| 中文摘要 | 第1-7页 |
| 英文摘要 | 第7-10页 |
| 目录 | 第10-15页 |
| 第一章 文献综述 | 第15-44页 |
| 第一节 杂种优势机理研究进展 | 第15-25页 |
| ·杂种优势的遗传基础 | 第15-17页 |
| ·显性假说 | 第15-16页 |
| ·超显性假说 | 第16-17页 |
| ·上位性假说 | 第17页 |
| ·经典假说的分子验证 | 第17-20页 |
| ·显性假说的验证 | 第17-18页 |
| ·超显性假说的验证 | 第18页 |
| ·上位性假说的验证 | 第18-19页 |
| ·显性、超显性和上位性假说的统一 | 第19-20页 |
| ·多倍体与杂种优势 | 第20页 |
| ·杂种优势的生理生化基础 | 第20-21页 |
| ·物质积累与杂种优势 | 第20-21页 |
| ·酶及生化代谢与杂种优势 | 第21页 |
| ·生长素与杂种优势 | 第21页 |
| ·基因网络系统与杂种优势 | 第21-22页 |
| ·基因及基因表达调控与杂种优势 | 第22-25页 |
| ·基因组DNA含量与杂种优势的关系 | 第22-23页 |
| ·基因组甲基化水平与杂种优势 | 第23页 |
| ·基因表达差异与杂种优势 | 第23-24页 |
| ·基因表达模式与杂种优势 | 第24-25页 |
| ·杂种优势的预测 | 第25页 |
| 第二节 卡尔文循环的调节及改良 | 第25-31页 |
| ·卡尔文循环 | 第25-26页 |
| ·Calvin循环的调节 | 第26-28页 |
| ·自动催化作用 | 第26-27页 |
| ·光调节作用 | 第27页 |
| ·光合产物输出速率的调节 | 第27-28页 |
| ·通过卡尔文循环改良农作物 | 第28-31页 |
| 第三节 差异表达基因的分离方法 | 第31-38页 |
| ·序列克隆法 | 第31-32页 |
| ·基于基因功能的克隆方法 | 第32页 |
| ·根据基因表达的蛋白质 | 第32页 |
| ·根据基因的表型突变互补功能 | 第32页 |
| ·转座子或T-DNA标签法 | 第32-33页 |
| ·图位克隆法 | 第33页 |
| ·差异表达分析法 | 第33-36页 |
| ·cDNA-RAPD分析法 | 第33页 |
| ·差异显示 | 第33-34页 |
| ·抑制消减杂交法 | 第34页 |
| ·cDNA-AFLP | 第34页 |
| ·基因表达系列分析 | 第34-35页 |
| ·cDNA微阵列 | 第35-36页 |
| ·cDNA末端快速扩增技术 | 第36-38页 |
| 第四节 水稻功能基因组计划 | 第38-44页 |
| ·水稻种植概况 | 第38页 |
| ·水稻基因组特征 | 第38页 |
| ·水稻功能基因组计划 | 第38-42页 |
| ·准备水稻功能基因组研究所需要的材料 | 第39页 |
| ·水稻转化体系的建立与完善 | 第39页 |
| ·表达模式研究 | 第39-40页 |
| ·生物信息学 | 第40页 |
| ·发掘有重要应用价值的基因 | 第40-42页 |
| ·功能基因组在水稻育种中的应用 | 第42页 |
| ·整合全球水稻功能基因组资源 | 第42页 |
| ·本研究的目的和意义 | 第42-44页 |
| 第二章 杂种与亲本间差异表达基因的分离克隆 | 第44-64页 |
| 前言 | 第44页 |
| 1.材料与方法 | 第44-50页 |
| ·材料种植 | 第44页 |
| ·总RNA的提取 | 第44-45页 |
| ·反转录 | 第45页 |
| ·双链cDNA的合成 | 第45页 |
| ·双链cDNA的酶切 | 第45-46页 |
| ·连接反应 | 第46页 |
| ·预扩增 | 第46-47页 |
| ·扩增 | 第47页 |
| ·聚丙烯酰胺凝胶电泳 | 第47-48页 |
| ·银染 | 第48页 |
| ·PCR产物的回收 | 第48-49页 |
| ·PCR产物克隆 | 第49页 |
| ·DH5a感受态细胞的制备与转化 | 第49页 |
| ·阳性克隆的鉴定 | 第49-50页 |
| ·接头及引物序列 | 第50页 |
| 2.结果与分析 | 第50-59页 |
| ·总RNA的检测 | 第50-51页 |
| ·双链cDNA的质量检测 | 第51页 |
| ·酶切产物的预扩增 | 第51-52页 |
| ·杂种与亲本基因表达谱的差异分析 | 第52-54页 |
| ·部分差异片段的克隆、测序及BLAST分析 | 第54-59页 |
| ·差异表达基因的验证 | 第59页 |
| ·差异表达基因的染色体定位 | 第59页 |
| 3.讨论 | 第59-64页 |
| ·cDNA-AFLP技术的优点 | 第59-61页 |
| ·杂种与亲本间的基因表达差异 | 第61-62页 |
| ·基因差异表达类型与经典遗传理论 | 第62-63页 |
| ·差异表达基因在染色体上的分布 | 第63-64页 |
| 第三章 水稻磷酸核酮糖激酶基因OsPrk的克隆、表达及生化特性分析 | 第64-82页 |
| 前言 | 第64页 |
| 1.材料与方法 | 第64-72页 |
| ·实验材料 | 第64-65页 |
| ·材料处理 | 第65页 |
| ·RT-PCR | 第65-66页 |
| ·水稻基因组DNA的提取 | 第66页 |
| ·Southern印迹 | 第66-68页 |
| ·水稻总DNA的酶切 | 第66页 |
| ·转膜 | 第66-67页 |
| ·Southern杂交 | 第67-68页 |
| ·总RNA的提取 | 第68-69页 |
| ·Northern印迹 | 第69-70页 |
| ·甲醛变性琼脂糖凝胶的制备 | 第69页 |
| ·RNA样品制备 | 第69页 |
| ·电泳及转膜 | 第69-70页 |
| ·膜的再利用 | 第70页 |
| ·RACE | 第70-72页 |
| ·酶活性测定 | 第72页 |
| ·粗酶液提取缓冲液 | 第72页 |
| ·粗酶液提取 | 第72页 |
| ·PRKase活性测定 | 第72页 |
| 2.结果与分析 | 第72-80页 |
| ·发水稻OsPrk基因的克隆及序列分析 | 第72-75页 |
| ·Southern杂交及染色体定位 | 第75-77页 |
| ·OsPrk基因在杂种与亲本间的差异表达 | 第77页 |
| ·OsPrk基因的表达部位 | 第77页 |
| ·光诱导OsPrk基因的表达 | 第77-78页 |
| ·不同处理对Rprk表达的影响 | 第78-79页 |
| ·水稻PRKase生化特性 | 第79-80页 |
| 3.讨论 | 第80-82页 |
| 第四章 水稻景天庚酮糖-1，7-二磷酸酶基因的克隆及表达分析 | 第82-97页 |
| 前言 | 第82页 |
| 1.材料与方法 | 第82-83页 |
| ·材料与材料处理 | 第82页 |
| ·DNA和RNA的提取 | 第82页 |
| ·RT-PCR和RACE方法 | 第82页 |
| ·Southern和Northern blot | 第82页 |
| ·PCR产物的回收、克隆、转化 | 第82-83页 |
| ·SBPase酶活力测定 | 第83页 |
| 2.结果与分析 | 第83-95页 |
| ·水稻OsSbp基因全长cDNA及基因组编码序列的分离 | 第83页 |
| ·OsSbp序列分析 | 第83-85页 |
| ·氨基酸序列分析 | 第85-87页 |
| ·5’上游光调节序列的识别及特征分析 | 第87-89页 |
| ·Southern杂交 | 第89-90页 |
| ·OsSbp基因组织分布 | 第90页 |
| ·光调节OsSbp基因的表达 | 第90-91页 |
| ·OsSbp基因在杂种与亲本间的差异表达 | 第91页 |
| ·不同处理对OsSbp基因表达的影响 | 第91-93页 |
| ·Calvin循环基因5’上游序列调节结构域的预测和比较 | 第93-95页 |
| 3.讨论 | 第95-97页 |
| ·OsSbp基因的克隆及光调节序列的识别 | 第95页 |
| ·不同处理对Rsbp基因转录和酶活力的影响 | 第95-97页 |
| 第五章 总讨论 | 第97-100页 |
| 参考文献 | 第100-113页 |
| 附录Ⅰ 杂种与亲本之间的部分差异表达基因片段 | 第113-145页 |
| 附录Ⅱ 文中缩写说明 | 第145-146页 |
| 在读期间发表和待发表的论文 | 第146-147页 |
| 致谢 | 第147页 |
