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大肠杆菌来源核酶P M1亚单位对人巨细胞病毒磷酸转移酶基因mRNA片段的体外切割研究

摘要第1-8页
ABSTRACT第8-9页
一 前言第9-19页
 1 核酶背景简介第9-16页
   ·RNASE P介绍第10-13页
     ·RNase P RNA第10-12页
     ·RNase P protein第12-13页
   ·RNASE P作用底物共同的结构特征第13-15页
   ·金属阳离子对RNASE P作用的影响第15页
   ·EGS及M1GS的提出第15-16页
 2 HCMV简介第16-18页
   ·病毒学特征及危害第16-17页
   ·磷酸转移酶UL97基因介绍第17-18页
 3 课题意义第18-19页
二 技术路线第19-20页
三 实验仪器与材料第20-23页
 1 主要仪器第20页
 2 实验材料第20-23页
   ·质粒和菌种第20-21页
   ·寡核苷酸片段第21页
   ·主要试剂第21页
   ·其它主要试剂的配方第21-23页
四 实验方法第23-40页
 1 HCMV UL97基因的克隆第23-27页
   ·引物设计第23页
   ·PCR扩增第23-24页
   ·UL97基因目的片段与PGEM-3Z质粒载体的双酶切、去磷酸化第24-26页
   ·UL97基因目的片段与PGEM-3Z质粒载体的连接第26页
   ·UL97亚克隆质粒的转化、筛选、鉴定和大量制备第26-27页
 2 GS设计第27-28页
   ·理论高引导活性GS设计要求第27-28页
   ·UL97基因中符合GS设计要求的位点第28页
 3 M1GS的突变、克隆及其相应底物片段的选择和克隆第28-34页
   ·M1GS的突变及克隆第28-30页
   ·其余7个M1GS的克隆第30-32页
   ·M1GS T3(NO BRIDGE)的克隆第32-33页
   ·GS所在位置相应底物片段的选择和克隆第33-34页
 4 M1GS及底物DNA片段(转录模板)的制备第34-36页
   ·M1GS DNA模板的制备第34-35页
     ·M1GS亚克隆质粒的Hind Ⅲ酶切第34页
     ·M1GS亚克隆质粒Hind Ⅲ酶切后片段的末端平滑处理第34-35页
   ·底物DNA片段转录模板的制备第35页
   ·RNA MARKER的制备第35-36页
 5 M1GS及其底物片段的体外转录、体外切割和电泳验证第36-40页
   ·M1GS的体外转录第36页
   ·底物的体外转录第36-37页
   ·M1GS及底物转录模板的检验第37-38页
   ·体外切割与电泳检测第38-40页
五 结果与分析第40-56页
 1 HCMV磷酸转移酶UL97基因的克隆与鉴定第40-41页
   ·PU97质粒的构建第40-41页
   ·PU97质粒的鉴定第41页
 2 M1GS的突变、克隆及鉴定第41-45页
   ·M1GS的突变及克隆第41-42页
   ·突变后M1GS克隆质粒的鉴定第42-43页
   ·其余7个M1GS的克隆与鉴定第43-44页
   ·M1GS T3(NO BRIDGE)的克隆与鉴定第44-45页
 3 PU97-D2质粒的构建与鉴定第45-47页
   ·PU97-D2质粒的构建第45-46页
   ·PU97-D2亚克隆质粒的鉴定第46-47页
 4 M1GS及底物DNA片段(转录模板)的制备第47-49页
   ·M1GS转录模板的制备第47-48页
   ·M1GS T3(NO BRIDGE)转录模板的制备第48页
   ·底物DNA片段转录模板的制备第48-49页
 5 M1GS及其底物片段的体外转录第49-51页
   ·M1GS的体外转录第49-50页
   ·M1GS T3及M1GS T3(NO BRIDGE)的体外转录第50页
   ·底物片段的体外转录第50-51页
 6 人工核酶MIGS对底物的体外切割第51-56页
   ·体外切割产物的理论预计第51页
   ·核酶与底物的体外切割产物电泳检测结果第51-56页
     ·M1GS C1、C2及M1GST1~T6对D1、D2底物的体外切割产物电泳结果第51-53页
     ·M1GS T3(非CCA末端)对D2片段的体外切割产物电泳结果第53-54页
     ·M1GS T3(no bridge)对D2片段的体外切割产物电泳结果第54-56页
六 讨论第56-65页
 1 大肠杆菌来源RNASE P的催化反应机理第56-57页
 2 大肠杆菌来源RNASE P催化亚单位M1 RNA的体外切割活性影响因素第57-65页
   ·底物片段第57-59页
   ·金属阳离子第59-61页
   ·底物与核酶的比例第61页
   ·CCA末端必要性第61页
   ·连接序列BRIDGE的重要性第61-65页
七 小结第65-66页
八 附录第66-74页
 附录1 UL97基因全长测序结果(序列)第66-70页
 附录2 GENEBANK公布UL97基因全序列第70-72页
 附录3 M1GS T3克隆质粒测序结果第72-73页
 附录4 PFL117质粒测序结果第73-74页
九 参考文献第74-77页
十 致谢第77页

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