| 致谢 | 第5-6页 |
| 摘要 | 第6-7页 |
| ABSTRACT | 第7页 |
| 英文缩略表 | 第13-15页 |
| 1 文献综述 | 第15-25页 |
| 1.1 VIGS技术与应用 | 第15-18页 |
| 1.1.1 VIGS技术的原理 | 第15-16页 |
| 1.1.2 VIGS载体来源 | 第16-17页 |
| 1.1.3 VIGS载体选择标记 | 第17页 |
| 1.1.4 VIGS技术的应用 | 第17-18页 |
| 1.2 盐胁迫对植物的危害 | 第18-19页 |
| 1.2.1 盐胁迫对植物种子萌发的影响 | 第18页 |
| 1.2.2 盐胁迫对植物生长发育的影响 | 第18-19页 |
| 1.2.3 盐胁迫对植物光合作用的影响 | 第19页 |
| 1.3 植物耐盐机理 | 第19-22页 |
| 1.3.1 激素调节 | 第19-20页 |
| 1.3.2 渗透调节 | 第20-21页 |
| 1.3.3 转录因子调节 | 第21-22页 |
| 1.3.4 活性氧的清除 | 第22页 |
| 1.4 基因工程在植物抗盐中的发展 | 第22-23页 |
| 1.5 转录组测序技术 | 第23-25页 |
| 1.5.1 转录组测序技术的发展 | 第23-24页 |
| 1.5.2 二代测序技术的应用 | 第24-25页 |
| 2 引言 | 第25-27页 |
| 2.1 研究目的与意义 | 第25页 |
| 2.2 研究内容 | 第25-26页 |
| 2.3 技术路线 | 第26-27页 |
| 3 材料与方法 | 第27-39页 |
| 3.1 实验材料 | 第27-28页 |
| 3.1.1 菌株及载体 | 第27页 |
| 3.1.2 棉花材料 | 第27页 |
| 3.1.3 实验试剂 | 第27页 |
| 3.1.4 实验仪器 | 第27-28页 |
| 3.1.5 引物及测序 | 第28页 |
| 3.1.6 主要溶液及培养基的配制 | 第28页 |
| 3.2 实验方法 | 第28-39页 |
| 3.2.1 棉花种子萌发率测定 | 第28页 |
| 3.2.2 处理条件的设定 | 第28页 |
| 3.2.3 棉花转录组测序 | 第28-31页 |
| 3.2.4 qRT-PCR分析 | 第31-34页 |
| 3.2.5 VIGS载体的构建 | 第34-38页 |
| 3.2.6 VIGS侵染棉花植株 | 第38-39页 |
| 4 结果与分析 | 第39-70页 |
| 4.1 NaCl与Forskolin处理对棉花种子萌发率的影响 | 第39-40页 |
| 4.2 棉花转录组测序结果分析 | 第40-48页 |
| 4.2.1 原始数据过滤结果 | 第40-42页 |
| 4.2.2 测序质量分布检测 | 第42-44页 |
| 4.2.3 测序错误率分布检查 | 第44-46页 |
| 4.2.4 测序数据质量情况汇总 | 第46-47页 |
| 4.2.5 qRT-PCR结果分析 | 第47-48页 |
| 4.3 差异基因表达分析 | 第48-55页 |
| 4.3.1 显著差异表达基因的筛选 | 第49-52页 |
| 4.3.2 不同时间点差异基因相关性分析 | 第52-53页 |
| 4.3.3 不同处理下差异基因韦恩图分析 | 第53-54页 |
| 4.3.4 不同处理下差异基因热图分析 | 第54-55页 |
| 4.4 差异基因GO富集分析 | 第55-56页 |
| 4.5 差异基因pathway富集分析 | 第56-58页 |
| 4.6 利用基因表达调控网络筛选耐盐相关基因 | 第58-65页 |
| 4.6.1 耐盐相关基因的筛选 | 第58-64页 |
| 4.6.2 耐盐相关基因的功能分析 | 第64-65页 |
| 4.7 VIGS鉴定候选耐盐基因功能 | 第65-70页 |
| 4.7.1 VIGS载体的构建 | 第65-66页 |
| 4.7.2 VIGS菌液侵染棉花幼苗 | 第66-67页 |
| 4.7.3 不同材料中目的基因沉默后的qRT-PCR分析 | 第67-68页 |
| 4.7.4 目的基因沉默植株盐胁迫处理 | 第68-70页 |
| 5 讨论 | 第70-73页 |
| 5.1 Forskolin可以提高棉花种子抵抗盐胁迫的能力 | 第70页 |
| 5.2 Forskolin可以促进耐盐相关基因表达 | 第70-71页 |
| 5.3 利用基因表达调控网络可以快速筛选耐盐相关基因 | 第71-72页 |
| 5.4 耐盐候选基因VIGS鉴定 | 第72-73页 |
| 6 结论 | 第73-74页 |
| 参考文献 | 第74-80页 |
| 作者简介 | 第80页 |
