基于分子动力学方法研究残基突变对P53构象变化的影响
| 中文摘要 | 第1-8页 |
| ABSTRACT | 第8-11页 |
| 第一章 绪论 | 第11-20页 |
| ·肿瘤抑制因子 P53 | 第11页 |
| ·P53 蛋白的结构与功能 | 第11-16页 |
| ·P53 蛋白的结构 | 第11-15页 |
| ·P53 的功能 | 第15-16页 |
| ·P53 残基突变 | 第16-19页 |
| ·P53 突变类型 | 第16-17页 |
| ·P53 突变体的半衰期 | 第17-18页 |
| ·245、248 和 249 位点突变 | 第18-19页 |
| ·本论文的主要研究内容 | 第19-20页 |
| 第二章 分子动力学模拟 | 第20-25页 |
| ·分子动力学模拟简介 | 第20页 |
| ·分子动力学模拟原理 | 第20-23页 |
| ·分子力场 | 第21页 |
| ·经验势函数 | 第21-22页 |
| ·分子动力学模拟方法 | 第22-23页 |
| ·应用及发展 | 第23-24页 |
| ·GROMACS 模拟软件 | 第24-25页 |
| 第三章 模拟体系和方法 | 第25-31页 |
| ·研究对象 | 第25页 |
| ·模拟方法 | 第25-26页 |
| ·分析方法 | 第26-31页 |
| ·自由能计算 | 第26-27页 |
| ·二面角分析 | 第27-28页 |
| ·二级结构 | 第28-29页 |
| ·三级结构分析 | 第29-30页 |
| ·构象异质性分析 | 第30-31页 |
| 第四章 结果和分析 | 第31-46页 |
| ·模拟收敛性分析 | 第31-36页 |
| ·残基突变对肽段二级结构的影响 | 第36-39页 |
| ·体系残基主链二面角的平均力势分布 | 第36-38页 |
| ·体系二级结构形成情况 | 第38-39页 |
| ·残基突变对 P53 肽段三级结构的影响 | 第39-41页 |
| ·残基突变对 P53 肽段构象异质性的影响 | 第41-43页 |
| ·残基突变对 P53 肽段结构稳定性的影响 | 第43-45页 |
| ·本章小结 | 第45-46页 |
| 第五章 总结及展望 | 第46-48页 |
| 参考文献 | 第48-53页 |
| 攻读硕士学位期间发表的学术论文 | 第53-54页 |
| 致谢 | 第54页 |
