| 创新点摘要 | 第5-6页 |
| 摘要 | 第6-8页 |
| ABSTRACT | 第8-9页 |
| 第1章 绪论 | 第12-29页 |
| 1.1 点源污染和面源污染的概况 | 第12-14页 |
| 1.2 大凌河污染现状 | 第14-17页 |
| 1.2.1 大凌河水质状况描述 | 第14-15页 |
| 1.2.2 大凌河锦州段污染状况 | 第15-16页 |
| 1.2.3 大凌河有机氯农药的污染 | 第16-17页 |
| 1.3 生物评价环境质量的方法 | 第17-20页 |
| 1.4 微生物群落分析技术 | 第20-24页 |
| 1.4.1 传统方法 | 第21-23页 |
| 1.4.2 高通量方法及应用 | 第23-24页 |
| 1.5 研究背景 | 第24-26页 |
| 1.6 研究的必要性和科学意义 | 第26页 |
| 1.7 研究的目的和研究内容 | 第26-29页 |
| 1.7.1 本课题研究的目的 | 第26-27页 |
| 1.7.2 本课题研究内容 | 第27-29页 |
| 第2章 材料与方法 | 第29-48页 |
| 2.1 实验材料 | 第29-32页 |
| 2.1.1 实验样品 | 第29-31页 |
| 2.1.2 试剂和仪器 | 第31-32页 |
| 2.2 实验方法 | 第32-48页 |
| 2.2.1 常用试剂及配方 | 第32-33页 |
| 2.2.2 样品理化因素的测定 | 第33页 |
| 2.2.3 DNA的提取 | 第33-34页 |
| 2.2.4 变性梯度凝胶电泳(DGGE) | 第34-39页 |
| 2.2.5 DGGE片段的克隆测序 | 第39-40页 |
| 2.2.6 高通量测序流程 | 第40-42页 |
| 2.2.7 高通量测序数据处理 | 第42-44页 |
| 2.2.8 统计学分析 | 第44-47页 |
| 2.2.9 实验分析流程 | 第47-48页 |
| 第3章 造纸污染对周围土壤和大凌河微生物的影响 | 第48-81页 |
| 3.1 造纸污染对周围土壤微生物的影响 | 第48-54页 |
| 3.1.1 土壤细菌群落的相似性分析 | 第49-50页 |
| 3.1.2 土壤中细菌群落的距离衰减关系研究 | 第50-51页 |
| 3.1.3 影响土壤中微生物群落结构的因素分析 | 第51-54页 |
| 3.2 造纸污染对大凌河水样微生物群落的影响 | 第54-63页 |
| 3.2.1 大凌河锦州段水体中微生物群落结构研究 | 第54-57页 |
| 3.2.2 洪水影响大凌河水样微生物群落结构的因素 | 第57-60页 |
| 3.2.3 大凌河水中的微生物演替 | 第60-63页 |
| 3.3 造纸厂排污口污染对大凌河底泥微生物群落的影响 | 第63-79页 |
| 3.3.1 造纸污染造成的硫污染 | 第63-64页 |
| 3.3.2 DGGE研究大凌河表层底泥微生物群落结构 | 第64-68页 |
| 3.3.3 高通量技术研究大凌河表层底泥微生物群落结构 | 第68-78页 |
| 3.3.4 底泥样品中的微生物演替 | 第78-79页 |
| 3.4 小结 | 第79-81页 |
| 第4章 农药污染对大凌河微生物群落的影响 | 第81-102页 |
| 4.1 大凌河流域主要的农业污染物HCHs和DDTs | 第81-82页 |
| 4.2 对表层底泥中微生物群落影响的有机氯农药分析 | 第82-86页 |
| 4.2.1 大凌河表层底泥微生物群落对农业污染的响应 | 第83-84页 |
| 4.2.2 HCHs和DDTs污染对大凌河表层底泥微生物群落多样性的影响 | 第84-86页 |
| 4.3 HCHs和DDTs污染的历史沉积对河口底泥土壤微生物群落的影响 | 第86-99页 |
| 4.3.1 沉积柱样品高通量测序的信息与质量控制 | 第89-91页 |
| 4.3.2 50年底泥沉积柱状样品中微生物的分布 | 第91-92页 |
| 4.3.3 50年底泥沉积柱状样品中微生物群落结构的分析 | 第92-94页 |
| 4.3.4 50年底泥沉积DDTs和HCHs对河口底泥中微生物多态性的影响 | 第94-98页 |
| 4.3.5 环境因素和空间距离对底泥微生物群落的影响 | 第98-99页 |
| 4.4 小结 | 第99-102页 |
| 第5章 指示微生物对大凌河点源污染治理的监测作用 | 第102-111页 |
| 5.1 人工湿地处理造纸污水的研究 | 第102-106页 |
| 5.2 大凌河造纸污染的治理效果监测 | 第106-107页 |
| 5.3 对造纸污染治理具有指示作用的微生物 | 第107-109页 |
| 5.4 造纸和农药污染对大凌河表层底泥微生物群落变化的解释作用 | 第109-110页 |
| 5.5 小结 | 第110-111页 |
| 第6章 研究环境微生物生态评估和污染解析的关键技术 | 第111-127页 |
| 6.1 关于有效进行微生物多样性指数分析所需的高通量测序数 | 第111-114页 |
| 6.2 以微生物群落中优势微生物多样性指数评价环境影响的探索 | 第114-116页 |
| 6.2.1 优势微生物丰度的确定 | 第114-115页 |
| 6.2.2 优势微生物多样性评价环境的可靠性验证 | 第115-116页 |
| 6.3 污染物特异性诱导微生物的筛选分析 | 第116-123页 |
| 6.3.1 微生物群落分析时的最小功能单位 | 第116-120页 |
| 6.3.2 以属为功能单位分析表层底泥和沉积柱响应HCHs和DDTs的微生物差异 | 第120-123页 |
| 6.4 基于共存微生物间进化距离对环境污染的评估 | 第123-125页 |
| 6.5 用共存微生物间进化距离相关性评估点源与面源污染的方法 | 第125-126页 |
| 6.6 小结 | 第126-127页 |
| 第7章 结论和展望 | 第127-130页 |
| 7.1 结论 | 第127-128页 |
| 7.2 展望 | 第128-130页 |
| 参考文献 | 第130-145页 |
| 攻读学位期间公开发表论文 | 第145-146页 |
| 致谢 | 第146-147页 |
| 作者简介 | 第147页 |
