基于微卫星分子标记的箭竹物种复合体的遗传多样性研究
| 摘要 | 第3-5页 |
| Abstract | 第5-6页 |
| 第1章 前言 | 第10-24页 |
| 1.1 箭竹属的研究背景 | 第10-16页 |
| 1.1.1 箭竹属的分类 | 第10-11页 |
| 1.1.2 箭竹物种复合体 | 第11-16页 |
| 1.2 遗传多样性与遗传结构 | 第16-17页 |
| 1.2.1 遗传多样性 | 第16页 |
| 1.2.2 遗传结构 | 第16-17页 |
| 1.2.3 植物遗传多样性的研究方法 | 第17页 |
| 1.3 遗传多样性和遗传分化的基本参数 | 第17-18页 |
| 1.4 SSR分子标记 | 第18-22页 |
| 1.4.1 SSR分子标记的相关概念及原理 | 第18-19页 |
| 1.4.2 SSR分子标记开发方法 | 第19-20页 |
| 1.4.3 SSR标记的特点及应用 | 第20-21页 |
| 1.4.4 SSR分子标记在竹类植物中的应用 | 第21-22页 |
| 1.5 研究目的与意义 | 第22-24页 |
| 第2章 材料与方法 | 第24-42页 |
| 2.1 微卫星序列筛选 | 第24-26页 |
| 2.1.2 序列组装 | 第24页 |
| 2.1.3 微卫星位点的查找与引物设计 | 第24-26页 |
| 2.2 材料与方法 | 第26-34页 |
| 2.2.1 DNA样品采集 | 第26-28页 |
| 2.2.2 试剂与仪器 | 第28-34页 |
| 2.3 总DNA提取与PCR扩增 | 第34-36页 |
| 2.3.1 总DNA的提取 | 第34页 |
| 2.3.2 DNA的质量检测 | 第34-35页 |
| 2.3.3 PCR引物的合成 | 第35页 |
| 2.3.4 PCR扩增 | 第35-36页 |
| 2.4 数据分析 | 第36-42页 |
| 2.4.1 数据整理 | 第36页 |
| 2.4.2 哈迪-温伯格平衡检测 | 第36页 |
| 2.4.3 连锁不平衡分析 | 第36页 |
| 2.4.4 遗传多样性参数计算 | 第36-38页 |
| 2.4.5 居群遗传分化分析 | 第38-39页 |
| 2.4.6 居群遗传结构分析 | 第39-40页 |
| 2.4.7 空间遗传结构分析 | 第40-42页 |
| 第3章 结果 | 第42-80页 |
| 3.1 箭竹复合体居群水平的哈迪温-伯格平衡 | 第42-45页 |
| 3.2 微卫星序列的连锁不平衡检测 | 第45-46页 |
| 3.3 箭竹物种复合体遗传多样性的结果 | 第46-49页 |
| 3.4 遗传距离和遗传一致性 | 第49-59页 |
| 3.5 微卫星水平的遗传多样性 | 第59-60页 |
| 3.6 箭竹物种复合体遗传结构分析 | 第60-69页 |
| 3.6.1 系统聚类分析 | 第60-61页 |
| 3.6.2 主坐标分析 | 第61-63页 |
| 3.6.3 贝叶斯遗传结构聚类分析 | 第63-69页 |
| 3.7 分子方差分析 | 第69-70页 |
| 3.8 箭竹物种复合体形态学性状演化分析 | 第70-73页 |
| 3.9 箭竹物种复合体群体动态历史 | 第73-80页 |
| 3.9.1 地理隔离效应(IBD)检测 | 第73-75页 |
| 3.9.2 瓶颈效应的检测 | 第75-80页 |
| 第4章 讨论 | 第80-86页 |
| 4.1 微卫星位点遗传多样性 | 第80页 |
| 4.2 箭竹物种复合体遗传多样性 | 第80-82页 |
| 4.3 箭竹物种复合体的遗传结构分析 | 第82-83页 |
| 4.4 箭竹物种复合体物种重新划分 | 第83-86页 |
| 参考文献 | 第86-96页 |
| 致谢 | 第96页 |
