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钩端螺旋体Homoserine O-acetyltransferase结构解析与催化机理研究,人的Coactosin-like Protein结构解析

致谢第1-3页
中文摘要第3-4页
Abstract第4-5页
目录第5-9页
第一部分 钩端螺旋体homoserine O-acetyltransferase(HTA)的结构解析与催化机理研究第9-54页
 第一章:背景知识第10-20页
   ·HTA在Methionine合成途径中的位置第10-11页
   ·几类已知结构的转乙酰酶第11-16页
     ·丝氨酸乙酰转移酶第11-13页
     ·组氨酸乙酰转移酶第13-14页
     ·胆碱乙酰转移酶第14-15页
     ·肉毒碱乙酰转移酶第15-16页
   ·a/β水解酶超家族第16-18页
   ·HTA研究进展第18-19页
   ·本课题的意义第19-20页
 第二章:质粒构建,蛋白表达和纯化第20-24页
   ·HTA质粒构建第20-21页
   ·LiHTA蛋白表达第21页
     ·Native的LiHTA蛋白表达第21页
     ·硒代LiHTA蛋白表达第21页
       ·经典的硒代蛋白表达方法第21页
       ·简化的硒代蛋白表达方法第21页
   ·HTA蛋白纯化第21-24页
     ·菌体破碎第21-22页
     ·DEAE-Sephadex阴离子交换柱层析第22页
     ·Superdex G75分子筛层析第22-24页
 第三章 LiHTA转乙酰基的活性测定第24-27页
   ·酶活测定方法第24页
   ·试验结果及讨论第24-27页
     ·LiHTA纯化过程中的酶活测定第24-25页
     ·LiHTA对底物的Km值第25页
     ·LiHTA的失活第25-26页
     ·保护剂对LiHTA酶活的作用第26-27页
 第四章:晶体生长、数据收集和结构解析第27-31页
   ·晶体生长第27页
   ·数据收集第27页
   ·结构解析第27-29页
     ·数据分析第28页
     ·寻找硒原子的位置第28-29页
     ·相位解析第29页
     ·模型搭建第29页
       ·自动建模第29页
       ·手动建模第29页
   ·结构修正第29-30页
   ·模型质量分析第30-31页
 第五章:结构与功能结果分析第31-42页
   ·LiHTA整体结构第31-32页
   ·HTA家族的系统进化树第32-38页
   ·HTA家族的序列保守性第38页
   ·LiHTA催化位点第38-39页
   ·催化三联体中的H344和S153处于双构象第39-42页
 第六章:结构与功能结果讨论第42-48页
   ·aL4的disorder与LiHTA在溶液中的单体状态相关第42-44页
   ·推测LiHTA的催化机理第44-46页
   ·尚未解决的问题第46-48页
     ·底物特异性第46-47页
     ·中间态和催化机理第47-48页
 参考文献(1)第48-54页
第二部分 人的Coactosin-like Protein(CLP)结构解析第54-95页
 第一章 前言第55-64页
   ·肌动蛋白结合蛋白第55-61页
   ·ADF-H结构域第61-62页
   ·CLP介绍第62-64页
 第二章:基因克隆、表达和蛋白纯化第64-71页
   ·试剂第64页
   ·方法第64-68页
     ·hCLP基因的PCR扩增第64页
     ·PCR产物的纯化第64页
     ·pMD 18-T-hCLP的构建第64页
     ·pMD 18-T-hCLP阳性克隆的筛选第64-65页
     ·重组蛋白在pET22b(+)载体中的表达第65-66页
     ·重组蛋白的表达纯化第66-68页
     ·蛋白浓度测定第68页
     ·质谱分析第68页
   ·结果和讨论第68-71页
     ·基因克隆和表达载体的构建第68页
     ·hCLP的纯化第68-69页
     ·浓度测定第69页
     ·质谱分析第69-71页
 第三章:晶体生长第71-73页
 第四章:数据收集、结构解析和模型修正第73-80页
   ·数据收集第73-74页
   ·结构解析第74-77页
     ·分子置换法第74页
     ·多波长反常散射法第74-76页
     ·分子置换法解其它两套数据的结构第76-77页
   ·模型修正第77-78页
     ·2.8(?)的MAD数据修正第77-78页
     ·高分辨率数据的修正第78页
   ·模型质量分析第78-80页
 第五章:hCLP结构解析的结果和讨论第80-87页
   ·hCLP整体结构第80页
   ·三个hCLP的结构比较和晶体堆积分析第80-81页
   ·所有目前已知的CLP的结构比较第81-82页
   ·hCLP与其他ABP的结构比较第82-83页
   ·从结构解释CLP与actin结合的特异性第83-85页
   ·与F—actin和5LO结合位点的相互关系第85-86页
   ·对Capping蛋白的阻碍并不影响actin的聚合第86-87页
 第六章:前瞻——关于hCLP还未解决的问题第87-90页
   ·CLP与F—actin的结合模式:为何不与G—actin结合第87-89页
   ·coactosin/CLP如何抑制capping protein的活性第89页
   ·CLP和5LO的结合方式第89-90页
 参考文献(2)第90-95页
附录一:常用试剂和溶液,常规实验方法第95-98页
附录二:博士在读期间论文发表第98页

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