菊花表型性状与SSR、SCoT分子标记的关联分析
摘要 | 第4-6页 |
ABSTRACT | 第6-7页 |
1 文献综述 | 第11-19页 |
1.1 菊花育种现状以及存在的问题 | 第11-12页 |
1.1.1 菊花的简介 | 第11-12页 |
1.2 菊花的传统育种 | 第12-14页 |
1.2.1 引种 | 第12页 |
1.2.2 杂交育种 | 第12-13页 |
1.2.3 芽变育种 | 第13页 |
1.2.4 组织培养育种 | 第13页 |
1.2.5 辐射育种 | 第13-14页 |
1.3 菊花的现代育种 | 第14-15页 |
1.3.1 细胞工程育种 | 第14页 |
1.3.2 基因工程育种 | 第14页 |
1.3.3 分子标记辅助育种 | 第14-15页 |
1.4 关联分析 | 第15-18页 |
1.4.1 SSR分子标记 | 第17页 |
1.4.2 SCoT分子标记 | 第17-18页 |
1.5 本研究的目的及意义 | 第18-19页 |
2 SSR引物开发 | 第19-27页 |
2.1 材料方法 | 第19-23页 |
2.1.1 实验材料 | 第19页 |
2.1.2 实验方法 | 第19-23页 |
2.2 结果 | 第23-26页 |
2.2.1 扩增条件优化 | 第23页 |
2.2.2 SSR引物筛选 | 第23-25页 |
2.2.3 菊花SSR引物遗传多样性 | 第25-26页 |
2.3 讨论 | 第26页 |
2.4 小结 | 第26-27页 |
3 基于SSR引物的关联分析 | 第27-41页 |
3.1 材料与方法 | 第27-28页 |
3.1.1 实验材料 | 第27页 |
3.1.2 实验方法 | 第27-28页 |
3.2 数据处理 | 第28-29页 |
3.2.1 表型数据处理 | 第28-29页 |
3.2.2 SSR标记条带统计及处理 | 第29页 |
3.2.3 群体结构分析 | 第29页 |
3.2.4 LD衡量与关联分析 | 第29页 |
3.3 结果 | 第29-37页 |
3.3.1 菊花品种表型性状的变异分析 | 第29-31页 |
3.3.2 表型性状的主成分分析 | 第31-32页 |
3.3.3 SSR聚类分析 | 第32-34页 |
3.3.4 群体结构分析 | 第34-35页 |
3.3.5 连锁不平衡分析 | 第35-36页 |
3.3.6 数量性状与SSR标记的关联分析 | 第36-37页 |
3.4 讨论 | 第37-40页 |
3.4.1 实验材料的选择 | 第37-38页 |
3.4.2 菊花表型分析 | 第38-39页 |
3.4.3 对分子标记的选择 | 第39页 |
3.4.4 基于SSR标记的群体结构 | 第39页 |
3.4.5 SSR标记的数量性状的关联分析 | 第39-40页 |
3.5 小结 | 第40-41页 |
4 基于SCoT引物的关联分析 | 第41-53页 |
4.1 材料与方法 | 第41-42页 |
4.1.1 实验材料 | 第41页 |
4.1.2 实验方法 | 第41-42页 |
4.2 数据处理 | 第42-43页 |
4.2.1 对表型数据处理 | 第42页 |
4.2.2 SCoT标记条带统计及处理 | 第42页 |
4.2.3 SCoT标记群体结构分析 | 第42-43页 |
4.2.4 LD衡量与关联分析 | 第43页 |
4.3 结果 | 第43-50页 |
4.3.1 表型性状的变异分析 | 第43页 |
4.3.2 主成分分析 | 第43页 |
4.3.3 SCoT标记分析 | 第43-45页 |
4.3.4 SCoT标记UPGMA聚类分析 | 第45-46页 |
4.3.5 SCoT标记的群体结构分析 | 第46-47页 |
4.3.6 连锁不平衡分析 | 第47-48页 |
4.3.7 数量性状与SCo T标记的关联分析 | 第48-50页 |
4.4 讨论 | 第50-51页 |
4.4.1 分子标记的选择 | 第50页 |
4.4.2 基于SCoT标记的群体结构分析 | 第50-51页 |
4.4.3 SCoT标记的数量性状的关联分析 | 第51页 |
4.5 小结 | 第51-53页 |
5 结论 | 第53-55页 |
参考文献 | 第55-61页 |
致谢 | 第61-63页 |
攻读学位期间发表的学术论文目录 | 第63-64页 |