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大仓鼠SSR座位的筛选及黑线仓鼠MHC基因的克隆与序列分析

摘要第1-6页
ABSTRACT第6-11页
1.文献综述第11-20页
   ·大仓鼠的研究进展第11-12页
   ·分子标记及微卫星的研究进展第12-13页
   ·黑线仓鼠的研究进展第13页
   ·MHC的研究进展第13-19页
     ·MHC的结构与遗传特征第14-16页
     ·MHC的生物学功能第16-17页
     ·MHC的研究现状第17-19页
   ·本研究的目的和意义第19-20页
2.实验研究第20-60页
   ·研究一 大仓鼠SSR座位的筛选第20-32页
     ·引言第21页
     ·材料与方法第21-25页
       ·实验材料第21页
       ·实验仪器及药品第21-22页
       ·实验菌株第22页
       ·基因组DNA的提取第22页
       ·引物与PCR扩增第22-23页
       ·PCR扩增产物的回收第23-24页
       ·重组子的构建第24页
       ·大肠杆菌DH5α感受态细胞的制备及转化第24-25页
       ·阳性克隆的测序第25页
       ·序列分析与注册第25页
     ·结果与分析第25-30页
       ·基因组DNA的提取结果第25页
       ·引物退火及PCR扩增结果第25-26页
       ·阳性克隆的PCR检测第26-27页
       ·测序波形图第27-28页
       ·大仓鼠微卫星序列第28-30页
     ·讨论第30-32页
       ·实验条件的优化第30-31页
         ·DNA的提取及纯化第30页
         ·利用PCR法筛选微卫星第30页
         ·影响PCR反应的因素及其优化第30-31页
       ·微卫星序列的选取第31页
       ·大仓鼠微卫星序列的分析第31-32页
   ·研究二 黑线仓鼠群体间编码MHC Ⅰ类分子α2结构域基因的克隆与多态性分析第32-51页
     ·引言第33页
     ·材料与方法第33-35页
       ·实验材料第33-34页
       ·实验仪器和药品第34页
       ·基因组DNA的提取第34页
       ·引物设计与PCR扩增第34页
       ·PCR扩增产物的克隆与测序第34页
       ·数据处理和分析第34-35页
     ·结果与分析第35-48页
       ·基因组DNA的提取结果第35页
       ·PCR扩增结果第35页
       ·阳性克隆的PCR检测第35-36页
       ·测序序列与其他物种相应区域的比较第36-38页
       ·三个地理种群MHC Ⅰ类分子α2结构域基因的核苷酸序列第38-40页
       ·三个地理种群MHC Ⅰ类分子α2结构域基因的氨基酸序列第40-43页
       ·三个地理种群间测序结果的比较第43-44页
       ·三个地理种群间测序结果信息含量的统计计算第44-46页
       ·三个地理种群间的单倍型谱系图第46-48页
     ·讨论第48-51页
       ·研究MHC基因与黑线仓鼠的理论和现实意义第48页
       ·黑线仓鼠与其他物种MHC Ⅰ类α2结构域系统进化分析第48-49页
       ·不同地理种群黑线仓鼠核苷酸序列差异性的比较分析第49页
       ·不同地理种群黑线仓鼠氨基酸及蛋白质构象的差异性分析第49-50页
       ·不同地理种群黑线仓鼠遗传分化的比较分析第50-51页
   ·研究三 黑线仓鼠MHC Ⅱ类DQA基因外显子2的克隆与序列分析第51-60页
     ·引言第51-52页
     ·材料与方法第52-53页
       ·实验材料第52页
       ·实验仪器和药品第52页
       ·基因组DNA的提取第52页
       ·引物设计与PCR扩增第52-53页
       ·PCR扩增产物的克隆及回收第53页
       ·重组子的构建第53页
       ·大肠杆菌DH5α感受态细胞的制备及转化第53页
       ·阳性克隆的鉴定与测序第53页
       ·序列的同源性比较和进化分析第53页
     ·结果与分析第53-57页
       ·基因组DNA的提取结果第53-54页
       ·PCR扩增结果第54页
       ·阳性克隆的PCR检测第54-55页
       ·DQA基因外显子2的核苷酸和氨基酸序列的同源性比较第55-56页
       ·黑线仓鼠DQA基因外显子2氨基酸编码的蛋白质结构的预测第56页
       ·黑线仓鼠与人、大鼠、小鼠、猪等DQA基因的系统进化分析第56-57页
     ·讨论第57-59页
       ·特异性引物-XXH1的获得第57-58页
       ·黑线仓鼠与人、大鼠、小鼠等物种DQA基因的系统进化分析第58-59页
     ·结论第59-60页
参考文献第60-68页
读研期间发表的论文第68-69页
致谢第69页

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