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杨树富含亮氨酸受体蛋白激酶家族生物信息学分析

摘要第3-4页
ABSTRACT第4页
缩写名词表第8-9页
第一章 文献综述第9-23页
    1.1 植物受体蛋白激酶的结构、分类与功能第9-12页
        1.1.1 植物受体蛋白激酶的结构第9-11页
        1.1.2 植物受体蛋白激酶的分类第11-12页
        1.1.3 受体蛋白激酶的功能第12页
    1.2 富含亮氨酸受体蛋白激酶功能多样性第12-15页
        1.2.1 富含亮氨酸受体蛋白激酶与植物的维管发育和腋芽形成第13-14页
        1.2.2 植物富含亮氨酸受体蛋白激酶与植物的应激防御第14-15页
    1.3 富含亮氨酸受体蛋白激酶的配体研究进展第15-18页
        1.3.1 CLE 多肽激素与富含亮氨酸受体蛋白激酶第15-18页
        1.3.2 甾醇与富含亮氨酸受体蛋白激酶第18页
    1.4 拟南芥与水稻中富含亮氨酸受体蛋白的研究进展概述第18-20页
        1.4.1 基因家族的大小和分类第18-19页
        1.4.2 保守基序以及内含子和外显子组成第19-20页
    1.5 杨树与林木遗传学研究第20-21页
        1.5.1 杨树的遗传背景第20页
        1.5.2 杨树在林木遗传学中的重要性第20-21页
        1.5.3 杨树富含亮氨酸受体家族蛋白激酶研究的重要意义第21页
    1.6 本课题研究目的第21-23页
        1.6.1 阐明杨树富含亮氨酸蛋白激酶家族的大小和分类第21-22页
        1.6.2 注释杨树富含亮氨酸蛋白激酶基因家族的结构特征第22页
        1.6.3 研究基因在染色体上的分布规律第22页
        1.6.4 绘制杨树富含亮氨酸受体蛋白激酶家族的表达特征第22-23页
第二章 杨树富含亮氨酸受体蛋白激酶家族基因的检索和分类第23-34页
    2.1 富含亮氨酸受体蛋白激酶基因的检索第23-24页
        2.1.1 序列检索第23页
        2.1.2 结构域确定第23-24页
    2.2 蛋白理化性质预测第24-26页
        2.2.1 信号肽预测第24-25页
        2.2.2 跨膜区预测第25-26页
        2.2.3 分子量和等电点的预测第26页
    2.3 杨树富含亮氨酸受体蛋白激酶家族基因的进化分类第26-27页
        2.3.1 序列的多重比对第26页
        2.3.2 进化树构建以及分类第26-27页
    2.4 结果与分析第27-34页
        2.4.1 序列检索与候选基因筛选第27页
        2.4.2 杨树富含亮氨酸受体蛋白激酶家族的分类和命名第27-31页
        2.4.3 杨树胞外区以及胞内区域进化树构建结果比较第31-32页
        2.4.4 蛋白理化性质结果第32-34页
第三章 杨树富含亮氨酸受体蛋白激酶家族基因的结构分析第34-45页
    3.1 方法及原理第34-37页
        3.1.1 内含子和外显子组成分析第34-35页
        3.1.2 富含亮氨酸结构域保守基序分析第35-37页
        3.1.3 激酶区的结构分析第37页
    3.2 结果与分析第37-45页
        3.2.1 内含子外显子组成分析结果第37-39页
        3.2.2 富含亮氨酸基序特征第39-41页
        3.2.3 保守基序在不同亚家族的分布第41-42页
        3.2.4 激酶区的保守基序第42-44页
        3.2.5 激酶分类以及 RD 激酶分布第44-45页
第四章 杨树富含亮氨酸受体蛋白激酶家族的进化起源分析第45-51页
    4.1 方法及原理第45-46页
        4.1.1 进化中新的基因功能获得第45页
        4.1.2 片段置换第45-46页
        4.1.3 串联重复第46页
    4.2 结果与分析第46-51页
        4.2.1 基因在染色体上的分布第46-47页
        4.2.2 片段置换第47-49页
        4.2.3 串联重复第49-51页
第五章 杨树富含亮氨酸受体蛋白激酶家族的表达分析第51-60页
    5.1 方法与原理第51-53页
        5.1.1 高通量表达数据的获取和处理方法第51页
        5.1.2 组织特异性表达分析第51-52页
        5.1.3 诱导表达分析第52-53页
    5.2 结果与分析第53-60页
        5.2.1 组织特异性表达结果第53-57页
        5.2.2 诱导特异性表达结果第57-60页
第六章 全文结论与展望第60-62页
    6.1 结论第60-61页
    6.2 展望第61-62页
参考文献第62-68页
发表论文和参加科研情况说明第68-69页
附录一第69-70页
致谢第70页

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