒体DNA | 第21-25页 |
| ·核质互作与线粒体功能 | 第25-28页 |
| ·鱼类线粒体DNA研究进展 | 第28-32页 |
| ·转录组研究进展 | 第32-34页 |
| ·本研究的目的和内容 | 第34-36页 |
| 第二章 不同倍性鲫鲂线粒体全基因组研究 | 第36-64页 |
| ·材料与方法 | 第38-41页 |
| ·实验鱼 | 第38页 |
| ·实验材料和总DNA的提取 | 第38-39页 |
| ·引物设计和PCR扩增 | 第39-40页 |
| ·全序列的拼接和分析 | 第40-41页 |
| ·结果与分析 | 第41-58页 |
| ·不同倍性鲫鲂和天然雌核发育红鲫的染色体数目 | 第41-42页 |
| ·不同倍性鲫鲂和天然雌核发育红鲫线粒体全基因组测序 | 第42页 |
| ·不同倍性鲫鲂和天然雌核发育红鲫线粒体基因组结构 | 第42-47页 |
| ·不同倍性鲫鲂和天然雌核发育红鲫mtDNA的碱基含量分析 | 第47-50页 |
| ·鲫鲂杂交子代鱼与其父母本线粒体全基因组的比较分析 | 第50-56页 |
| ·系统进化树分析 | 第56-58页 |
| ·讨论 | 第58-64页 |
| 第三章 四倍体鲫鲂回交子代及其亲本线粒体ND2基因分析 | 第64-81页 |
| ·材料与方法 | 第65-68页 |
| ·实验材料 | 第65页 |
| ·实验方法 | 第65-68页 |
| ·序列比对和分析 | 第68页 |
| ·结果与分析 | 第68-78页 |
| ·四倍体鲫鲂回交子代倍性检测 | 第68-71页 |
| ·PCR扩增结果 | 第71页 |
| ·四倍体鲫鲂回交子代及其母本线粒体ND2基因序列分析 | 第71-72页 |
| ·四倍体鲫鲂回交子代与亲本线粒体ND2基因的相似率比较 | 第72-73页 |
| ·四倍体鲫鲂回交子代变异研究 | 第73-76页 |
| ·三倍体鲫鲂和五倍体鲫鲂变异位点在其他鱼类中的情况 | 第76-78页 |
| ·讨论 | 第78-81页 |
| 第四章 四倍体鲫鲤及其亲本肝脏转录组线粒体相关核基因的数据分析 | 第81-114页 |
| ·数据与方法 | 第83-85页 |
| ·实验数据 | 第83页 |
| ·目的基因的筛选 | 第83页 |
| ·数据分析 | 第83-85页 |
| ·序列分析 | 第85页 |
| ·结果与分析 | 第85-108页 |
| ·线粒体呼吸链相关基因的筛选 | 第85-87页 |
| ·亲本红鲫和鲤鱼转录组中呼吸链相关基因在四倍体鲫鲤中的表达分析 | 第87-92页 |
| ·四倍体鲫鲤及其亲本转录组中8个线粒体相关基因的氨基酸和基因树分析 | 第92-98页 |
| ·线粒体编码蛋白基因及呼吸链相关核基因的同源性和分歧率比较分析 | 第98-104页 |
| ·四倍体鲫鲤及其亲本转录组中其他线粒体相关核基因的分析 | 第104-108页 |
| ·讨论 | 第108-114页 |
| 第五章 翘嘴鲌和黄尾鲴线粒体全基因组研究 | 第114-148页 |
| ·材料与方法 | 第116-120页 |
| ·实验材料 | 第116页 |
| ·总DNA的提取 | 第116页 |
| ·引物设计、PCR扩增和序列测定 | 第116-118页 |
| ·全序列拼接和分析 | 第118-120页 |
| ·结果与分析 | 第120-145页 |
| ·翘嘴鲌和黄尾鲴线粒体全基因组序列的测定 | 第120-121页 |
| ·翘嘴鲌和黄尾鲴线粒体全基因组结构分析 | 第121-124页 |
| ·翘嘴鲌和黄尾鲴线粒体基因组非编码区分析 | 第124-134页 |
| ·翘嘴鲌和黄尾鲴线粒体基因组中蛋白质编码基因的分析 | 第134-138页 |
| ·翘嘴鲌和黄尾鲴线粒体基因组中RNA基因及二级结构分析 | 第138-143页 |
| ·翘嘴鲌和黄尾鲴在鲤科鱼类中的系统进化分析 | 第143-145页 |
| ·讨论 | 第145-148页 |
| 第六章 总结 | 第148-154页 |
| ·天然雌核发育红鲫、三倍体鲫鲂和四倍体鲫鲂与亲本MTDNA的比较研究 | 第149-150页 |
| ·四倍体鲫鲂回交子代与亲本线粒体ND2基因的比较研究 | 第150-151页 |
| ·四倍体鲫鲤及其亲本肝脏转录组中线粒体相关核基因的研究 | 第151-152页 |
| ·翘嘴鲌和黄尾鲴线粒体全进组研究 | 第152页 |
| ·有待进一步深入研究的问题 | 第152-154页 |
| 参考文献 | 第154-176页 |
| 附录 | 第176-180页 |
| 缩略词表 | 第176-177页 |
| 实验主要试剂及配制方法 | 第177-178页 |
| 主要仪器 | 第178-179页 |
| 主要生物信息学软件 | 第179-180页 |
| 博士学习期间发表的主要论文及获奖情况 | 第180-181页 |
| 致谢 | 第181-182页 |