| 摘要 | 第7-9页 |
| ABSTRACT | 第9-10页 |
| 第一章 文献综述 | 第11-29页 |
| 1 植物miRNA的研究进展 | 第11-23页 |
| 1.1 miRNA的发现和研究方法 | 第11-13页 |
| 1.2 植物miRNA的形成机制 | 第13-16页 |
| 1.3 调控植物miRNA表达的因素 | 第16-17页 |
| 1.4 植物miRNA对靶基因的调控模式 | 第17-19页 |
| 1.5 植物miRNA的生理功能 | 第19-20页 |
| 1.6 植物miRNA的进化和保守性 | 第20-22页 |
| 1.7 植物miRNA靶基因预测和功能研究 | 第22-23页 |
| 2 水稻颖果发育研究进展 | 第23-26页 |
| 2.1 水稻颖果发育的生理变化过程 | 第23页 |
| 2.2 颖果发育中贮藏物质积累和相关酶类 | 第23-24页 |
| 2.3 影响颖果物质贮藏的分子机理研究进展 | 第24-26页 |
| 3 研究目的和意义 | 第26-29页 |
| 第二章 小RNA文库的建立和分析 | 第29-55页 |
| 摘要 | 第29-30页 |
| 1 试验材料 | 第30-31页 |
| 1.1 植物材料 | 第30-31页 |
| 1.2 试剂和引物 | 第31页 |
| 1.3 试剂配制 | 第31页 |
| 2 实验方法 | 第31-36页 |
| 2.1 野生型和突变体的表型鉴定 | 第31-32页 |
| 2.2 RNA提取 | 第32-33页 |
| 2.3 小分子RNA回收及检测 | 第33页 |
| 2.4 小RNA文库的构建 | 第33-35页 |
| 2.5 Solexa 测序 | 第35页 |
| 2.6 小RNA文库数据的处理 | 第35-36页 |
| 3 数据结果和分析 | 第36-53页 |
| 3.1 突变体的表型,生理和基因鉴定 | 第36-40页 |
| 3.2 小RNA文库的构建 | 第40页 |
| 3.3 小RNA文库的生物信息学分析 | 第40-51页 |
| 3.4 部分miRNA的northern blot验证 | 第51页 |
| 3.5 miRNA在白丰B和flo2库中的丰度比较 | 第51-53页 |
| 4 讨论 | 第53-55页 |
| 第三章 小RNA芯片的检测和表达分析 | 第55-75页 |
| 摘要 | 第55-56页 |
| 1 试验材料和方法 | 第56-58页 |
| 1.1 小RNA的提取 | 第56页 |
| 1.2 小RNA芯片探针标记和质控 | 第56页 |
| 1.3 小RNA芯片结果分析 | 第56-57页 |
| 1.4 Northern blot验证小RNA | 第57-58页 |
| 2 数据结果和分析 | 第58-73页 |
| 2.1 颖果发育三个时期芯片表达情况 | 第58-60页 |
| 2.2 新的miRNA在WT/MU芯片中的表达情况 | 第60-61页 |
| 2.3 知miRNA家族在三个时期的变化趋势 | 第61-69页 |
| 2.4 flo2与WT三个时期表达谱的比较 | 第69-71页 |
| 2.5 Northern杂交结果验证 | 第71-72页 |
| 2.6 AGO家族各成员的表达与相关miRNA表达关系 | 第72-73页 |
| 3 讨论 | 第73-75页 |
| 第四章 miRNA靶基因的验证和相关功能分析 | 第75-91页 |
| 摘要 | 第75页 |
| 1 试验材料和方法 | 第75-78页 |
| 1.1 试验材料 | 第75-76页 |
| 1.2 试剂和引物 | 第76页 |
| 1.3 靶基因预测 | 第76页 |
| 1.4 5’RACE验证 | 第76-77页 |
| 1.5 荧光定量PCR验证靶基因的表达水平 | 第77-78页 |
| 2 数据结果和分析 | 第78-86页 |
| 2.1 miRNA的靶基因生物信息学预测 | 第78-83页 |
| 2.2 靶基因剪切点的验证分析 | 第83-84页 |
| 2.3 靶基因的qPCR表达分析 | 第84-86页 |
| 3 讨论 | 第86-91页 |
| 3.1 miRNA的靶基因在颖果发育中的功能 | 第86-88页 |
| 3.2 FLO2与miRNA之间的调控关系 | 第88-91页 |
| 第五章 全文结论 | 第91-95页 |
| 参考文献 | 第95-105页 |
| 附录 | 第105-113页 |
| 1 试剂配制 | 第105-107页 |
| 1.1 植物RNA提取试剂 | 第105-106页 |
| 1.2 变性PAGE胶 | 第106-107页 |
| 2 试验步骤补充 | 第107-108页 |
| 2.1 mRNA纯化 | 第107-108页 |
| 2.2 RT-PCR | 第108页 |
| 3 试验引物 | 第108-113页 |
| 在读期间发表和投稿的论文 | 第113-115页 |
| 致谢 | 第115页 |
