| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-7页 |
| 1 绪论 | 第10-19页 |
| 1.1 研究背景及意义 | 第10-11页 |
| 1.1.1 研究背景 | 第10页 |
| 1.1.2 研究意义 | 第10-11页 |
| 1.2 微生物多样性研究进展 | 第11-15页 |
| 1.2.1 微生物多样性的定义 | 第11页 |
| 1.2.2 传统微生物多样性研究 | 第11-12页 |
| 1.2.3 生物标记物方法 | 第12-13页 |
| 1.2.4 分子生物学在微生物多样性中的研究 | 第13-15页 |
| 1.3 高通量测序技术的发展 | 第15-17页 |
| 1.3.1 测序技术的发展 | 第15-16页 |
| 1.3.2 Illumina高通量测序平台 | 第16-17页 |
| 1.4 研究内容和技术路线图 | 第17-19页 |
| 1.4.1 研究内容 | 第17-18页 |
| 1.4.2 技术路线图 | 第18-19页 |
| 2 鄱阳湖概述和样点选择 | 第19-22页 |
| 2.1 鄱阳湖概述 | 第19页 |
| 2.2 河湖交错带的概念和特点 | 第19-20页 |
| 2.3 采样点选择 | 第20-22页 |
| 3 鄱阳湖河湖交错带水质指标分析 | 第22-29页 |
| 3.1 水质分析方法 | 第22-23页 |
| 3.1.1 总氮的测定 | 第22-23页 |
| 3.1.2 总磷的测定 | 第23页 |
| 3.2 水质指标结果分析 | 第23-25页 |
| 3.2.1 水温、p H值和电导率指数 | 第23-24页 |
| 3.2.2 总氮和总磷 | 第24-25页 |
| 3.3 水质参数的相关分析 | 第25-26页 |
| 3.4 水质指标的主成分分析 | 第26-27页 |
| 3.5 本章小结 | 第27-29页 |
| 4 鄱阳湖河湖交错带表层水体微生物微生物群落结构及多样性分析 | 第29-39页 |
| 4.1 高通量测序原理与步骤 | 第29页 |
| 4.1.1 高通量测序的原理 | 第29页 |
| 4.2 高通量测序步骤 | 第29-31页 |
| 4.2.1 DNA的提取 | 第29-30页 |
| 4.2.2 PCR扩增 | 第30页 |
| 4.2.3 荧光定量 | 第30页 |
| 4.2.4 Illumina平台文库构建 | 第30页 |
| 4.2.5 Illumina平台测序 | 第30-31页 |
| 4.3 高通量结果分析 | 第31-38页 |
| 4.3.1 有效序列分析 | 第31页 |
| 4.3.2 OTU生成及比较 | 第31-32页 |
| 4.3.3 稀释性曲线 | 第32-33页 |
| 4.3.4 微生物群落多样性分析 | 第33页 |
| 4.3.5 门水平上细菌群落结构分析 | 第33-35页 |
| 4.3.6 属水平上细菌群落结构分析 | 第35-36页 |
| 4.3.7 种水平上细菌群落结构分析 | 第36-37页 |
| 4.3.8 细菌群落的多样本相似性聚类分析 | 第37-38页 |
| 4.4 本章小结 | 第38-39页 |
| 5 细菌群落与环境因子的关系 | 第39-40页 |
| 结论与展望 | 第40-42页 |
| 结论 | 第40-41页 |
| 展望 | 第41-42页 |
| 参考文献 | 第42-45页 |
| 致谢 | 第45-46页 |
| 在读期间公开发表论文（著）及科研情况 | 第46页 |