| 摘要 | 第1-10页 |
| Abstract | 第10-12页 |
| 前言 | 第12-19页 |
| 1. 水稻条纹病毒病害流行与损失 | 第12页 |
| 2. 水稻条纹病毒病原性质及病理观察 | 第12-13页 |
| 3. 准种结构与致病性分化 | 第13-14页 |
| 4. 水稻条纹病毒基因组结构及其编码的蛋白 | 第14-15页 |
| 5. 水稻条纹病毒遗传变异 | 第15-16页 |
| 6.R NA 重组 | 第16-17页 |
| 7. 生物信息学常用的几种软件及网站 | 第17-18页 |
| 8. 本研究的目的及意义 | 第18-19页 |
| 第一章 水稻条纹病毒致病性分化与差异分析 | 第19-30页 |
| 1 材料与方法 | 第19页 |
| ·介体昆虫及毒源 | 第19页 |
| ·供试水稻品种 | 第19页 |
| ·传毒及发病统计 | 第19页 |
| ·致病性评价 | 第19页 |
| 2 结果与分析 | 第19-28页 |
| ·水稻条纹病毒致病性测定及分化特点 | 第19-22页 |
| ·水稻条纹病毒不同分离物间的致病性差异分析 | 第22-24页 |
| ·不同分离物在发病率上的差异分析 | 第22页 |
| ·不同分离物在发病时间上的差异分析 | 第22页 |
| ·不同分离物在症状表现上的差异分析 | 第22-23页 |
| ·不同分离物对灰飞虱传毒影响的差异分析 | 第23-24页 |
| ·RSV 两个自然种群间的致病性差异分析 | 第24-28页 |
| ·两个自然种群在发病率上的差异分析 | 第24-26页 |
| ·两个自然种群在发病时间上的差异分析 | 第26页 |
| ·两个自然种群在症状表现上的差异分析 | 第26页 |
| ·两个自然种群对灰飞虱传毒影响的差异 | 第26-28页 |
| 3 讨论 | 第28-30页 |
| ·致病性评价指标 | 第28-29页 |
| ·致病性分化与病害流行的关系 | 第29页 |
| ·致病性评价与病害防治 | 第29-30页 |
| 第二章 水稻病毒分子变异与种群结构分析 | 第30-59页 |
| 1. 材料与方法 | 第30-31页 |
| ·病毒来源及克隆、测序 | 第30页 |
| ·序列分析 | 第30-31页 |
| 2. 结果与分析 | 第31-56页 |
| ·水稻条纹病毒致病性差异分离物的遗传变异 | 第31-42页 |
| ·RNA1 的遗传变异 | 第32-33页 |
| ·RNA2 的遗传变异 | 第33-35页 |
| ·RNA3 的遗传变异 | 第35-37页 |
| ·RNA4 的遗传变异 | 第37-39页 |
| ·8 个分离物7 个基因遗传多样性分析 | 第39-42页 |
| ·水稻条纹病毒种群结构及遗传多样性分析 | 第42-56页 |
| ·13 个分离物代表的种群结构分析 | 第42-46页 |
| ·RSV 群体遗传结构及遗传多样性分析 | 第46-56页 |
| 3. 讨论 | 第56-59页 |
| ·RSV 与致病性相关的种群遗传变异 | 第56页 |
| ·RSV 种群结构与进化分析 | 第56-59页 |
| 第三章 水稻条纹病毒生物信息学与基因组结构分析 | 第59-96页 |
| 1 材料与方法 | 第59页 |
| ·分析对象 | 第59页 |
| ·分析工具 | 第59页 |
| 2 结果与分析 | 第59-91页 |
| ·基因组末端非编码区序列分析 | 第59-65页 |
| ·RNA1 末端非编码区域序列分析 | 第60页 |
| ·RNA2 末端非编码区域序列分析 | 第60-63页 |
| ·RNA3 末端非编码区域序列分析 | 第63-64页 |
| ·RNA4 末端非编码区域序列分析 | 第64-65页 |
| ·RSV 末端序列的共同性 | 第65页 |
| ·RSV 七个编码蛋白的氨基酸序列分析 | 第65-81页 |
| ·RdRp 氨基酸序列分析 | 第66-71页 |
| ·N52 蛋白氨基酸序列分析 | 第71-72页 |
| ·NSvc2 蛋白序列分析 | 第72-74页 |
| ·N53 蛋白氨基酸序列分析 | 第74-76页 |
| ·CP 蛋白氨基酸序列分析 | 第76-77页 |
| ·SP 蛋白氨基酸序列分析 | 第77-80页 |
| ·NSvc4 蛋白序列分析 | 第80-81页 |
| ·RSV 终止密码子使用分析 | 第81-82页 |
| ·基因间隔区序列分析 | 第82-91页 |
| ·IR2 序列分析 | 第82-86页 |
| ·IR3 序列分析 | 第86-88页 |
| ·IR4 序列分析 | 第88-91页 |
| 3. 讨论 | 第91-96页 |
| ·RSV 基因组结构分析 | 第91页 |
| ·与致病相关的基因组结构变异 | 第91-92页 |
| ·根据生物信息学分析推测RSV 7 个蛋白的功能行使 | 第92-96页 |
| ·RdRp | 第92-93页 |
| ·N52 | 第93-94页 |
| ·NSvc2 | 第94页 |
| ·N53 | 第94页 |
| ·CP | 第94页 |
| ·SP | 第94-95页 |
| ·NSvc4 | 第95-96页 |
| 第四章 水稻条纹病毒RNA 重组与遗传组分分析 | 第96-102页 |
| 1. 材料与方法 | 第96-97页 |
| ·实验材料 | 第96页 |
| ·引物设计 | 第96页 |
| ·RNA 提取及分子克隆 | 第96-97页 |
| ·测序及序列分析 | 第97页 |
| 2. 结果与分析 | 第97-99页 |
| ·RSV 重组RNA | 第97-98页 |
| ·重组RNA 序列分析 | 第98-99页 |
| 3. 讨论 | 第99-102页 |
| ·RNA 重组的可能机制 | 第99-100页 |
| ·重组RNA 对病毒致病性的潜在影响 | 第100页 |
| ·重组RNA 暗示的基因组结构变异 | 第100-102页 |
| 小结 | 第102-103页 |
| 参考文献 | 第103-113页 |
| 附录一 | 第113-120页 |
| 附录二 攻读博士学位期间撰写的论文 | 第120-121页 |
| 致谢 | 第121页 |