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对拟南芥自身免疫反应、氧化还原敏感蛋白以及mART活性的研究

摘要第6-9页
Abstract第9-12页
第一章 前言第13-29页
    1.1 拟南芥nudt6-2nudt7-1双突变体的自身免疫反应第13-21页
        1.1.1 植物的免疫系统第13-16页
        1.1.2 植物中一氧化氮的产生第16-17页
        1.1.3 一氧化氮在抗病反应中的上游和下游信号传导第17-19页
        1.1.4 本研究的背景和意义第19-21页
    1.2 用蛋白质组学技术发掘对氧化还原敏感的蛋白质第21-26页
        1.2.1 植物细胞中ROS的产生和清除第21-22页
        1.2.2 ROS的信号分子作用第22-23页
        1.2.3 研究氧化还原敏感蛋白质的技术进展第23-24页
        1.2.4 本实验中鉴定氧化还原敏感蛋白质的策略第24-26页
    1.3 拟南芥中内源mART活性催化蛋白质单二磷酸腺苷核糖化修饰第26-29页
        1.3.1 mARTs和单二磷酸腺苷核糖化第26-27页
        1.3.2 单二磷酸腺苷核糖化对底物蛋白质的调控第27-29页
第二章 材料和方法第29-43页
    2.1 拟南芥nudt6-2nudt7-1双突变体的自身免疫反应第29-35页
        2.1.1 植物材料、菌株及质粒载体第29页
        2.1.2 拟南芥在土壤中的生长条件第29页
        2.1.3 拟南芥在固体培养基和液体培养基中的生长条件第29-31页
        2.1.4 丁香假单孢菌的培养第31-32页
        2.1.5 提取基因组DNA(2XCTAB法)第32页
        2.1.6 抽提RNA第32页
        2.1.7 反转录第32-33页
        2.1.8 实时荧光定量PCR(Real-time PCR)第33页
        2.1.9 DAB染色法检测叶片中过氧化氢的含量第33-34页
        2.1.10 Trypan Blue染色法检测叶片中的死细胞第34页
        2.1.11 农杆菌C58C01感受态的热激转化第34页
        2.1.12 用农杆菌侵染法转化拟南芥第34-35页
        2.1.13 叶绿素含量的测定第35页
        2.1.14 植物体内病原菌生长计数实验第35页
        2.1.15 一氧化氮水平的测定第35页
    2.2 用蛋白质组学技术发掘对氧化还原敏感的蛋白质第35-41页
        2.2.1 实验材料第36页
        2.2.2 T87悬浮细胞的培养和过氧化氢处理第36页
        2.2.3 蛋白质的提取和标记第36-37页
        2.2.4 双向电泳第37-38页
        2.2.5 蛋白质图像扫描第38页
        2.2.6 第二向胶的图像分析第38页
        2.2.7 对蛋白质点的质谱分析第38页
        2.2.8 蛋白质数据库搜索第38-39页
        2.2.9 巯基差异标记-免疫沉淀-Western印记偶联法验证蛋白质在体内的氧化还原状态第39-40页
        2.2.10 尿素聚丙烯酰胺凝胶电泳第40-41页
        2.2.11 蛋白质泳动率迁移法分析AtCIAPIN1在体内的氧化还原状态第41页
    2.3 拟南芥中内源mART活性催化蛋白质单二磷酸腺苷核糖化修饰第41-43页
        2.3.1 实验材料第41页
        2.3.2 拟南芥的生长和氧化胁迫处理第41页
        2.3.3 二磷酸腺苷核糖化反应第41-42页
        2.3.4 竞争实验第42页
        2.3.5 测试蛋白质和ADP-ribose基团之间共价键的化学稳定性第42页
        2.3.6 AtPARP2的原核表达和活性测试第42-43页
第三章 结果与讨论第43-80页
    3.1 拟南芥nudt6-2nudt7-1双突变体的自身免疫反应第43-61页
        3.1.1 AtNUDT6和AtNUDT7共同负调控植物的抗病反应第43-45页
        3.1.2 在nudt6-2nudt7-1双突变体中,细胞的延伸和分裂受到温度的调控第45-48页
        3.1.3 在nudt6-2nudt7-1双突变体中,自身免疫反应受到温度的调控第48-49页
        3.1.4 nudt6-2nudt7-1的自身免疫反应部分由SNC1介导,并完全依赖于EDS1第49-52页
        3.1.5 AtNUDT6和AtNUDT7影响了EDS1的亚细胞分布和超敏反应第52-54页
        3.1.6 rudt6-2nudt7-1的表型可以被nahG部分阻断,但是不受npr1突变的影响第54-55页
        3.1.7 在培养基中,nudt6-2nudt7-1的生长受NO_3~-和NH_4~+的比例控制第55-56页
        3.1.8 nudt6-2nudt7-1的自身免疫反应受NO_3~-和NH_4~+的比例控制第56-58页
        3.1.9 小结与展望第58-61页
    3.2 用蛋白质组学技术发掘对氧化还原敏感的蛋白质第61-73页
        3.2.1 确定对拟南芥细胞进行氧化胁迫的实验条件第61-62页
        3.2.2 检测和鉴定在拟南芥细胞中含有巯基的对过氧化氢敏感的蛋白质第62-64页
        3.2.3 巯基差异标记-免疫沉淀-Western印记偶联法验证蛋白质在植物体内的氧化还原状态第64-66页
        3.2.4 在受到Flg22或者SA处理的植物中,AtCIAPIN1发生了氧化第66-68页
        3.2.5 氧化还原敏感蛋白质的分类第68-72页
        3.2.6 四种蛋白质组学方法是互为补充的关系第72页
        3.2.7 小结第72-73页
    3.3 拟南芥中内源mART活性催化蛋白质单二磷酸腺苷核糖化修饰第73-80页
        3.3.1 在拟南芥叶片蛋白抽提液中检测受到单二磷酸腺苷核糖化修饰的蛋白质第73-74页
        3.3.2 在蛋白质的标记反应中核苷酸衍生物对[~(32)P]NAD~+的竞争作用第74-76页
        3.3.3 32 kDa底物蛋白中受到单二磷酸腺苷核糖化修饰的残基是一个半胱氨酸第76页
        3.3.4 拟南芥中的单二磷酸腺苷核糖化修饰具有组织特异性,并受到氧化胁迫的诱导第76-78页
        3.3.5 对实验结果的讨论和小结第78-80页
参考文献第80-98页
附录 本研究鉴定的氧化还原敏感蛋白质第98-102页
致谢第102-104页
在读期间发表论文和书籍第104-105页
    论文第104页
    书籍第104-105页

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