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非洲新稻(NERICA-L)群体遗传构成解析

摘要第8-9页
Abstract第9-10页
第一章 前言第11-21页
    1.1 非洲水稻种植历史与稻作研究第11-13页
        1.1.1 非洲水稻的重要性第11页
        1.1.2 非洲栽培稻的栽培方式与育种历史第11-12页
        1.1.3 非洲水稻生产面临的挑战第12-13页
    1.2 非洲新稻的选育与意义第13-15页
        1.2.1 什么是非洲新稻第13-14页
        1.2.2 非洲新稻的农艺性状特点第14-15页
    1.3 非洲新稻抗病虫与非生物胁迫抗性研究第15-17页
        1.3.1 非洲新稻抗病虫研究第15-16页
        1.3.2 非洲新稻耐干旱研究第16页
        1.3.3 非洲栽培稻耐涝研究第16-17页
    1.4 基因组测序在作物群体遗传演化与功能基因发掘中的应用第17-21页
        1.4.1 基因组测序的发展第17-18页
        1.4.2 SNP标记开发及基因型分析方法第18-19页
        1.4.3 高通量测序与作物群体遗传演化研究第19-21页
第二章 材料与方法第21-28页
    2.1 研究材料第21页
        2.1.1 研究样本第21页
        2.1.2 栽培与管理第21页
    2.2 研究方法第21-28页
        2.2.1 试验材料样本的基因组DNA提取第21-23页
        2.2.2 试材样本的GoldenGate基因芯片检测第23页
        2.2.3 群体样本的主成分分析与系统进化分析第23页
        2.2.4 群体样本的遗传多样性与分化系数分析第23-24页
        2.2.5 非洲新稻样本的简化基因组测序第24页
        2.2.6 基于简化基因组测序分析非洲新稻的血缘模式分析第24-25页
        2.2.7 非洲新稻农艺性状及耐低氧萌发性的调查第25-27页
        2.2.8 非洲新稻重要农艺性状的遗传分析第27-28页
第三章 结果与分析第28-49页
    3.1 非洲新稻(NERICA-L)的系统进化地位第28-36页
        3.1.1 样本768个W-core SNP的分型结果第28页
        3.1.2 群体样本基于768个W-core SNP的主成分分析与系统进化第28-30页
        3.1.3 群体样本基于768个W-core SNP的遗传多样性与群体分化分析第30-31页
        3.1.4 基于简化基因组测序(SLAF-seq)的SNP检测第31-33页
        3.1.5 非洲新稻血缘模式分析第33-36页
    3.2 非洲新稻的各农艺性状调查与分析第36-49页
        3.2.1 非洲新稻各产量相关性状的调查第36-42页
        3.2.2 非洲新稻耐低氧萌发调查第42-47页
        3.2.3 非洲新稻2个农艺性状的单标记分析第47-49页
第四章 讨论与结论第49-52页
    4.1 讨论第49-51页
        4.1.1 非洲新稻血缘模式与农艺性状遗传解析的重要意义第49页
        4.1.2 非洲新稻在我国水稻遗传改良中的应用价值第49-50页
        4.1.3 耐低氧萌发研究对非洲水稻发展的意义第50页
        4.1.4 第三代技术在非洲新稻群体研究意义第50-51页
    4.2 结论第51-52页
参考文献第52-58页
附录第58-65页
致谢第65-66页

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