| 摘要 | 第4-6页 |
| Abstract | 第6-7页 |
| 第1章 绪论 | 第10-15页 |
| 1.1 课题选择依据 | 第10页 |
| 1.2 研究背景以及国内外现状 | 第10-13页 |
| 1.2.1 miRNA 传统研究方向 | 第11页 |
| 1.2.2 miRNA 的跨物种调控机制研究 | 第11-12页 |
| 1.2.3 植物 miRNA-动物跨物种研究中的不足 | 第12-13页 |
| 1.3 本文研究的目的与意义 | 第13页 |
| 1.4 本文的设计思路及内容组织 | 第13-15页 |
| 1.4.1 本文设计思路的创新之处 | 第13页 |
| 1.4.2 本文的内容组织安排 | 第13-15页 |
| 第2章 miRNA 跨物种调控研究相关知识介绍 | 第15-27页 |
| 2.1 miRNA 相关知识介绍 | 第15-18页 |
| 2.1.1 动物 miRNA 的特征及产生过程 | 第15-17页 |
| 2.1.2 植物 miRNA 的特征及产生过程 | 第17-18页 |
| 2.1.3 动物植物 miRNA 相同点 | 第18页 |
| 2.1.4 动物植物 miRNA 不同点 | 第18页 |
| 2.2 传统的 miRNA 的跨物种调控机制 | 第18-19页 |
| 2.3 植物 miRNA-动物的跨物种调控机制 | 第19-22页 |
| 2.4 miRNA 相关数据库 | 第22-23页 |
| 2.4.1 miRBase 数据库 | 第22页 |
| 2.4.2 PMRD 数据库 | 第22-23页 |
| 2.5 模式生物拟南芥的选取 | 第23-25页 |
| 2.5.1 经典的模式生物 | 第23-24页 |
| 2.5.2 拟南芥作为模式生物的特点 | 第24-25页 |
| 2.6 序列比对算法 | 第25-27页 |
| 2.6.1 两两比对算法 | 第25页 |
| 2.6.2 BLAST 算法 | 第25-27页 |
| 第3章 植物外源性 miRNA 序列特征分析 | 第27-44页 |
| 3.1 总体流程设计 | 第27-28页 |
| 3.2 前期 miRNA 数据准备 | 第28-30页 |
| 3.2.1 植物外源性 miRNA 数据的收集 | 第28-29页 |
| 3.2.2 拟南芥 miRNA 数据的收集 | 第29-30页 |
| 3.3 miRNA 数据预处理 | 第30-32页 |
| 3.3.1 miRNA 去除相同家族数据 | 第30-31页 |
| 3.3.2 miRNA 数据长度补齐 | 第31-32页 |
| 3.4 植物外源性 miRNA 的序列保守性分析 | 第32-36页 |
| 3.4.1 数据经 Weblogo 结果 | 第33-34页 |
| 3.4.2 特定碱基位点含量统计及分析 | 第34-36页 |
| 3.5 植物外源性 miRNA 的碱基含量分析 | 第36-43页 |
| 3.5.1 单条 miRNA 碱基含量计算 | 第36-38页 |
| 3.5.2 miRNA 碱基含量区间统计 | 第38-41页 |
| 3.5.3 miRNA 碱基含量的 T 检验 | 第41-43页 |
| 3.6 本章小结 | 第43-44页 |
| 第4章 植物外源性 miRNA 与人类 miRNA 序列相似性比较 | 第44-54页 |
| 4.1 总体流程设计 | 第44-45页 |
| 4.2 前期数据准备 | 第45-46页 |
| 4.2.1 植物外源性 miRNA 数据准备 | 第45页 |
| 4.2.2 人体 miRNA 的数据准备 | 第45-46页 |
| 4.3 人类 miRNA 数据处理 | 第46-48页 |
| 4.4 相似性比较实验流程和结果 | 第48-53页 |
| 4.4.1 Blast 作为比较软件的使用 | 第48-49页 |
| 4.4.2 数据的比较结果和整理 | 第49-52页 |
| 4.4.3 比较结果的分析 | 第52-53页 |
| 4.5 本章小结 | 第53-54页 |
| 第5章 总结和展望 | 第54-56页 |
| 参考文献 | 第56-60页 |
| 致谢 | 第60页 |