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糜子中microRNA的生物信息学预测及实验验证

摘要第1-5页
ABSTRACT第5-9页
第一章 文献综述第9-16页
   ·植物MIRNA 的产生与功能第10-13页
     ·植物miRNA 的基因组织形式和转录第10页
     ·植物miRNA 加工和运输第10页
     ·miRNA 进入RNA 诱导的沉默复合体(RNA-Induced Silencing Complex,RISC)第10-11页
     ·植物中miRNA 的作用机制第11页
     ·植物中miRNA 的功能第11-13页
   ·发现MIRNA 的方法第13-14页
     ·正向遗传学方法第13页
     ·直接克隆法第13页
     ·高通量测序及芯片第13页
     ·生物信息学方法第13-14页
   ·MIRNA 的靶基因研究第14页
     ·生物信息学预测靶基因第14页
     ·靶标的实验验证第14页
   ·MIRNA 的功能鉴定第14页
   ·糜子简介第14-15页
   ·本研究的目的和意义第15-16页
第二章 实验方法第16-25页
   ·数据与软件来源第16页
   ·MICRORNA 在EST 中的同源检索第16页
     ·miRBase 数据第16页
     ·对BLAST 的参数设置第16页
   ·MICRORNA 前体的鉴别第16-17页
     ·前体的长度选择第16页
     ·滑动窗口延伸和推进第16-17页
     ·自由能范围的设定第17页
     ·碱基含量第17页
     ·成熟miRNA 序列的位置第17页
   ·MIRNA 的靶标预测第17-18页
     ·参数选择第17-18页
     ·基因序列第18页
   ·实验材料与试剂第18-21页
     ·植物材料及培养条件第18页
     ·试剂与仪器第18-21页
   ·实验方法第21-25页
     ·糜子总RNA 提取第21-22页
     ·小分子RNA 的分离与转膜第22-23页
     ·预杂交第23页
     ·探针制备第23页
     ·杂交第23页
     ·洗膜第23页
     ·压屏及扫屏第23-24页
     ·脱探针第24-25页
第三章 实验结果与讨论第25-37页
   ·生物信息学预测第25-33页
     ·预测的miRNA第25-29页
     ·miRNA 的靶标第29-33页
   ·实验验证第33-37页
     ·RNA 提取第33-34页
     ·Northern blot 条件的确定第34-35页
     ·预测miRNA 的实验验证第35-37页
第四章 结论与创新点第37-38页
   ·结论第37页
   ·创新点第37-38页
参考文献第38-42页
附录第42-54页
致谢第54-55页
作者简介第55页

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