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芜菁花青素合成光不敏感型突变体鉴定及候选基因定位分析

摘要第4-6页
Abstract第6-8页
1 绪论第15-32页
    1.1 引言第15页
    1.2 植物中花青素合成及调控研究第15-21页
        1.2.1 花青素的结构及种类第15-16页
        1.2.2 参与花青素合成的结构基因第16-17页
        1.2.3 花青素合成途径相关调节基因第17-20页
        1.2.4 花青素合成影响因素研究进展第20-21页
    1.3 光信号转导影响植物发育进程的研究进展第21-27页
        1.3.1 光敏色素受体及其介导的红光、远红光信号转导第22-23页
        1.3.2 隐花色素受体及其介导的蓝光信号转导第23-24页
        1.3.3 趋光素受体及其介导的蓝光信号转导第24-25页
        1.3.4 Zeitlupe类受体及其介导的蓝光信号转导第25页
        1.3.5 UV-B受体及其介导的光信号转导第25-26页
        1.3.6 植物光受体介导的花青素合成的研究进展第26-27页
    1.4 MBS (mapping-by-sequencing)研究进展第27-28页
    1.5 HRM技术及其应用第28-30页
        1.5.1 HRM技术的原理第28-29页
        1.5.2 HRM技术的特点第29页
        1.5.3 HRM技术在目标基因定位中的应用第29-30页
    1.6 转录组测序技术的应用第30-31页
    1.7 本研究的目的及意义第31-32页
2 光不敏感型花青素合成突变体的遗传及下游基因表达分析第32-54页
    2.1 引言第32页
    2.2 材料与方法第32-38页
        2.2.1 实验材料第32-33页
        2.2.2 实验条件第33页
        2.2.3 实验试剂与仪器第33页
        2.2.4 实验方法第33-38页
    2.3 结果与分析第38-51页
        2.3.1 野生型津田芜菁生育动态调查第38-39页
        2.3.2 花青素合成相关突变体表型分析第39页
        2.3.3 野生型和突变体花青素含量测定分析第39-41页
        2.3.4 突变体之间的杂交后代表型调查第41页
        2.3.5 突变体与野生型津田芜菁群体F_2的构建及遗传分析第41-46页
        2.3.6 花青素合成途径基因表达分析第46-51页
    2.4 讨论第51-53页
    2.5 本章小结第53-54页
3 花青素缺失突变体g56w和g97w候选突变基因初步定位第54-81页
    3.1 引言第54页
    3.2 材料方法第54-59页
        3.2.1 实验材料第54页
        3.2.2 实验试剂与仪器第54-55页
        3.2.3 实验方法第55-59页
    3.3 结果分析第59-78页
        3.3.1 突变体的F_2群体中突变型后代池和野生型亲本的DNA提取及高通量测序第59-60页
        3.3.2 高通量测序数据质量控制及数据分析第60-66页
        3.3.3 MutMap分析第66-70页
        3.3.4 花青素缺失突变体g56w基因定位第70-73页
        3.3.5 花青素缺失突变体g97w基因定位第73-78页
    3.4 讨论第78-80页
    3.5 本章小结第80-81页
4 花青素缺失突变体g142w的突变基因定位第81-103页
    4.1 引言第81页
    4.2 材料与方法第81-86页
        4.2.1 实验材料第81页
        4.2.2 实验光源第81-83页
        4.2.3 实验试剂与仪器第83页
        4.2.4 实验方法第83-86页
    4.3 结果与分析第86-99页
        4.3.1 不同短波长光质对野生型津田芜菁与突变体g142w的幼苗花青素合成模式分析第86-88页
        4.3.2 HPLC分析野生型津田芜菁与突变体g142w中花青素类化合物组成成分第88-90页
        4.3.3 突变体F_2g142w群体的构建及遗传分析第90页
        4.3.4 高通量测序数据质量控制及数据分析第90-91页
        4.3.5 MutMap分析第91页
        4.3.6 突变候选基因注释第91页
        4.3.7 HRM技术验证候选SNP位点第91-95页
        4.3.8 基于SNP的CAPs标记的开发第95-97页
        4.3.9 筛选鉴定的候选基因功能注释第97页
        4.3.10 候选基因区域转录FPKM表达值(来自转录组RNA-Seq数据)及RT-qPCR分析第97-99页
    4.4 讨论第99-101页
    4.5 本章小结第101-103页
结论第103-104页
参考文献第104-119页
附录第119-120页
攻读学位期间发表的学术论文第120-121页
致谢第121-123页
附件第123-124页

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