蛋白质二级结构的建模与预测
| 摘要 | 第1-9页 |
| ABSTRACT | 第9-10页 |
| 第一章 绪论 | 第10-15页 |
| ·研究背景 | 第10-14页 |
| ·二十一世纪的生物信息学 | 第10-11页 |
| ·生物信息学研究现状 | 第11-12页 |
| ·热点研究领域 | 第12-14页 |
| ·论文的主要工作与创新 | 第14页 |
| ·论文结构 | 第14-15页 |
| 第二章 蛋白质结构预测 | 第15-29页 |
| ·蛋白质结构预测研究的意义 | 第15-16页 |
| ·蛋白质结构简介 | 第16-22页 |
| ·蛋白质的组成 | 第16-17页 |
| ·蛋白质的构象 | 第17-21页 |
| ·蛋白质的二级结构种类 | 第21-22页 |
| ·蛋白质二级结构预测的研究现状 | 第22-24页 |
| ·按时期划分的二级结构预测方法 | 第22-23页 |
| ·按模型理论划分的二级结构预测方法 | 第23-24页 |
| ·蛋白质结构预测的困难与挑战 | 第24页 |
| ·蛋白质结构预测中常用的数据收集与划分技术 | 第24-28页 |
| ·蛋白质数据库 | 第25-26页 |
| ·常用数据集 | 第26-27页 |
| ·训练集与测试集的划分 | 第27-28页 |
| ·模型检验方法 | 第28页 |
| ·本章小结 | 第28-29页 |
| 第三章 蛋白质结构预测的隐式半马尔科夫链模型 | 第29-48页 |
| ·问题描述 | 第29页 |
| ·HMM基本理论 | 第29-36页 |
| ·Markov链 | 第29-30页 |
| ·HMM基本概念 | 第30-31页 |
| ·HMM基本算法 | 第31-36页 |
| ·蛋白质二级结构预测的隐式半马尔科夫模型 | 第36-44页 |
| ·模型描述 | 第37-42页 |
| ·计算与推论 | 第42-43页 |
| ·模型中的几点考虑 | 第43-44页 |
| ·实验结果和分析 | 第44-47页 |
| ·本章小结 | 第47-48页 |
| 第四章 局部相似的结构相似性评估 | 第48-60页 |
| ·问题描述 | 第48页 |
| ·基本构想 | 第48-58页 |
| ·实验结果与分析 | 第58-59页 |
| ·局部相似的结构相似性 | 第58-59页 |
| ·专家系统测试 | 第59页 |
| ·本章小结 | 第59-60页 |
| 第五章 蛋白质二级结构的系统误差 | 第60-66页 |
| ·问题描述 | 第60-61页 |
| ·序列与结构 | 第60-61页 |
| ·蛋白质本身的构象异变现象 | 第61页 |
| ·实验方法与结果 | 第61-65页 |
| ·结构统计 | 第62-63页 |
| ·实验结果 | 第63-64页 |
| ·分析讨论 | 第64-65页 |
| ·本章小结 | 第65-66页 |
| 第六章 结束语 | 第66-67页 |
| ·全文工作总结 | 第66页 |
| ·工作展望 | 第66-67页 |
| 致谢 | 第67-68页 |
| 附录 A:攻读硕士期间发表的论文 | 第68-69页 |
| 附录 B: HSMMs模型测试结果数据集 | 第69-70页 |
| 参考文献 | 第70-73页 |
