| 中文摘要 | 第1-5页 |
| 英文摘要 | 第5-10页 |
| 1 绪论 | 第10-16页 |
| ·引言 | 第10页 |
| ·课题研究背景及现状 | 第10-14页 |
| ·人类基因组计划 | 第10-11页 |
| ·本课题研究的发展及现状 | 第11-14页 |
| ·论文内容安排 | 第14-16页 |
| 2 分形及生物信息学相关知识 | 第16-30页 |
| ·分形简介 | 第16-19页 |
| ·分形的定义 | 第16-18页 |
| ·自相似性 | 第18-19页 |
| ·分形维数 | 第19-23页 |
| ·Hausdorff 维数 | 第20-21页 |
| ·维数的其它定义 | 第21-23页 |
| ·生物信息学相关知识 | 第23-30页 |
| ·生物信息学及其研究内容 | 第23-26页 |
| ·生物信息学相关术语简介 | 第26-27页 |
| ·分子生物信息学数据库简介 | 第27-30页 |
| 3 DNA 序列的混沌游戏图形表示 | 第30-46页 |
| ·引言 | 第30页 |
| ·DNA 序列的混沌游戏表示法 | 第30-33页 |
| ·混沌游戏简介 | 第30-31页 |
| ·DNA 序列的混沌游戏表示图形的产生 | 第31-33页 |
| ·DNA 序列CGR 图形的基本性质 | 第33-35页 |
| ·CGR 图形的频数矩阵及其应用 | 第35-39页 |
| ·CGR 图形的频数矩阵 | 第35页 |
| ·n-长子序列的频数分布的分析 | 第35-38页 |
| ·DNA 序列结构分析与探讨 | 第38-39页 |
| ·蛋白质序列CGR 图形的一种表示方法 | 第39-41页 |
| ·DNA 序列的其它分形图形表示方法 | 第41-44页 |
| ·Hao 序列分形表示方法 | 第41-42页 |
| ·混沌自动机(Chaos Automata，简称CA) | 第42-44页 |
| ·几种方法的比较 | 第44页 |
| ·小结 | 第44-46页 |
| 4 基于混沌游戏表示的DNA 序列的分形特征 | 第46-64页 |
| ·引言 | 第46页 |
| ·DNA 序列CGR 图形迭代函数系统的讨论 | 第46-51页 |
| ·迭代函数系统(IFS) | 第46-47页 |
| ·CGR 图形的收缩系数 | 第47-51页 |
| ·基于CGR 图形的DNA 序列的R/S 分析 | 第51-56页 |
| ·R/S 分析法和Hurst 指数概述 | 第51-52页 |
| ·Hurst 指数的计算方法 | 第52-53页 |
| ·计算结果及分析 | 第53-56页 |
| ·DNA 序列CGR 图形的信息维数及应用 | 第56-58页 |
| ·信息维数 | 第56-57页 |
| ·编码区与非编码区的信息维数的比较 | 第57-58页 |
| ·结论 | 第58页 |
| ·基于CGR 图形化的DNA 序列的相似性分析 | 第58-63页 |
| ·相似性度量 | 第58-59页 |
| ·不同物种的相同组织的基因组序列的相似性计算 | 第59-61页 |
| ·同一基因组的不同片段序列的相似性计算 | 第61页 |
| ·随机选取的基因组序列的相似性计算 | 第61-63页 |
| ·结论 | 第63页 |
| ·小结 | 第63-64页 |
| 5 DNA 序列CGR 图形的多重分形研究 | 第64-78页 |
| ·引言 | 第64-65页 |
| ·DNA 序列CGR 图形的多重分形分析 | 第65-67页 |
| ·描述多重分形的参量 | 第65-66页 |
| ·DNA 序列CGR 图形的多重分形计算 | 第66-67页 |
| ·CGR 图形的多重分形计算中的几点讨论 | 第67-73页 |
| ·广义分维与简单分维的关系 | 第67-69页 |
| ·满足标度不变性的范围选择 | 第69-71页 |
| ·权重因子q 的选择范围 | 第71-73页 |
| ·多重分形谱图及其分析 | 第73-76页 |
| ·谱图的参数意义 | 第73页 |
| ·谱图的绘制及分析 | 第73-74页 |
| ·不同序列同尺度的多重分形谱比较 | 第74-75页 |
| ·不同序列不同尺度的多重分形谱比较 | 第75-76页 |
| ·小结 | 第76-78页 |
| 6 总结与展望 | 第78-80页 |
| ·论文工作总结 | 第78页 |
| ·问题与展望 | 第78-80页 |
| 致谢 | 第80-81页 |
| 参考文献 | 第81-84页 |
| 附录 | 第84-86页 |