| 摘要 | 第10-11页 |
| Abstract | 第11页 |
| 第一章 前言 | 第12-19页 |
| 1. 结直肠癌现状 | 第12-13页 |
| 1.1 结直肠癌的发病情况及研究进展 | 第12页 |
| 1.2 结直肠癌与结肠息肉的关系 | 第12页 |
| 1.3 结直肠癌筛查情况 | 第12-13页 |
| 2. 结肠息肉概述 | 第13-16页 |
| 2.1 结肠息肉的临床表现及病理分型 | 第13页 |
| 2.2 结肠息肉可能的相关发病机制 | 第13-14页 |
| 2.3 结肠息肉的检查方法 | 第14-16页 |
| 2.3.1 粪便隐血试验与粪便免疫化学试验 | 第15页 |
| 2.3.2 结肠镜与CT结肠成像技术 | 第15页 |
| 2.3.3 中国结直肠癌筛査情况 | 第15-16页 |
| 3. 肠道微生物与疾病的关系 | 第16-19页 |
| 第二章 材料与方法 | 第19-30页 |
| 1. 研究对象与分组 | 第19页 |
| 2. 纳入和排除标准 | 第19-20页 |
| 2.1 健康人群 | 第19页 |
| 2.2 结肠息肉患者 | 第19-20页 |
| 3. 结肠镜检查 | 第20页 |
| 4. 粪便标本取样及处理 | 第20页 |
| 4.1 取样要求 | 第20页 |
| 4.2 注意事项 | 第20页 |
| 5. 粪便相关微生物总DNA分离、提取与检测 | 第20-22页 |
| 5.1 细菌总DNA分离、提取 | 第20-22页 |
| 5.2 DNA样品检测 | 第22页 |
| 6. 细菌16S rDNA的V4目标片段的扩增、检测和纯化 | 第22-23页 |
| 6.1 细菌16S rDNA的V4目标片段的扩增 | 第22页 |
| 6.2 PCR产物电泳纯化与混样 | 第22-23页 |
| 7. 真菌子ITS2的扩增、检测和纯化 | 第23页 |
| 7.1 真菌18S rRNA的ITS2区扩增 | 第23页 |
| 7.2 PCR产物混样并电泳纯化目的片段 | 第23页 |
| 8. 文库质检与上机测序 | 第23-24页 |
| 8.1 文库检测 | 第23-24页 |
| 8.2 上机测序 | 第24页 |
| 9. 下机数据预处理 | 第24页 |
| 9.1 数据质控 | 第24页 |
| 9.2 数据拆分 | 第24页 |
| 10. 生物信息分析 | 第24-29页 |
| 10.1 Paired_end序列拼接 | 第24-25页 |
| 10.2 Tags去嵌合体序列 | 第25页 |
| 10.3 OTU聚类分析及物种注释 | 第25-26页 |
| 10.4 样品复杂度分析 | 第26-28页 |
| 10.5 样本及物种聚类分析 | 第28页 |
| 10.6 样本间OTU组成相似度分析 | 第28-29页 |
| 10.7 Lefse分析 | 第29页 |
| 10.8 特定物种分类树 | 第29页 |
| 11. ROC曲线分析 | 第29-30页 |
| 第三章 结果 | 第30-54页 |
| 1. 结肠息肉患者和健康人群肠道内细菌群落结构和多样性对比分析 | 第30-41页 |
| 1.1 研究对象的人口数据及临床资料 | 第30-31页 |
| 1.2 数据分析 | 第31-41页 |
| 1.2.1 结肠息肉组和健康对照组样品测序深度分析 | 第31-32页 |
| 1.2.2 结肠息肉组和健康对照组样品多样性分析 | 第32-35页 |
| 1.2.3 结肠息肉组和健康对照组肠道内细菌群落构成的对比分析 | 第35-41页 |
| 2. 结肠息肉患者和健康人群肠道内真菌群落结构和多样性对比分析 | 第41-50页 |
| 2.1.研究对象的人口学数据及临床资料 | 第41-42页 |
| 2.2 数据分析 | 第42-50页 |
| 2.2.1 结肠息肉组和健康对照组样品测序深度分析 | 第42-43页 |
| 2.2.2 结肠息肉组和健康对照组样品多样性分析 | 第43-45页 |
| 2.2.3 结肠息肉组和健康对照组肠道内真菌群落构成对比分析 | 第45-50页 |
| 3. 结肠息肉患者不同病理类型细菌、真菌群落结构和多样性对比分析 | 第50-51页 |
| 4. 单发性和多发性结肠息肉患者肠道内细菌、真菌群落结构和多对比分析 | 第51-53页 |
| 5.差异菌群的有效性检测 | 第53-54页 |
| 第四章 讨论与展望 | 第54-57页 |
| 附录 | 第57-60页 |
| 附录 1 图表索引 | 第57-59页 |
| 附录 2 缩略语及中英文对照 | 第59-60页 |
| 参考文献 | 第60-69页 |
| 致谢 | 第69页 |
