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石灰性紫色水稻土中nirS和nosZ基因对不同施肥处理的响应特征及其垂直分布

摘要第5-8页
ABSTRACT第8-10页
第一章 文献综述第13-29页
    1.1 反硝化作用及其功能微生物第13-14页
        1.1.1 反硝化作用第13页
        1.1.2 反硝化微生物的分类第13-14页
    1.2 反硝化过程相关功能基因及其研究现状第14-19页
        1.2.1 硝酸盐还原酶Nar第14-15页
        1.2.2 亚硝酸盐还原酶Nir第15-17页
        1.2.3 一氧化氮还原酶Nor第17-18页
        1.2.4 一氧化二氮还原酶Nos第18-19页
    1.3 施肥对农田氮素流失影响第19-21页
    1.4 微生物群落垂直分布研究第21-22页
    1.5 反硝化微生物多样性的研究方法第22-26页
        1.5.1 T-RFLP技术第22-23页
        1.5.2 PCR-DGGE技术第23页
        1.5.3 实时荧光定量PCR(Real-Time PCR)第23-24页
        1.5.4 稳定同位素示踪技术第24页
        1.5.5 红基因组学和宏转录组学第24-26页
    1.6 立题依据和研究目的第26-29页
        1.6.1 立题依据第26-27页
        1.6.2 研究目的第27-28页
        1.6.3 研究内容第28页
        1.6.4 技术路线第28-29页
第二章 材料与方法第29-37页
    2.1 实验样地第29页
    2.2 样品的采集与预处理第29-30页
    2.3 土壤理化性质及反硝化酶活测定第30页
    2.4 土壤微生物总DNA提取第30页
    2.5 DGGE分析第30-32页
    2.6 末端限制性片段长度多态性(PCR-TRFLP)分析第32-33页
    2.7 功能基因克隆和测序第33页
    2.8 实时荧光定量PCR分析第33-35页
    2.9 数据分析第35-37页
第三章 结果与分析第37-58页
    3.1 土壤基本理化性质及反硝化酶活第37-39页
    3.2 qPCR结果第39-42页
        3.2.1 16S rRNA的qPCR结果第39-40页
        3.2.2 nirS基因的qPCR结果第40-41页
        3.2.3 nosZ基因的qPCR结果第41-42页
    3.3 nirS基因DGGE结果第42-45页
        3.3.1 nirS基因DGGE图谱分析第42-44页
        3.3.2 nirS基因DGGE群落结构多样性分析第44-45页
    3.4 T-RFLP结果第45-51页
        3.4.1 群落结构多样性分析第45-47页
            3.4.1.1 nirS基因群落结构多样性分析第45-46页
            3.4.1.2 nosZ基因群落结构多样性分析第46-47页
        3.4.2 群落结构堆积图分析第47-51页
            3.4.2.1 nirS基因群落结构堆积图第47-49页
            3.4.2.2 nosZ基因群落结构堆积图第49-51页
    3.5 系统发育树分析第51-55页
        3.5.1 nirS基因系统发育树第51-53页
        3.5.2 nosZ基因系统发育树第53-55页
    3.6 与环境参数的相关分析第55-58页
        3.6.1 nirS基因群落结构与环境参数的RDA分析第55-56页
        3.6.2 nosZ基因群落结构与环境参数的CCA分析第56-58页
第四章 讨论第58-64页
    4.1 长期定位施肥对土壤理化性质的影响第58-59页
    4.2 nirS基因反硝化细菌丰度与群落结构分析第59-61页
    4.3 nosZ基因反硝化细菌丰度与群落结构分析第61-64页
第五章 全文结论与研究建议第64-67页
    5.1 全文结论第64-66页
    5.2 研究建议第66-67页
参考文献第67-77页
致谢第77-78页
攻读学位期间发表论文第78页

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